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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bhi02g01835 TCAAACTAGGAGGACCAAAACGCTATTTTAACCATTTTTCTTAAAAGGCTATGGGTATATATATGTATTTGTTATCTATTTACTTTTGGCATTGCGTTATTTAAATAATAACCAAACCCGCGAAAAAAGAATGGAACTCGCCGGTGCTCAGCTCTGGTCCGGTATTTTCGAGGCTCAAAAACCATTGCAAAGTCATAATCCGAGAGCTTCAAGTTGCCAGGATTTTTGGGATTGCATTGTCTGTTATGTTAGTAAGAGGTTAATTAAGAGGTGTTAAAGCAGAAAATGGCGGATAAGAAAGGAATGGAACAACTTGTTTTACGAATTTTGGAAGGTGAAGAAGGAGTTGACACAAGTAAAGATCTCACTAAACCCTCTGTTTCTTCTTTTCCTGATTTTGACCTAAAAGAAACTCGGAGTTTTAGGTGCACAATTCCGCAATCCGTGGTTGGGAGTTCTCCTTCACATGAGATTTCCAGAATGTCTCCCCTTAAACCTCCAAAAATTCCAGGCGAAACGGCGATTCGACGCCCATCATTTGCTCGTTCGTCGTTTTCAAAGCCAAAATCGAGGTTAATAGAGTCTCCTTGTCCTGATAGTGCAAGTTTAGCAGAAGAAAAGGCTAAAGCAAAATCAACATTGTATAGCTCTCCTAAGATGGACTCCCCAGCTAAGATAACCACTGTGACTAGTCCTAAAGAAGCTTTGAAGTCGGCTCCGATAACTCCGAAAACACCATTGATTGGAACTACTGGAAGTGAGGAGGAAGATGATGAAGAAGTTTACAAAACTGCAGAACTGAAAGTGAAAGAAAGATCAGGGAAGAAATTGAAAAGAACAGTTTTAATTGAATGGGTTGCATTTTTGTGCTTAACAGGTTGTTTAATTGCTAGCTTAACAATAGACAAGTTGGTGACTAAAGAGATATGGGGATTAGGACTCTGGAAATGGTGTGTTCTGGTGTTAGTTAGTTTCTGCGGTCGTTTGTTTTCGCAATGGTTTATCAATTGCCTGGTTTTCTTGATTGAAAGAAACTTTCTACTTAAAAGAAAGGTTCTTTATTTTGTCTATGGTCTGAGGAAGAGTGTTATCATTTTTATTTGGCTGGGTTTGGTTCTCCTAGCCTGGGGTCTATTATTTGATCAAAGCAGCAAGAGATCTAAGAAAGGCAATGAGATTCTGAATTACATTACACGAGCTCTCGGTGCTTCTCTCATTGGAGCTGGATTATGGCTGGTGAAAACTTTGATGGTGAAGATACTAGCTGCTTCTTTTCAATGCGCTAGATTCTTCGATCGGATTCAAGAATCAATCTTCCATCAATATATACTACGCATCCTATCAGGGCCTCCAATCATGGAGATGGCGGAGAGTGTCGGGAGAGCAGCGAGCACAGGGCAGTTGAGTTTCAGGCATTTGAAGAAAGAAAGTGATGGTGGGAATGAAGGAAAAGAAGAGGTTATTGATGTAGATAAACTCAAAAAGATGAAGCAAGAAAAAATCTCTGCTTGGACTATGAGAGGGCTAATCAATGTTATAAGGAGTTCAGGGCTGTCCACCATCTCTAATACAATAGAGAATTTCAAAGAGGAAGAGAATGAGCAAAAAGATAAGGAGATTAACAGCGAATGGGAAGCAAGGGCCGCAGCTTACCAGATTTTCAGAAACGTTGCAAAACCGGGTAGCAAGTATATTGATGAAGACGACCTCTTTCGTTTTATGAGTAAGGAGGAAATTGATAATGTGCTGCCATTGTTTGAAGGAGGAGTTGAGACGGGAAAGATAAAGCGAAAAACCCTGAAGAATTGGCTGGTGAATGTTTACATTGAACGCAAGTCGCTAGCTCACTCATTGAATGACACCAAGACTGCCATAGAGGAACTAAACAAGCTTGCTTCTGCAATTGTACTGATTGTGATTATCATTGAATGGCTACTTTTGATGGGTTTCTTGACCACGCAAGTACTCGTCTTCGTTTCATCACAGATTCTGTTGGTGGTTTTCATGTTCGGTAACACTGCCAGAACTGTATTTGAAGCCATCATATTCGTATTCGTGATGCATCCATTCGATGTGGGGGATCGTTGTGTCGTAGATGGTGTGCAGATGGTTGTTGAAGAAATGAACATTTTAACCACAATCTTCTTGAGATATGACAATGAGAAGATCTTCTATCCAAATTCTGTGCTAGCCACCAAACCCATCAGTAACTACTACAGGAGCCCTGAAATGAGTGATTCGATCGAATTTTCCGTCGACTTTTCCACTTCAATCGAAAGCATTGGAGCTCTAAAAGCAAGAATAAAAACATACTTAGAAAGCAAACCCCAGTTCTGGCGACCGAACCATAGTGTCATCGTGAAGGAGATCGAGAATATCAACAAGATGAAACTAGCTCTGTGTGTCAATCACACCATAAACTTTCAAAACTATGGCGACAAGAGCAGTCGCAGATCGGATTTAGTCTTGGAGCTGAAGAAAATTTTCGAAGATCTCGGTATCAAGTATCATCTTTTACCTCAAGAAGTTCAGCTCAACTATGTGGGTTCAGCAGCTTCTGTGATTCCATCATCTCAAAGATGAAGATGAAGGTCATTTCTTCAGTTGCTCATTTTCTTACCAAAGCTCTCAAAATTACAAAAACAATGGCTAACTCATCTCCTTTTTGGCTTCAATGGCTTTGAATCTTTGATGGGAAGGGAACAAATTTTGAGTTGTACCAGTAAGGGAAAAAGAATTGTAAAATATTGATTAGTTGTTCTCAACAAATTTTGAATTTTATTTATTGACAATTTATGAGAATTGACTATTGAAATTTAACAACAACAGTGTTGACTTTTTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTTTTGCAATGGCGTTAGTGACAATAAGTTTAAAAAATGTTTTTTTTTTAATCTTTAATTGATGTTCAATGTAGAGTCTGAACCGTTCATACTGATCTGGCTATGTCGTGAACTATGCCAATGTTGATTGATTCTTTTTTAAAATTCAAAAATTTGTTACACATATTTAAAGTTAGACATAAAATTTGAATTCATATATAGTAAATTAATTCATTTTATAAATTTTGAATATGTTGGTGATTTATTATATAAATAGATTTTTTCAAAGACAAATAAACATAAACTTTAAAGTTCCACGACCAAATTAAAAAAAATATCAAATTACAAGTTTAATCTCTAAACTTGGTCTATTTGACTCTAAATTTTTAATTTTATGTCTAATGACTTCCTAAATTAAAAATTTTATCTAATAGATTCTTAAACTTACAATTTTGCATTTAATAGGATCTTAATATATTTAATTTTTTCTTAAATTAAAGAATATATTTAATTTTTCCAACATAAAATTACATGATAATTGTTCTATTAAATAAATATAAATTGAGGTTTGTCAACCTTAAAATCTAAATTTTATTCGCTAGATACGAGAATTTGAGAGAAGAATAAAAGAGAGGAAATTTTGTCAAAATAGGTGAAAGACCTAATAACATACAAAAATTGAAAATCTTGGACATCCATTAGACAAATTTCTTCCAAAAAAAAATTATTGGATACAAAATTAAAAGCGCAAGAATCTCTTAAACACTTTTTAAAATTTAGACACCTATTAATCCTATTAGATAATTGATTAAATTGTTAATTCAATCCATAAAGTTTATAATTAGAAAATATTTTTTTATAATTAGCTAATAAATTCCATAGTGTGATGAGGAAAATTAAGATAATCATTATATTTTTAGTAATATTTGTTTAGTTGTTAATTTAGATTAATTAATGTTAATTAGAATTATTTAGTTAATTGTCTTATTTTTTTGTAATGCTATAAATAGTCAATTTGAGTATTCTCTCGTCTCTTTATGGATGAAC 3951 33.94 MADKKGMEQLVLRILEGEEGVDTSKDLTKPSVSSFPDFDLKETRSFRCTIPQSVVGSSPSHEISRMSPLKPPKIPGETAIRRPSFARSSFSKPKSRLIESPCPDSASLAEEKAKAKSTLYSSPKMDSPAKITTVTSPKEALKSAPITPKTPLIGTTGSEEEDDEEVYKTAELKVKERSGKKLKRTVLIEWVAFLCLTGCLIASLTIDKLVTKEIWGLGLWKWCVLVLVSFCGRLFSQWFINCLVFLIERNFLLKRKVLYFVYGLRKSVIIFIWLGLVLLAWGLLFDQSSKRSKKGNEILNYITRALGASLIGAGLWLVKTLMVKILAASFQCARFFDRIQESIFHQYILRILSGPPIMEMAESVGRAASTGQLSFRHLKKESDGGNEGKEEVIDVDKLKKMKQEKISAWTMRGLINVIRSSGLSTISNTIENFKEEENEQKDKEINSEWEARAAAYQIFRNVAKPGSKYIDEDDLFRFMSKEEIDNVLPLFEGGVETGKIKRKTLKNWLVNVYIERKSLAHSLNDTKTAIEELNKLASAIVLIVIIIEWLLLMGFLTTQVLVFVSSQILLVVFMFGNTARTVFEAIIFVFVMHPFDVGDRCVVDGVQMVVEEMNILTTIFLRYDNEKIFYPNSVLATKPISNYYRSPEMSDSIEFSVDFSTSIESIGALKARIKTYLESKPQFWRPNHSVIVKEIENINKMKLALCVNHTINFQNYGDKSSRRSDLVLELKKIFEDLGIKYHLLPQEVQLNYVGSAASVIPSSQR 765
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
2 49759567 49764173 - XM_039022983.1 Bhi02g01835 28357
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bhi02g01835 765 Coils Coil 423 443 - -
Bhi02g01835 765 PANTHER MECHANOSENSITIVE ION CHANNEL PROTEIN 4 756 - -
Bhi02g01835 765 PIRSF Memb_At2g17000 17 764 IPR016688 -
Bhi02g01835 765 Gene3D - 594 643 IPR023408 -
Bhi02g01835 765 MobiDBLite consensus disorder prediction 52 108 - -
Bhi02g01835 765 Pfam Mechanosensitive ion channel 535 740 IPR006685 GO:0016020|GO:0055085
Bhi02g01835 765 PANTHER MECHANOSENSITIVE ION CHANNEL PROTEIN 5 4 756 IPR016688 -
Bhi02g01835 765 SUPERFAMILY Sm-like ribonucleoproteins 584 643 IPR010920 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Bhi02g01835 Bhi-Chr2:49759567 Bhi09g03090 Bhi-Chr9:79739624 0 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bhi02g01835 K22048 - csv:101209209 1366.67