Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bhi12g00143 ATTCTCTCTCTCCTGCTCCTCACTCTGTGATCACCTCTTCCACCTCCCGCGTTTTCTTAGTCCATAAATATGGCTTTTTCTTTCAATTTCATCTTCCTCTCATTGCTTTTTCTTCATTAACCCGCTTCCATTTATTACTCATCATACCATTACTCCGTCCCGCCGCCATGCCATCGCCGGAAGTTTTCTCCCCACGGGTCGTCGATAGGGGTCCTGTGGTTCCGGTCACCAATCTCGTCAAGTTCCTTGAGTGTCTTCAGATTGTAGCCCTCAACTCGTTTGGGAAATTCGATTTCGATCTTAAATACTATGTCGATTTGTCTCTGAAATTCGATTTGAATTCTACCCAAACCTCTTTCGATGCCCTTGAGCGATCCTCTAATGGCTCTGTTCCCGTCGAGAATTTGAAAACCTTCATTAAAGATTATTTCCATAGTGCTGGAACCGACTTGGTTTACTCTGAGCCAGTTGATTTCGTCCCTCAGCCTGTTGGGTTTTTGCCCAAAGTTGAGAATGTGGAGGTTAGAGCTTGGGCTTTAGATATTCATAACTTTTGGAAGAATCTTAGCCGTAGAGTCTCCGATGATCTCATTCATCGGCCGGATAACCACACTCTGCTTCCGTTGCCGGAGCCTGTTGTCGTTCCGGGTTCCAGATTCCGGGAAATTTATTATTGGGATTGTTATTGGATAATCAGGTACGGCGGTGTAATTTAGGTCTCAAATTTTATTTATGAAATTTTTACTCTGCAAGAGTTACACTTGATGACTCGTTCTTCACAAAGTTCTTAACCCTTTTCTTGGCTCTTTTCACCCCTTCTGTCATTTGGTGAAGAAACAATGCTCAACTTAAAATTTTCATTAAGAAAAGGGGAATCTGAAAGTAGAACGAGCATCATACATGGTTAGATAATATAATATAATATTATATTTGTTTTTACCCATTAGTTTAAATTTTTAGGTCAATAGTTGATGTAAGATGATATTAATAGGGATATTCAAAAAACTTGATGACCCGAAAGACTAGATCAACTTAACTCAACCTGTACAGTTTGGATTAAACTTTATAGGTTGGCTTAATTTAATTTGAAATAATTTGAACCAACCCGAACGAACTCAAACTCATTATTAATATTGAAAAGTATCCAATACAATTATATATTCATATATTTATTTTAGTTTTACTTAATTTTATGGTTTTTTTAAGATTATTTATTATCTATCAATAATTTAAAATAGTTTTTTAACACTACCCAAATAAATTTTTCATAATATAATTAAAATTAATTTGCTAATCTTATTTCAATATGTGACGATAATTAACCAAATTCTTTTACATTTTAACATGCTACTTCTTTTTAAAACAAAATTTTAAATAATAACCCGAACGAATCCAACCCAAAATTTGTAGGATTGTAGGGTTGGATTGGGTTGGGTTCATTATTTAATAAAAGTTGTTTGGATTGAAGAAATTTACAACCCGAATGATTGGGTTGAGTCCAAAAAGTGCTTCAACCCAACCCAACTCAACTCAACTCAACCTAACCTAACCTAACCTACAAACACCCCTAGGTATTACAACAAAGACCCTATATTCAAATCCGGCAATGATATTTTCTCCATTTTCGGATCAATGAGTGATTTAAGATGGTATTAAAGTGGGAGGTCATGAGTTTTGTTCAAACTCCTAGAATTTTATTTTCTGCCTAATTAATATTGATTTCCATTCATTGTATCTACATATTTCATGTTCATCAGCGAGGGAAATGTTAGAATATATAAAATTAAATTTGATTTCACCACTCATATATATTATAATTTTCTTGAGTTATGACTATGGGGTTGTTCCCTAGTTTGTTTTTCTTGGCTCTATTCTGCCTTTTGTTTTTATATTTTTGTGCAGAGGTTTGTTAG 1913 34.81 MPSPEVFSPRVVDRGPVVPVTNLVKFLECLQIVALNSFGKFDFDLKYYVDLSLKFDLNSTQTSFDALERSSNGSVPVENLKTFIKDYFHSAGTDLVYSEPVDFVPQPVGFLPKVENVEVRAWALDIHNFWKNLSRRVSDDLIHRPDNHTLLPLPEPVVVPGSRFREIYYWDCYWIIRYGGVI 182
       

Gff information


Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
12 4242571 4244483 - XM_039051131.1 Bhi12g00143 51955
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bhi12g00143 182 Pfam Trehalase 42 177 IPR001661 GO:0004555|GO:0005991
Bhi12g00143 182 Gene3D - 28 178 IPR012341 GO:0005975
Bhi12g00143 182 PANTHER TREHALASE 30 177 IPR001661 GO:0004555|GO:0005991
Bhi12g00143 182 SUPERFAMILY Six-hairpin glycosidases 39 177 IPR008928 GO:0005975
Bhi12g00143 182 PANTHER TREHALASE 30 177 - -
       

Duplication type information


Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Bhi12g00143 Bhi-Chr12:4242571 Bhi12g00145 Bhi-Chr12:4286252 6.51E-111 dispersed
Bhi12g00143 Bhi-Chr12:4242571 Bhi12g00144 Bhi-Chr12:4285318 6.51E-111 tandem
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bhi12g00143 K01194 - bhj:120092887 367.466