Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bpe01g00003 ATGTCCAGAGCTAAGGATTTGTGGGAGCAACTAGTACGCGCCACATTAAGGAGGGAAAGGAGTGGGACTGATTCTTATGGACAGCCTGCGAGTGGAATTGCTGGAAATGTACCTTCTTCGCTTGCAAAGAATAGAGACATTGATGAAATCCTAAGAGCAGCAGATGAAATCCAAAATGAAGATCCCAACGTTTCCAGAATTTTATGTGAGCATGCCTATTCGCTGGCTCAAAATCTTGATCCTAATAGTGAAGGAAGAGGTGTCTTGCAATTCAAAACTGGTTTATTGTCTGTTATTAAGCAAAAGTTAGCAAAGAGGGTAGGTGATACCATAGATAGAAGGCAGGACATCGCTCGCTTACAGGAATTTTATAGGAGTTACAGAGAAAAGAACAATGTTGATAAATTACGAGAAGAAGAGATGAAGTTGAGGGAGTTGGGGGCTTTCAGTGGCAATCTAGGAGAGTTGGAAAGGAAGACTCTGATGAGAAAAAAAGTTTTTGCAACATTAAGAGTGTTAGCAATGGTTTTGGAGCAGCTGAATCAGGAAATTCCCGAAGAGCTCAGAAGAGTAATGGAGTCAGATGCAACAATGACAGAAGATTTAATTGCATATAATATCATTCCTCTTGATGCTCCTTCCATAACAAACGCTATTGTGTCATTTAGAGAGGTGCAAGCATCTATGTCTGCTTTGCGGTACTTTAATGGCCTACCTAAGTTGCCCGTGGATTTTACTGTTCCCGAGACAAGGAGTCCCGATATGCTTGACTTTTTGCATTATATTTTTGGATTTCAAAAAGACAATGTTTCTAATCAGCGGGAACATGTGGTTCACCTGCTTGCAAATGAGCAGTCTCGACTGAACATTCCTGAAGAAACTGAGCCTATATTAGATGGTACATCTGTGGATAATGTATTCTTGAAGTCTCTTGACAACTACATTAAATGGTGTGGCTATTTGGGCATTCAACCTGTTTGGAGCAGTTTTGGAGCGCTTAGCAAAGAAAAAAAATTGTTGTTTGTGTCCTTGTACTTTCTCATATGGGGTGAAGCAGCCAACATTAGATTTCTTCCGGAATGTTTGTGCTACATATTTCACCATATGGTTAGGGAAATGGATGAGATACTGCGACAGCAGGTTGCTCATCCAGTGCAAAGTTGCAAGTCGGATAATGGAGTTTCTTTTCTTGATCAAGTTATCTGTCCTCTTTATGAGGTTGTGGCTGCGGAAGCTGCAAACAATGATAATGGGAAGGCACCACATTCTTCTTGGAGGAATTATGATGACTTCAATGAGTATTTTTGGTATGTTGCTAAATATTGTCTGCTTTTCAGATTTTCTCCCCAATTGAGAGTATTGACTCTTTTCTTAATCAGGTCACTACATTGCTTTGAACTTAGTTGGCCATGGCGTAGAACTTCGTCCTTTTTTCAGAAGCCAACACCAAAATCAAAGAGTATACTTGGGAGAAGTAAACATCGTGGGAAGACTTCATTTGTTGAGCATCGGAGTTTTCTCCATCTTTATCATAGCTTTCATCGTCTATGGATATTTTTGGTCATGATGTTTCAGGGTCTTGCAGTTATTGCATTTAATGATGGCAGACTTGATTTACAAACCCTTCGAGAGGCTCTCAGCCTTGGTCCCACATATGTTTTGATGAAATTCATCGAGAGTGTTTTGGATGTTATCATGATGTATGGCGCATATTCTACTACAAGATCCCTTGCAGTTACTCGAATTTTTCTCCGTTTTATTTGGTTTAGTGTTGCTTCGGTTTTCATTACCATTCTTTATGTGAAAGCACTCCAGGAAGAGAGTAGATCAAATTCTGATCAAATTTTTTTCAGACTATACTTGATAGTAATTGGCATATATGCTGGTGTTCAGTTTTTTCTTAGTATTCTCTTGCGCATACCAGCATGTCACCTTTTAACTAATCAGTGTGATCAATGGCCAGTTGTTCGCTTTATCAAGTGGATGCGACAGGAGCAATATTATGTTGGAAGAGGCATGTACGAGAAGACTTCAGATTTTATCAAGTACATGCTCTTCTGGCTTGTCATTTTGGGTGGAAAATTTTCCTTCGCATATTTTCTCCAGATAAGGCCACTAGTGAAGCCTACAAAAACCATTATAGAAATTGTTGACATTAGATATTCCTGGCATGACTTCGTCTCTAAAAATAATCATAATGCATTGGCGATTGTTAGCATTTGGGCTCCAGTGATTTGTATATATTTGCTGGATATCTACGTGTTTTACACTGTGGTGTCCGCTGTTTTTGGATTTTTACTTGGTGCTAGAGATCGCCTTGGCGAGATCAGGTCTTTAGAAGCCCTTCACAAACTTTTTGAGCAGTTTCCTGGGGCATTTATGGATACTCTTCATGTTCCTCTTACTAACAGGTGGTATGATATCATTAAAAAACGTTTGCAGGGACTTGAGAAGAAAAAGATTGAAGCTACTCGATTTGCACCCTTCTGGAATGAAATAGTTAGAATGTTACGCGAAGAGGATTACATAACAAACTTGGAGATGGAGCTACTTCAAATGCCAAAGAATTCTGGAAAACTTCCTATGGTTCAGTGGCCTCTGTTTCTTCTTGCTAGCAAGATATTTCTGGCCAAAGACACTGCTTTAGAGAGTCATAGTTCACAAGATGAGCTCTGGGAAAAGATTTCAAGAGATGAGTATATGATGTATGCGGTTCAGGAATGCTTTAACACTATTAACCTAATTTTGATGGAGGTATTGGATGGTGAAGGAAAAATGTGGATTGAACGATTATATGAAGATATTCAAGCAAGTATTGTGAAAAGAACTTTCCATATTGACTTTCGCATGGATAAGCTTCCGCTTGTGATTTCTAGAGTTACTGCCCTCATGGGTATTTTGAAAGAGACTGAAACTTTGGAGTTGGAGAAGGGAGCTGTCAAGTCTATTCAAGATCTATATGATGTTGTGCGCCATGATGTTCTTTCAATTGACTTGAGGGAGAACTATGAAACATGGAACTTATTGTCGAAAGCTAGAAGCGAAGGTCGGCTATTTACAAAGTTGAATTGGCCAAAAGGTTCTGAAATGAAATCCCAAGTGAAACGATTGTATTCATTGTTGACTATCAAAGATTCAGCTTCTAATATTCCAAAGAATCTGGAGGCAAGGCGTAGGCTAGAATTTTTCACAAATTCCCTTTTTATGAAAATGCCAACTACAAAACTTGTACGCCAGATGCTTGTTTTCACTCCTTATTATTCTGAGATTGTGCTTTATAATATGTCTGAACTTCTGAAAAAAAATGAGGACGGAATATCAACCTTGTTTTACCTACAAAAAATATATCCAGATGAGTGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGTCGTGATGAAAATGAAGTTGACTCGGAGCTTTTTGATAACCCCAGAGATATCTTGGAACTTCGATTTTGGGCTTCATATCGTGCACAAACATTGGCAAGAACAGTTCGAGGAATGATGTACTATCGGAAAGCTCTTATGCTGCAAGCATATTTAGAGAGAATAATGTGTGGAGATTTGGAAGCTTCTGTTGCAAACATTGATGTATCTGAGACACGAGGTTTTGAGTTATCTCCCGAAGCTCGAGCACAAGCAGATCTTAAGTTTACATATGTTGTCACTTGCCAAATATATGGTAAACAGAAAGAAGAACAAAAACCTGAGGCTGCTGATATCGCACTACTTATGCAAAGGAATGAAGCTCTACGCGTTGCTTTTATTGATGAAGTTGAAACTTTAAGAGATGGTAAAGTGCATAGAGAATTCTATTCAAAGCTTGCGAAGGCAGACATCAATGGGAAAGATAAGGAAATCTATTCCATAAAGTTGCCAGGAAATCCAAAACTAGGTGAAGGAAAACCTGAAAACCAAAACCATGCGATTATATTTACACGTGGAAATGCTATCCAAACTATTGATATGAATCAGGATAATTATTTTGAAGAAGCATTAAAAATGAGAAATCTTCTTGAGGAATTCAATCGCCATCATGGAAGTCGTTATCCTACTATACTAGGAGTCAGGGAACATGTATTCACGGGAAGTGTATCTTCCCTTGCCTCATTCATGTCTAATCAAGAAACTAGCTTTGTGACTCTTAGTCAGAGGGTTTTGGCAAATCCTTTAAAGGTGCGAATGCATTATGGCCATCCCGACGTTTTTGATAGAGTTTTTCACATAACTCGTGGTGGTATAAGCAAAGCTTCTCGTGTTATCAACATTAGTGAAGACATATTTGCGGGATTTAATACAACTCTACGCCAAGGGAATGTTACTCATCATGAGTACATTCAGGTTGGAAAAGGTCGAGATGTTGGGCTTAATCAAATTGCAGTTTTTGAGGGAAAGGTTGCTGGTGGTAATGGAGAGCAAGTTCTTAGTCGTGATGTATACCGGCTAGGGCAGCTCTTTGATTTTTTCCGGATGATGTCATTTTACTTTACCACGGTCGGATACTATTTTTGTACAATGTTAACGGTGCTTACTGTGTATATATTTCTTTACGGGAAGACATATTTGGCATTGTCTGGTGTTGGTGAGAGGATCGAAGTGCAAGCTGAAGTGTCAGATAATACTGCTCTCACTGCTACTCTAAATACGCAATTTCTCATTCAAATTGGTATTTTCACTGCTATCCCAATGGTTCTTGGATTTATATTGGAGCAGGGGCTTTTTAGGGCTATTGTCAGTTTTGTTACAATGCAGTTTCAGCTCTGCTCTGTCTTCTTCACTTTCTCATTGGGCACAAGAACACATTATTTTGGGAGAACAATTCTTCATGGTGGTGCAAGGTATCAAGCAACTGGTAGGGGATTTGTGGTACGGCACATTAAATTTTCTGAAAACTACAGGCTTTACTCGCGCAGCCATTTTGTCAAAGGAATGGAAGTTGCCCTTTTGCTAATTGTATACGCTGCATATGGATATAATTCTGGTGGTGCATTTGCCTACGTTCTTATCACAATTAGCAGTTGGTTTATGGCAATATCTTGGTTGTTTGCCCCATACTTATTTAATCCATCTGGATTTGAGTGGCAGAAGATTGTGGAGGATTTTCGAGAATGGACTAATTGGCTTCTTTACCGAGGTGGAATAGGAGTTAAGGGTGAAGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGAGGAAGAACTGGCACATATTCGCACTATCGGAGGAAGGATAGCAGAGACTATTTTGAGTCTCAGATTTTTTATTTTTCAGTATGGGATTGTTTACAAGTTAAATTTACAAGGATCAGATACATCATTGTCGGTATTTGGTTTCTCTTGGGTTGTCTTGGCTGTTCTTATAATTCTTTTCAAGGTGTTCACCTTTAGTCAGAAAATATCTGTTAACTTCCAGCTTTTGTTGCGCTTTATCCAAGGAATGTCTTTTATTCTGGCTTTAGCTGGTTTAACGCTTGCCATAATATTCACGAATTTGACAGTTCCAGACGTGTTTGCCTGCATCTTAGCATTTATACCTACTGGATGGGGAATTTTATCTATTGCAGCTGCATGGAAGCCTGTGATGAAGAAGTTGGGGCTGTGGAAATCAATCCGCTCTATTGGTCGGCTGTACGACGCCGGAATGGGGATGATTATTTTTGTCCCAATTGCATTCTTTTCATGGTTTCCATTTGTGTCGACATTCCAAACCCGCCTCATGTTCAATCAGGCCTTCAGCAGAGGATTGGAAATTTCCCTTATCCTCGCCGGCAACAACCCGAATACTGGCATTTGA 5775 39.39 MSRAKDLWEQLVRATLRRERSGTDSYGQPASGIAGNVPSSLAKNRDIDEILRAADEIQNEDPNVSRILCEHAYSLAQNLDPNSEGRGVLQFKTGLLSVIKQKLAKRVGDTIDRRQDIARLQEFYRSYREKNNVDKLREEEMKLRELGAFSGNLGELERKTLMRKKVFATLRVLAMVLEQLNQEIPEELRRVMESDATMTEDLIAYNIIPLDAPSITNAIVSFREVQASMSALRYFNGLPKLPVDFTVPETRSPDMLDFLHYIFGFQKDNVSNQREHVVHLLANEQSRLNIPEETEPILDGTSVDNVFLKSLDNYIKWCGYLGIQPVWSSFGALSKEKKLLFVSLYFLIWGEAANIRFLPECLCYIFHHMVREMDEILRQQVAHPVQSCKSDNGVSFLDQVICPLYEVVAAEAANNDNGKAPHSSWRNYDDFNEYFWYVAKYCLLFRFSPQLRVLTLFLIRSLHCFELSWPWRRTSSFFQKPTPKSKSILGRSKHRGKTSFVEHRSFLHLYHSFHRLWIFLVMMFQGLAVIAFNDGRLDLQTLREALSLGPTYVLMKFIESVLDVIMMYGAYSTTRSLAVTRIFLRFIWFSVASVFITILYVKALQEESRSNSDQIFFRLYLIVIGIYAGVQFFLSILLRIPACHLLTNQCDQWPVVRFIKWMRQEQYYVGRGMYEKTSDFIKYMLFWLVILGGKFSFAYFLQIRPLVKPTKTIIEIVDIRYSWHDFVSKNNHNALAIVSIWAPVICIYLLDIYVFYTVVSAVFGFLLGARDRLGEIRSLEALHKLFEQFPGAFMDTLHVPLTNRWYDIIKKRLQGLEKKKIEATRFAPFWNEIVRMLREEDYITNLEMELLQMPKNSGKLPMVQWPLFLLASKIFLAKDTALESHSSQDELWEKISRDEYMMYAVQECFNTINLILMEVLDGEGKMWIERLYEDIQASIVKRTFHIDFRMDKLPLVISRVTALMGILKETETLELEKGAVKSIQDLYDVVRHDVLSIDLRENYETWNLLSKARSEGRLFTKLNWPKGSEMKSQVKRLYSLLTIKDSASNIPKNLEARRRLEFFTNSLFMKMPTTKLVRQMLVFTPYYSEIVLYNMSELLKKNEDGISTLFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENEVDSELFDNPRDILELRFWASYRAQTLARTVRGMMYYRKALMLQAYLERIMCGDLEASVANIDVSETRGFELSPEARAQADLKFTYVVTCQIYGKQKEEQKPEAADIALLMQRNEALRVAFIDEVETLRDGKVHREFYSKLAKADINGKDKEIYSIKLPGNPKLGEGKPENQNHAIIFTRGNAIQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFNRHHGSRYPTILGVREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTLSQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRVFHITRGGISKASRVINISEDIFAGFNTTLRQGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQIAVFEGKVAGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYIFLYGKTYLALSGVGERIEVQAEVSDNTALTATLNTQFLIQIGIFTAIPMVLGFILEQGLFRAIVSFVTMQFQLCSVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRHIKFSENYRLYSRSHFVKGMEVALLLIVYAAYGYNSGGAFAYVLITISSWFMAISWLFAPYLFNPSGFEWQKIVEDFREWTNWLLYRGGIGVKGEESWEAWWEEELAHIRTIGGRIAETILSLRFFIFQYGIVYKLNLQGSDTSLSVFGFSWVVLAVLIILFKVFTFSQKISVNFQLLLRFIQGMSFILALAGLTLAIIFTNLTVPDVFACILAFIPTGWGILSIAAAWKPVMKKLGLWKSIRSIGRLYDAGMGMIIFVPIAFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI 1924
       

Gff information


Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
1 30490 87848 - Bpe000004.1 Bpe01g00003 97251
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bpe01g00003 1924 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 439 IPR026899 -
Bpe01g00003 1924 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1050 1737 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Bpe01g00003 1924 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1 1922 - -
Bpe01g00003 1924 MobiDBLite consensus disorder prediction 19 38 - -
Bpe01g00003 1924 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1 1922 - -
Bpe01g00003 1924 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
Bpe01g00003 1924 Gene3D - 33 189 IPR023175 -
Bpe01g00003 1924 MobiDBLite consensus disorder prediction 21 38 - -
       

Duplication type information


Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Bpe01g00003 Bpe-Chr1:30490 Bpe07g00875 Bpe-Chr7:14814346 0 dispersed
Bpe01g00003 Bpe-Chr1:30490 Bpe13g00033 Bpe-Chr13:932030 0 transposed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bpe01g00003 K11000 - twl:120016019 3135.51