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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cam03g1408 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5610 40.98 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1869
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 28622288 28681321 + CaPI482276_03g014080.1 Cam03g1408 123674
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cam03g1408 1869 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 29 1863 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Cam03g1408 1869 SMART FKS1_dom1_2 302 414 IPR026899 -
Cam03g1408 1869 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 992 1682 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
Cam03g1408 1869 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 304 411 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cam03g1408 Cam-Chr3:28622288 Cam06g1915 Cam-Chr6:30084644 0.00E+00 dispersed
Cam03g1408 Cam-Chr3:28622288 Cam03g1410 Cam-Chr3:28700618 1.90E-149 proximal
Cam03g1408 Cam-Chr3:28622288 Cam03g1412 Cam-Chr3:28732790 8.30E-97 proximal
Cam03g1407 Cam-Chr3:28584549 Cam03g1408 Cam-Chr3:28622288 0.00E+00 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cam03g1408 K11000 - csv:101216435 3538.43