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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cam06g1660 ATGAATCTCCTTGACAAATCCCTCATCTCTTCCACACCTCAATCTTTCATTACCTCAATACCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAACCCCTTCGCTCCCATGCTATTCGATGTTCCGTTGCTGTGGCGCCTTCTGCTTCCACCAAGGTCTCGAAGGAATTCAAGTTGAAGTCTGTGAAGGCCCGGCAGATTATTGACAGTAGAGGCAATCCCACGGTCGAGGTTGATTTGATTACTGACGATCTCTACCGATCCGCTGTCCCCAGCGGGGCTTCCACTGGGATCTATGAGGCTTTGGAGCTTAGAGATGGGGATAAAACCATTTATGGAGGTAAAGGTGTGCTTACTGCTGTTAAGAACATCAATGATATCTTGGCTCCTAAGCTCGTCGGCGTCGATGTCAGGAATCAAGAAGAAGTTGATGCAATCATGCTGGAAATTGATGGAACCCCGAACAAATCGAAACTTGGGGCAAATGCTATACTAGGAGTTTCTTTAAGCGTCTGCAGAGCTGGTGCTGGTGCCAAGGGACTACCATTGTACAGGCACATCCAAGAATTATCAGGCACCAAGGAACTTGTTATGCCAGTTCCTGCTTTTAATGTTATAAATGGGGGTAGCCATGCTGGAAATAATCTAGCAATGCAAGAATTTATGATCTTACCTGTAGGTGCTACATCTTTTGCAGAGGCACTGCGCATGGGAAGTGAAGTTTATCACACGCTTAAGGGAATTATTAAAGCAAAATATGGACAAGATGCCTGCAATGTAGGAGATGAGGGTGGATTCGCTCCAAATGTTCAAGATAACAGAGAAGGACTGGTGTTGCTTATTGATGCCATTGAAAAGGCTGGTTATACAGGAAAGATCAAAATAGGAATGGATGTTGCAGCTTCAGAGTTCTTCACTAAAGAGGGAAAATATGATCTGAACTTCAAGAAACAGCCAAATGATGGAGCTCATGTTCACTCAGCTCATGGCCTTGGCGAACTCTATAAACAGTTTGTCAAAGATTTTCCCATTGTTTCCATCGAGGACCCCTTTGATCAAGATGATTGGAGCTCTTGGGCTTCTCTACAATCTTCTGTTGATATCCAACTTGTGGGAGATGACTTGCTTGTAACAAATCCAAAGAGAATTGCTGAAGCCATTCAGAAAAAAGCTTGTAATGCTTTACTTCTGAAGGTTAACCAGATTGGATCAGTGACCGAATCAATTCAAGCTGCTCTTGATTCCAAGGCTGCTGGCTGGGGAGTGATGGTCAGCCACCGAAGTGGTGAAACTGAAGATAATTTTATTGCTGATCTTTCTGTTGGCTTAGCTAGTGGACAGATAAAAACTGGAGCTCCATGCCGAAGTGAACGGTTAGCCAAATATAATCAGCTTCTTCGCATTGAAGAAGAACTTGGCAGTGTTCGATATGCCGGTGCATCGTTCAGATCACCTTAG 1449 44.03 MNLLDKSLISSTPQSFITSIPSSSSSSSKPLRSHAIRCSVAVAPSASTKVSKEFKLKSVKARQIIDSRGNPTVEVDLITDDLYRSAVPSGASTGIYEALELRDGDKTIYGGKGVLTAVKNINDILAPKLVGVDVRNQEEVDAIMLEIDGTPNKSKLGANAILGVSLSVCRAGAGAKGLPLYRHIQELSGTKELVMPVPAFNVINGGSHAGNNLAMQEFMILPVGATSFAEALRMGSEVYHTLKGIIKAKYGQDACNVGDEGGFAPNVQDNREGLVLLIDAIEKAGYTGKIKIGMDVAASEFFTKEGKYDLNFKKQPNDGAHVHSAHGLGELYKQFVKDFPIVSIEDPFDQDDWSSWASLQSSVDIQLVGDDLLVTNPKRIAEAIQKKACNALLLKVNQIGSVTESIQAALDSKAAGWGVMVSHRSGETEDNFIADLSVGLASGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSVRYAGASFRSP 482
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 28011424 28014574 + CaPI482276_06g016600.1 Cam06g1660 129960

Annotation

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cam06g1660 482 FunFam Enolase 54 177 - -
Cam06g1660 482 PANTHER ENOLASE 56 480 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000015(PANTHER)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(PANTHER)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)|GO:0006096(PANTHER)
Cam06g1660 482 CDD enolase 58 468 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 Pfam Enolase, N-terminal domain 57 184 IPR020811 -
Cam06g1660 482 SMART Enolase_C_3 192 482 IPR020810 -
Cam06g1660 482 ProSitePatterns Enolase signature. 392 405 IPR020809 -
Cam06g1660 482 SFLD enolase 57 469 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 SFLD enolase 57 469 - -
Cam06g1660 482 Gene3D - 50 177 IPR029017 -
Cam06g1660 482 SMART Enolase_N_3 56 184 IPR020811 -
Cam06g1660 482 FunFam Enolase 1 178 482 - -
Cam06g1660 482 Gene3D - 178 482 IPR036849 -
Cam06g1660 482 PRINTS Enolase signature 157 173 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 PRINTS Enolase signature 214 227 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 PRINTS Enolase signature 87 101 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 PRINTS Enolase signature 421 438 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 PRINTS Enolase signature 392 406 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 PRINTS Enolase signature 369 380 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 Pfam Enolase, C-terminal TIM barrel domain 193 480 IPR020810 -
Cam06g1660 482 SUPERFAMILY Enolase C-terminal domain-like 192 475 IPR036849 -
Cam06g1660 482 SUPERFAMILY Enolase N-terminal domain-like 56 187 IPR029017 -
Cam06g1660 482 NCBIfam phosphopyruvate hydratase 57 478 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cam06g1660 482 Hamap Enolase [eno]. 54 469 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
       

Pathway

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cam06g1660 K01689 - - csv:101209516 884.789
       

Dupl-types

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cam04g1000 Cam-Chr4:24174631 Cam06g1660 Cam-Chr6:28011424 1.20E-166 dispersed
       

Deco-Alignment

Select Vvi1 Blo1 Blo2 Bda1 Bda2 Bpe1 Bpe2 Bma1 Bma2 Cmo1 Cmo2 Cma1 Cma2 Car1 Car2 Sed1 Cpe1 Cpe2 Bhi1 Tan1 Cmetu1 Lac1 Hepe1 Mch1 Lcy1 Cla1 Cam1 Cec1 Cco1 Clacu1 Cmu1 Cre1 Cone1 Cone2 Cone3 Cone4 Lsi1 Csa1 Chy1 Cme1 Blo3 Blo4 Bda3 Bda4 Bpe3 Bpe4 Bma3 Bma4 Sed2 Cmo3 Cmo4 Cma3 Cma4 Car3 Car4 Cpe3 Cpe4 Bhi2 Tan2 Cmetu2 Lac2 Hepe2 Mch2 Lcy2 Cla2 Cam2 Cec2 Cco2 Clacu2 Cmu2 Cre2 Lsi2 Csa2 Chy2 Cme2
Vvi17g393 . . . . . . . . . . . . . Car11g00221 Sed12g2041 . Cpe04g01430 Bhi02g00032 Tan09g1975 Cmetu02g0279 . Hepe09g0308 . . Cla06g01505 Cam06g1660 Cec06g1722 Cco06g1717 Clacu06g1626 Cmu06g1575 Cre06g2385 . . Cone13ag0013 Cone19ag0011 . . . . . . . Bda14g00902 . Bpe15g00556 Bma03g00876 . . . Cmo11g00246 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lsi06g01369 Csa01g00309 Chy02g02429 Cme02g01786
       

Syn-Orthogroups

Select Orthogroup Bda Bhi Blo Bma Bpe Cam Car Cco Cec Chy Cla Clacu Cma Cme Cmetu Cmo Cmu Cone Cpe Cre Csa HCH Hepe Lac Lcy Lsi Mch Sed Tan Vvi Total
OG0011033 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30