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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car01g00022 TTTGTGGGTTACGTTGCTATGCAGCTTGTTTCCCACCATTTCTTGCTACTGGTATGCTTCTCTTTCCTTATCTATCTCGTTTCTGGTTTAACCTCCGATGGGTTGGCCTTATTGTCACTCCAAACCCGCTGGACTACCGACACCCCTTTTGTGCCTGCTTGGAATGCTTCTCATTCCACTCCCTGCTCTTGGGGTGGGATTCAATGCGATAAAAACCTTCGTGTCATCACCTTGAATCTCTCTTCCTATGGGGTTTCAGGTCAGATTGGGCCCGAAATTGGGAATTTGACCCACTTGCGTACCATTGATTTGATATCCAACACTTTTTCTGGTGCAATTCCTTATGAGATAGGTAAGTGTAGCCATTTAGAGTTCTTGGATCTCTCCCTTAACCAATTTGGTGGACAAATTCCTCATTCCTTAACAAACCTTACCAACTTCACGTTTTTGAACCTCCATTCCAATGTTCTAACAGGTGCAATACCCGACTCCTTATTTCAAATCCTTAATTTGCAGTATGTGTATCTTAGTGAAAATGGTCTCAACGGTTCTATTCCTTCCAATGTGGGGAATTTGAAGCAGCTGTTGCATTTGTATTTGTATGGAAACCAGTTGTCTGGAACCATTCCTTCTTCCATAGGGAATTGTAGCCAATTACAGGATCTTTACTTAAACCAGAACCAGTTGGTGGGAGTGTTGCCCAATACTCTTAACCATCTTCATAATCTTGTGAATTTGGGTGTCAGCCACAACAATCTTGAGGGTCCAATTCCTTTGGGTTCCGGCAATTGCCAGAGTTTAGAATATATAGATTTGTCATTCAATGGTTATAGTGGAGGTATACCTGCTGGGCTGGGCAACTGTAGTGGCCTAACAACCTTGCTCATTGTAAATTCCAGCCTTACAGGTCATATTCCGTCCTCCATCGGTCGGTTAAGTAATCTTACGACTATCGATCTCTCTAAAAATCAACTATCAGGGAATATACCTTCCGAGTTCGGGGATTGCAAATCCTTGAAAGAACTGGATTTGTACGTCAACCAACTCGAGGGACGTATCCCGAAGGAATTGGGTTTGCTACATGGATTAGAGGTCCTTCAATTGTTTTCAAATAGCTTGACTGGTGAGATTCCAATTAGCATCTGGAAGATTGCAAGTCTCCAGCATATTATTGTGTACAACAACAATCTTTCTGGGGAACTGCCCTTGATAATAACTGAGCTCAAGCACCTCAGAAATATATCTGTGTTTAACAACCAGTTTTCTGGAGTTATACCTCAAAGTCTGGGGCTCAACAGTAGTTTAGTGCAGGTGGAGTTCACTAATAACCAGTTCGTTGGTCAAATTCCACCTAATTTATGCTCGGGAAAGACATTACGCGTGTTGAATTTAGGTTTGAATCAATTTCAAGGTAGCGTACCTTCAGATATTGGAACGTGTTCGACTCTTCAGAGGTTGATTTTGAGAAGGAATAATCTAATAGGGACCCTGCCAGAATTTAAGAGAAATCATGGCCTTCGGTTCGTGGATGCCAGTGAAAACAACCTGAATGGAACAATTCCCTCAAGTTTGGGAAATTGCATCAATCTCACCTCGATTAATTTGTCAAGCAACAAGCTTACAGGTCGTATACCTGATGAGTTGGGATATCTTGTGAACCTTCAAAGTTTGAGCTTGTCTCACAACATCTTGGATGGACCTTTACCATCTTCTCTGTCAAATTGTACCAAACTGGATAAGTTTGACGTAGGATTCAATTTATTGAACGGTTCTGTACCTCGTGGTTTAGCCAGCTGGAAAGTTATATCCACGTTGATATTAAAAGAGAATCGATTTACTGGAGGCATCCTGAACGTATTGTCAGAACTTGACAGCCTTTCACTGCTAGACCTTGGTGGCAATTTGTTTGGAGGTGAAATCCCTTCATCTCTTGGAGCATTGAAGAATCTGTTTTATTCCTTGAATCTCAGTAACAATGCGTTAACTGGTCAACTACCTTTTGAGCTAGCTAGTTTGGTGAAGCTTGGGGAGTTAGACATATCTCACAATAATTTGACTGGAAGTTTAAGCGTTCTTGGCGAACTAAGTTCATCCTTACTTGAGCTTAACATTTCTGATAATTTATTCACGGGTCCTGTGCCACAGACATTAATGAAGTTGCTGAATTCTGATCCCTCATTGTTCTCCGGTAACCCTGGGCTGTGCATCAGCTGTGATGGACTAGATGGCTTAAGTTGCAGCAGAACAAGCAGTATCAAACCTTGTGCTAGCCGTTCAAGCTCTCGTCTTAGCAATATACAAATTGCAATGATAGCTCTCGGAAGTTCGATCTTTATTGTTCTTTTGCTTCTCGGATTGGTTTATAAGTTTGTTTACAGAAGAAGAAACAAACAAAACATTGAGACCTCTGTTCAAGTGGGAGAAACTTCCTTGCTCAACAAGGTGATGGAGGCTACTGATAATCTAGATGAGCGGTTCGTCATCGGGAGAGGAGCACATGGCGTTGTTTATAAGGCTTCCCTAGATTCAAATAGAACTTTTGCTGTAAAGAAGCTTACATTTGTAGGATGTAAAGGGGGAAGGCAGAACATGGTTAAAGAAATTCGAACTGTTGGCAACATTAGGCATCGGAACTTGATCACTTTGGAAGACTTTTGGTTGGGAAAAGACCATGGTCTATTGCTTTACAGATACCAGGCGAATGGAAGCCTTTATGATGTGCTGCATGGGATGAATCCATCTCCAGCTCTAACATGGAAAGTCCGGTATAATATAGCCACTGGTATTGCTCATGGATTGGCGTATCTTCATTATGATTGCGATCCTCCTATAATACACCGAGACATCAAACCGCAGAATATACTTCTAGATTCAGAGATGGAACCTCGTATCGCTGATTTCGGTCTTGCAAAGCTGCTGGATCAGACCTCTGCATCGACGACTTCTTCTTCTTTTGCGGGTACAATTGGCTACATTGCACCAGAGAACGCATTTTCAGCAGCAAAGAGCAAAGCTTCAGATGTGTACAGTTATGGGGTGGTTTTACTTGAGCTGATAACGGGAAAGAAGCCATCAGATGCATCATTTACGGAGTTCGGGAGTATCATGGCTTGGGTTCGGTCGGTATGGAACGAGACGGAGGAAATAGATAGAATTGTTGATCCAAGGCTGGTGGAAGAAGTTGTAAACTCTGATGAGAAGGAGCAGATTAAGCAGTTGCTTATGGTGGTTTTGAGATGCACGGAAAGGGAGGCTAACAAGAGGCCAACAATGAGAGATGTAGTGAACCACTTGATTGATTCAAACACAAGTCATGTCAGGAAATATGACTAG 3333 42.21 FVGYVAMQLVSHHFLLLVCFSFLIYLVSGLTSDGLALLSLQTRWTTDTPFVPAWNASHSTPCSWGGIQCDKNLRVITLNLSSYGVSGQIGPEIGNLTHLRTIDLISNTFSGAIPYEIGKCSHLEFLDLSLNQFGGQIPHSLTNLTNFTFLNLHSNVLTGAIPDSLFQILNLQYVYLSENGLNGSIPSNVGNLKQLLHLYLYGNQLSGTIPSSIGNCSQLQDLYLNQNQLVGVLPNTLNHLHNLVNLGVSHNNLEGPIPLGSGNCQSLEYIDLSFNGYSGGIPAGLGNCSGLTTLLIVNSSLTGHIPSSIGRLSNLTTIDLSKNQLSGNIPSEFGDCKSLKELDLYVNQLEGRIPKELGLLHGLEVLQLFSNSLTGEIPISIWKIASLQHIIVYNNNLSGELPLIITELKHLRNISVFNNQFSGVIPQSLGLNSSLVQVEFTNNQFVGQIPPNLCSGKTLRVLNLGLNQFQGSVPSDIGTCSTLQRLILRRNNLIGTLPEFKRNHGLRFVDASENNLNGTIPSSLGNCINLTSINLSSNKLTGRIPDELGYLVNLQSLSLSHNILDGPLPSSLSNCTKLDKFDVGFNLLNGSVPRGLASWKVISTLILKENRFTGGILNVLSELDSLSLLDLGGNLFGGEIPSSLGALKNLFYSLNLSNNALTGQLPFELASLVKLGELDISHNNLTGSLSVLGELSSSLLELNISDNLFTGPVPQTLMKLLNSDPSLFSGNPGLCISCDGLDGLSCSRTSSIKPCASRSSSRLSNIQIAMIALGSSIFIVLLLLGLVYKFVYRRRNKQNIETSVQVGETSLLNKVMEATDNLDERFVIGRGAHGVVYKASLDSNRTFAVKKLTFVGCKGGRQNMVKEIRTVGNIRHRNLITLEDFWLGKDHGLLLYRYQANGSLYDVLHGMNPSPALTWKVRYNIATGIAHGLAYLHYDCDPPIIHRDIKPQNILLDSEMEPRIADFGLAKLLDQTSASTTSSSFAGTIGYIAPENAFSAAKSKASDVYSYGVVLLELITGKKPSDASFTEFGSIMAWVRSVWNETEEIDRIVDPRLVEEVVNSDEKEQIKQLLMVVLRCTEREANKRPTMRDVVNHLIDSNTSHVRKYD 1110
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
1 117452 121271 + Carg04336-RA Car01g00022 140886
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car01g00022 1110 ProSiteProfiles Leucine-rich repeat profile. 674 696 IPR001611 GO:0005515
Car01g00022 1110 ProSiteProfiles Protein kinase domain profile. 822 1100 IPR000719 GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
Car01g00022 1110 ProSitePatterns Protein kinases ATP-binding region signature. 828 851 IPR017441 GO:0005524
Car01g00022 1110 Pfam Protein kinase domain 827 1097 IPR000719 GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
Car01g00022 1110 Pfam Leucine rich repeat N-terminal domain 32 70 IPR013210 -
Car01g00022 1110 ProSitePatterns Serine/Threonine protein kinases active-site signature. 944 956 IPR008271 GO:0004672|GO:0006468
Car01g00022 1110 Pfam Leucine rich repeat 290 349 IPR001611 GO:0005515
Car01g00022 1110 Pfam Leucine rich repeat 512 562 IPR001611 GO:0005515
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Car01g00022 Car-Chr1:117452 Car14g01670 Car-Chr14:13300897 0 dispersed
Car01g00022 Car-Chr1:117452 Car06g01091 Car-Chr6:8200827 0 transposed
       

Transcription factors information

Select Gene Hmm_acc Hmm_name Score E-value Regulatory Factors Family
88571 PF00069 Pkinase 4.40E-47 CL0016 Car PK
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car01g00022 - - csv:101204561 1691.01