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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cco03g1433 TGTGAGCATGCATATTCACTTGCGCAAAACCTGGATCCTAATAGTGAAGGAAGAGGTGTTTTGCAATTCAAAACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTAGCCAAGAGGGAGGGTGGAACCATAGATAGAAGCCAGGACATTACTCGGCTGCAGGAGTTCTACAAACTATACCGAGAGAAAAATAATGTAGATAAGCTTCGGGAAGATGAAATGAAATTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGTGGTAATCTTGGAGAGTTGGAACGAAAAACGTTGAAGCGAAAAAAGGTCTTTGCAACCCTGAAAGTATTAGGAATGGTACTGGAGCAACTCAGTGATGCAATTCCTGAAGAGATGAAAAGACTCATGGAATCGGATGCGGCAATGACAGAGGACCTGATTGCATATAATATTATTCCATTAGATGCTCCTTCTATGACAAATGCTATTGGGTCCCTCGTTGAGGTGCAAGCAGCAGTGTCAGCTTTAAAGTATTTCAGTGGCCTTCCAAAGTTGCCCGCAGAATTTTCTGTTCCGGAGACTAGGAGCCCTGATATACTTGACTTCCTACACTTCATTTTTGGATTTCAGAAAGACAATGTGGCTAATCAGCGCGAACATGTAGTGCACCTACTTGCCAATGAACAATCTCGCCTTCGTATTCCTGAAGAAACTGAACCAAAGTTGGATGAAGCTGCTGTGGAGGGTGTTTTTAAGAAGTCTCTGGAAAACTACGTTAAATGGTGTGAATATTTATGCATTCAACCTGTTTGGAGCAGCTTGTCTGCTGTTAGCAAGGAAAAGAAGCTATTATTTATTTCCTTATACTTTCTTATATGGGGGGAAGCAGCCAACGTCAGATTTCTTCCAGAATGCTTATGCTACATATTTCACCATATGGTTCGGGAAATGGATGAGGTATTGAGGCATCAGATTGCGCAGCCGGCCAAGAGCTGTGAGTCTAAAGATGGTGTTTCTTTCCTTGATCAAGTTATCTGTCCTCTTTATGAAGTTATGGCTGCGGAAGCTGCAAACAATAATAATGGGCAGGCACCACATTCTGCATGGAGAAACTATGATGATTTTAACGAGTATTTCTGGTCACTTAGATGCTTTGACCTCAGTTGGCCATGGCACAAAGGCAAATCTTTTTTCCAAAAGCCAACACCAAAATCGAAGAATATGCTTGGTAGAAGTCGTCATCAAGGGAAAACGTCATTTGTTGAGCATCGGACTTTTCTTCATCTTTATCACAGTTTCCATCGTTTATGGATATTTTTGGTTATGATGTTCCAGGCTTTGACCATTGTTGCATTTAACAATGGAAGCTTTAATATGAAGACACTGCTCGAAGTTCTGAGTCTTGGTCCGACGTTTGTTGTAATGAAGTTTATTGAGAGTGTTCTAGACATCCTAATGATGTATGGTGCATACTCTACTTCAAGGCGCCTTGCTGTCTCTCGAATTTTTCTTCGTTTTCTTTGGTTTAGTATTGCATCAGCTTCGATAACATTTCTTTATGTGAAATCTCTTCAGGAGGGGAGTAAACCGAATGCAGAAAGAGTGATGTTTAGACTATATGTAATTGTGATTGCAATATATGGTGGTGTGCAGCTTTGTCTCAGTATCCTCATGCGTATACCTGCTTGCCATCTTTTAACGAATCAATGTGATCGGTGGCCTCTTGTGCGTTTTATCAAGTGGATGCGTCAGGAACGGTACTATGTTGGACGTGGGATGTATGAGAGGACTACTGACTTTATCAAATACATGCTTTTGTGGATTATCATTCTGGGTGGAAAATTTGCATTTGCCTATTTTCTTCAGATCAAGCCTCTTGTTGAACCTACCAGGCTTATTGTAAATATGAGAGATATAAGATATTCGTGGCATGACTTTGTGTCTAAAAATAATCATAATGCTTTGACTATTCTTAGCTTATGGGCCCCCGTGGTCGCTATTTATATCTTGGACGTTCATGTGTTTTATACTATTATATCGGCTATTTGGAGTTTCTTAATTGGGGCAAGAGATCGTCTTGGTGAGATTAGATCATTGGAAGCCCTACATAAGCTGTTCGAGCAGTTTCCTGGAGCTTTTATGGACACTCTACATGTTCCTCTCCAAGACAGGCTTGGGTTTTCAAATCGGTCTTCAAGTCAGGTTGTTGAGAAAGACAAGTTCGATGCTGCTCGATTTTCTCCTTTCTGGAATGAAATCATAGCAAGTTTACGGGAAGAAGATTATATTACAAATTTGGAAATGGAGTTACTTCAAATGCCTAAAAACAAGGGTAATCTTCCCATGGTTCAGTGGCCCCTTTTTCTTCTTGCCAGCAAGATATTTCTAGCTAAGGATATTGCTGTTGAGAGACGAGATTCACAAGCCGAGTTGTGGGAGCGTATTTCAAGAGATGACTATATGAAATATGCAGTACAGGAATGTTACCACGCCATTAAGCTTATCTTAACGGAATTACTAGTTGGGGAAGGAAGGATGTGGGTTGAAAGGGTATTTGAAGACATTCAAGCTAGTATAGCAAACAATTCCATTATAAATGACTTCCAGCTAAATAAGCTGCCACTTGTGATTACAAGAATAACTGCTCTGACGGGTATTCTGAAAGAGCCAGAAACTTCAGAGCTGGAAAAAGGGGCTGTAAAGGCTGTTCAAGATTTGTATGATGTTGTGCACTATGATATCCTTTTCGGTGACAAGAGGGGGCACTATGAAACATGGAACATATTAGTAAAAGCCAGAAATGAAGGTCGCTTGTTTACAAAGTTAAATTGGCCGAAAGATCCAGAATTGAAGTCACAAGTCAAAAGATTGCATTCCCTCTTAACCATTAAAGATTCAGCTTCAAATATTCCAGTTAATCTTGAGGCCCGACGAAGACTGCAATTCTTTACAAATTCACTTTTTATGGTGATGCCAACTCCAAAACCTGTTCGTCAGATGCTTTCCTTCAGTGTATTCACTCCATATTATTCCGAGACGGTGCTCTATAGTATGGGGGAACTCCTGAAGAAAAATGAGGATGGGATAACAACCTTGTTTTACTTGCAAAAAATTTATCCAGATGAATGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGCCGAGATGAGAATGAAGTTGACCCAGAATCGTTTGACAACCCTAATGACATCCTTGCACTGCGGTTTTGGGCCTCTTATCGGGGACAGACGTTAGCAAGAACTGTTCGTGGAATGATGTACTATAGGAAAGCTCTTATGCTGCAGACTTATTTAGAGAGAGGAACCTATGGAGATTTGGAAGCTGCCATTCCTTGTACTGATGCTACTGATACTCGAGGTTTCGATTTATCTCCTGAAGCACGTGCACAGGCAGATCTTAAATTTACATATGTTGTGACGTGTCAGATATATGGAAGACAAAGAGAACAACAAAAACCGGAGGCCTCTGACATTGCACTGCTCATGCAAAGGAATGAAGCCCTTCGTGTTGCGTACATTGATGATATTGAAACCCTAAAGGATGGTAAGGTGCACAAAGAATTTTACTCAAAGCTTGTAAAGGCTGATATCAATGGAAAAGATAAGGAGATATATTCAATCAAATTGCCTGGAGATCCAAAGTTGGGTGAAGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTATTGTTTTTACTCGTGGAAATGCTGTTCAGACAATTGATATGAATCAGGATAATTACTTTGAAGAAGCATTGAAGATGAGAAATCTTCTTGAGGAATTTGGTTGTGATCATGGTATTCGTCCTCCTACCATACTGGGTGTCAGGGAACATGTATTTACGGGGAGTGTTTCATCTCTTGCGTCATTCATGTCAAATCAAGAAGCTAGTTTTGTGACTCTTGGTCAGCGTGTTCTGGCAAATCCCTTGAAAGTGCGTATGCATTATGGCCATCCAGATGTTTTTGATAGGGTTTTTCATCTAACACGAGGTGGCATCAGCAAGGCCTCCCGTGTTATCAACATTAGTGAAGATATCTTTGCAGGATTTAATACAACATTGAGGCAAGGGAACGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTTGGTAAAGGACGAGATGTTGGTCTTAACCAGATTGCTCTTTTCGAAGGAAAGGTTGCTGGTGGTAACGGAGAACAAGTTCTTAGCCGTGATGTATATAGGCTTGGCCAACTGTTTGATTTTTTCCGGATGATGTCATTCTATTTCACCACTGTGGGCTACTATTTTTGTACTATGTTAACGGTGCTGACTGTGTACATTTTTCTCTATGGAAAAGCATATTTGGCACTATCTGGAGTTGGTGAGACCATTGAAGATAGAGCTAATATTACAGATAATACGGCATTGTCAGCTGCTTTGAATACACAGTTCCTCATCCAAATTGGTATCTTCACTGCCGTGCCTATGATCTTGGGGTTCATATTGGAGCAAGGTTTCTTCAGGGCTATTGTCAGCTTCATAACCATGCAGCTTCAGCTTTGTTCTGTCTTCTTCACATTCTCTCTTGGCACAAAAACTCACTATTTTGGCCGAACAATTCTTCATGGTGGCGCAAAGTATCATGCAACTGGAAGGGGATTTGTGGTTCGCCATATCAAATTCTCTGAAAATTACAGATTGTACTCCCGCAGCCATTTTGTTAAAGGATTGGAAGTTGTGCTTCTGTTGGTTGTATACATGGCCTATGGATATAGTTCAGGTGGTTCGTTAGCATACATCCTTGTAACTCTTAGCAGTTGGTTCATGGCAATATCTTGGCTTTTTGCTCCCTATCTGTTCAACCCGTCAGGGTTTGAGTGGCAGAAGACCGTGGAGGATTTCAGGGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGAGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAAGCATGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAAACCATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACAATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGAATTGTTTATAAGCTCCATGTGCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGTTCTCTTGGATTGTGTTAGCTGGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTCAGCCAAAAGATGACCGTCAATTTTCAGCTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTCTTTCCTTTTGACATTAGCTGGCCTGGCAGTTGCGGTTGCTATTACAGATTTGTCACTGCCTGATGTGTTTGCTTGCATCTTGGCATTTGTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTTTAATAAAGAAACTGGGACTCTGGAAATCCATTCGCTCAATTGCTCGGCTGTATGATGCCGGGATGGGGATGCTCATCTTTATCCCCATTGCATTCCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCGACATTTCAAACTCGTCTTATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTCGAGATCTCTCTAATTCTTGCTGGAAACAATCCCAACACTGCCTTATGA 5508 40.92 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1835
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 28555120 28620526 + CcPI632755_03g014330.1 Cco03g1433 174792
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cco03g1433 1835 SMART FKS1_dom1_2 268 380 IPR026899 -
Cco03g1433 1835 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 3 1829 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Cco03g1433 1835 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 958 1648 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
Cco03g1433 1835 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 270 377 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 Cco06g1969 Cco-Chr6:29819166 0.00E+00 dispersed
Cco03g1426 Cco-Chr3:28485456 Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 0.00E+00 proximal
Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 Cco03g1435 Cco-Chr3:28649245 3.10E-144 proximal
Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 Cco03g1436 Cco-Chr3:28671516 9.10E-96 proximal
Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 Cco03g1437 Cco-Chr3:28717903 0.00E+00 proximal
Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 Cco03g1439 Cco-Chr3:28743102 2.50E-130 proximal
Cco03g1433 Cco-Chr3:28555120 Cco03g1434 Cco-Chr3:28638775 2.70E-39 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cco03g1433 K11000 - csv:101216435 3535.73