Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cco06g1353 ATGGGCGTCACCATTCTTCCAGATCTCGGGGCTCAGATTTTCATTCCCCTTTGTGCTCTAGTCGGAATCCTCTTCTCTTTGGTGCAGTGGTACTACGTTTCACAAGTTAAGCTCTCTTCTTCCCGAGATTCCTCTAATAACAACTCCGCCGCTGCTAAAAATGGCTACTCCGACTACCTTATTGAGGAGGAAGAAGGTGTCAACGACCATAACGTTGTTATTAAATGTGCCGAAATTCAGAACGCCATCTCTGAAGGGGCAACCTCCTTCCTTTTCACGGAGTACTACTATGTTGGCATATTTATGGTATTGTTTGCAGTCTTGATTTTTGTATTCCTTGGGTCAGTTGAGGGGTTTAGTACCAAGCCCCAAGCGTGCTCATATGACAAAACAAAGACTTGCAAACCAGCTTTGGCGACGGCTATATTCAGCACTATATCATTTATACTTGGTGCAGTTACTTCAGTGGTTTCTGGATTCCTTGGAATGAAAATTGCTACATATGCAAATGCCAGAACCACCTTGGAGGCAAGAAAAGGTGTTGGAAAAGCATTTATTACTGCTTTTAGGTCTGGTGCTGTCATGGGCTTCCTCCTAGCTGCCAATGGTCTCTTGGTTTTGTTTATTGCCATTAACCTCTTCAAATTGTACTATGGTGAAGATTGGGGTGGTCTTTTTGAGTCTATCACTGGGTATGGTCTTGGTGGATCTTCCATGGCTCTCTTTGGTAGAGTTGGTGGTGGTATCTACACTAAAGCTGCTGATGTTGGTGCTGACCTTGTGGGTAAGGTGGAAAGGAACATTCCTGAGGATGATCCAAGAAATCCAGCTGTGATTGCTGATAACGTCGGTGACAATGTTGGGGATATTGCCGGTATGGGATCTGATCTTTTTGGTTCATATGCTGAATCATCCTGTGCTGCTCTTGTTGTTGCTTCTATCTCCTCCTTCGGCAACAACCATGAGTTCACACCAATGCTCTATCCACTCATAGTTAGTTCTATGGGTATCCTTGTTTGCCTGATCACCACTTTATTTGCAACTGATTTCTTTGAGATCAAGGCTGTTAAGGAAATTGAGCCAGCATTGAAGAAGCAACTCATAATTTCCACTGTTCTAATGACCTTTGGAATTGCAATTGTTACTTGGTTGGCTGTTCCATCGAAATTCACCATCTTCAATTTTGGAACTCAAAAAGTTGTACAGAACTGGGAACTTTTCTTGTGCGTTGCTGTTGGTCTTTGGGCTGGGCTTATAATAGGATTTGTGACAGAGTATTACACTAGCAATGCATACAGCCCCGTGCAAGATGTTGCTGATTCTTGCCGAACTGGAGCTGCTACAAATGTTATTTTTGGCTTGGCCTTGGGATACAAATCTGTCATTATCCCTATTTTTGCAATTGCAGTTAGCATTTTTGTGAGTTTCTCCTTTGCTGCAATGTATGGCATTGCCGTTGCTGCCCTTGGAATGTTGAGTACAATTGCTACTGGTTTGGCCATTGATGCATATGGTCCAATCAGTGACAATGCTGGAGGCATTGCAGAGATGGCTGGCATGAGCCACAGAATTCGGGAGAGAACCGATGCCCTCGATGCTGCTGGAAACACAACTGCAGCCATTGGAAAGGGTTTTGCCATTGGGTCAGCTGCTCTTGTGTCCCTTGCCCTCTTCGGTGCCTTTGTCAGCCGTGCTGGTGTCAGTGTTGTTGATGTCTTGACACCCAAAGTTTTCATTGGCTTGATCGTGGGTGCTATGTTGCCCTACTGGTTTTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTTGGGAGTGCAGCCCTAAAGATGGTTGAGGAGGTGCGAAGGCAATTTAACACCATCCCAGGTCTCATGGAGGGTACCGCCAAGCCCGACTATGCTACATGTGTCAAGATCTCAACTGATGCTTCTATCAAGGAGATGATCCCACCAGGTGCCCTTGTCATGTTGACACCCCTAATTGTTGGTATCCTATTTGGAGTTGAAACTCTTTCTGGCGTTCTTGCTGGATCCCTTGTTTCTGGTGTGCAGATTGCTATCTCTGCATCCAACACCGGAGGTGCCTGGGACAATGCTAAGAAGTACATCGAGGCTGGTGCCTCTGAGCATGCAAGAACCCTTGGCCCGAAAGGATCAGATCCACACAAAGCCGCTGTTATCGGTGACACAATCGGAGACCCACTCAAGGATACATCGGGACCTTCCCTCAACATTCTTATCAAGTTGATGGCTGTTGAGTCCCTTGTGTTTGCTCCTTTCTTCGCCAGTCACGGTGGTATTCTCTTCAAGATCTTCTAA 2307 45.64 MGVTILPDLGAQIFIPLCALVGILFSLVQWYYVSQVKLSSSRDSSNNNSAAAKNGYSDYLIEEEEGVNDHNVVIKCAEIQNAISEGATSFLFTEYYYVGIFMVLFAVLIFVFLGSVEGFSTKPQACSYDKTKTCKPALATAIFSTISFILGAVTSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLAANGLLVLFIAINLFKLYYGEDWGGLFESITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGNNHEFTPMLYPLIVSSMGILVCLITTLFATDFFEIKAVKEIEPALKKQLIISTVLMTFGIAIVTWLAVPSKFTIFNFGTQKVVQNWELFLCVAVGLWAGLIIGFVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAVSIFVSFSFAAMYGIAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAGVSVVDVLTPKVFIGLIVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGTAKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLTPLIVGILFGVETLSGVLAGSLVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSDPHKAAVIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFASHGGILFKIF 768
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 24028856 24033256 + CcPI632755_06g013530.1 Cco06g1353 181953
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cco06g1353 768 Pfam Inorganic H+ pyrophosphatase 74 753 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cco06g1353 768 Hamap Putative K(+)-stimulated pyrophosphate-energized sodium pump [hppA]. 9 758 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cco06g1353 768 PANTHER K(+)-INSENSITIVE PYROPHOSPHATE-ENERGIZED PROTON PUMP 6 766 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cco06g1353 768 NCBIfam V-type H(+)-translocating pyrophosphatase 12 763 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cco06g1353 768 PIRSF H+-PPtase 12 766 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cco02g1629 Cco-Chr2:28901797 Cco06g1353 Cco-Chr6:24028856 0.00E+00 dispersed
Cco06g1353 Cco-Chr6:24028856 Cco09g0173 Cco-Chr9:1568553 1.60E-115 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cco06g1353 K23025 - csv:101222673 1443.71