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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cec03g1443 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AGGGTTTGAGTGGCAGAAGACCGTGGAGGATTTCAGGGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGAGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAAGCATGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAAACCATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACAATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGAATTGTTTATAAGCTCCATGTGCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGTTCTCTTGGATTGTGTTAGCTGGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTCAGCCAAAAGATGACCGTCAATTTTCAGCTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTCTTTCCTTTTGACGCTAGCTGGCCTGGCAGTTGCTGTTGCTATTACAGATTTGTCACTGCCTGATGTGTTTGCTTGCATCTTGGCATTTGTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTTTAATAAAGAAACTGGGACTCTGGAAATCCATTCGCTCAATTGCTCGGCTGTATGATGCTGGGATGGGGATGCTCATCTTTATCCCCATTGCATTCCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCGACATTTCAAACTCGTCTTATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTCGAGATCTCTCTAATTCTTGCTGGAAACAATCCCAACACTGCCTTATGA 5712 40.93 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1903
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 32137507 32202870 + CePI673135_03g014430.1 Cec03g1443 199067
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cec03g1443 1903 Gene3D - 33 187 IPR023175 -
Cec03g1443 1903 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 36 1897 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Cec03g1443 1903 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1026 1716 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
Cec03g1443 1903 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
Cec03g1443 1903 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cec03g1443 Cec-Chr3:32137507 Cec06g1965 Cec-Chr6:32898396 0.00E+00 dispersed
Cec03g1443 Cec-Chr3:32137507 Cec03g1445 Cec-Chr3:32249727 4.30E-93 proximal
Cec03g1443 Cec-Chr3:32137507 Cec03g1446 Cec-Chr3:32262407 1.20E-212 proximal
Cec03g1443 Cec-Chr3:32137507 Cec03g1448 Cec-Chr3:32319599 0.00E+00 proximal
Cec03g1442 Cec-Chr3:32102114 Cec03g1443 Cec-Chr3:32137507 0.00E+00 tandem
Cec03g1443 Cec-Chr3:32137507 Cec03g1444 Cec-Chr3:32230110 4.10E-19 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cec03g1443 K11000 - csv:101216435 3674.79