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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cec03g1454 ATGGGCGATTCTTTGTGCAACGATGTTCTTCCTCGACTTTCTGAAGAGAGTCCTTTAACATATCCAAAGGGTAAGCCAACCCCTTTTGAAAAATCCTATTGGAATTTGCAACACAATCCTCCAGATAATGGCCAAACAATACATTCTTTAAGTCACCCAGATGAAGATGTACGAAAACAAAGCATGTTGAGGCCTCTGTTTTCTAACCATGTCTGCATAGCTTACCTTATTGGTGTTGAACTTGAACGAGGCTTGAGGATGCTTGAGAATGGCAGTCCATCGACTTTGCAGCTTCCTATTTCCACGGCTTGTGACATAATTTTGATTAGATCATTAGAAGCCATACATAAACTGTTTAAGCGGTTTCCTGGAGCTTTTATGGACACTCTACATGTTCCTCTCCAAGACAGGCTTGGGCCTTCGAATCGGTCATCAAGTCAGGTTGTTGAGAAAGACAAGTTTGATGCTGCTCGATTTTCTCCCTTCTGGAATGAAATCATAGCAAGTTTACGGGAAGAGGATTATATTACAAACTTGGAAATGGAGTTACTTCAAATGCCTAAAAACAATGGTAATCTTCCCATGGTTCAGTGGCCACTTTTTCTTCTTGTCAGCAAGATATTTCTAGCTAAGGATATTGGTGTTAAAAAACAAGATTCGCAAGACAAGCTGTGGAAGCGTATTTCCAGAGATGACTATATGAAATATGCAGTACAGGAATGTTACCATGCCATTAAGCTTATCTTAACGGAATTACTAGTTGGGGAAGGAAGGATGTGGGTTGAAAGGGTATTTGAAGACATTCAAGCTAGTTTAGCAAACAATTCCATTCTAAATGACTTCCAGCTAAATAAGTTGCCACTTGTGATTACAAGAGTAAATGCTCTGACGGGTATTTTGAAAGAGCCAGAAACTTCGGAGCTGGAAAAAGAGGCTATTAAGGCTGTTCAAGATTTGTATGATGTTGTGCACCATGATCTCCTTTCCAGTGACAAGAGGGGGCACTATGAAACATGGAACATATTAGTAAAAGCCAGAAATGAAGGTCGTTTGTTTACAAAGTTAAATTGGCCCAAAGATTTAGAATTGAAGTCACAAGTCAAAAGATTGTATTCCTTGTTAACCATTAAAAAGACAACTTCAGATATTCCATTTAACTTTGAGGCCCAACGGAGACTGCAATTCTTTACAAATTCACTTTTCATGGTGATGCCAACGCCAAAACTTGTTCGTCAGATGCTTTCCTTCAGTGTATTCACTCCGTATTATTCTGAGACGGTGCTCTATAGTATGGGGGAACTCCTGAAGAAAAATGAGGATGGGATAACAACCTTGCTTTACCTGCAAAAAATTTATCCAGATGAGTGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGCCGAGATGAGAATGAAGTTGACCCAGAATCGTTTGATAATCCTAATGACATCCTTGCATTGCGATTTTGGGCCTCTTATCGTGGACAAACATTAGCAAGAACAGTTCGTGGAATGATGTACTATAGGAAAGCTCTTATGCTGCAGACTTATTTAGAGAGAGGAACTTATGGAGACTTCGAAGCTGCCATTCCTTGTACTGATGCTACTGATACTCGGGGTTTCGATTTATCTCCTGAAGCACGTGCACTAGCAGATCTTAAATTTACATATGTTGTGACATGTCAGATATATGGCAGACAAAGAGAACAACAAAAACCAGAGGCCGCTGACATTGCATTGCTTATGCAAAGAAATGAAGCCCTTCGTGTTGCCTACATCGATGATATTGAAACCCTGAAGGATGGTAAGGTGCACAAAGAATTTTACTCAAAGCTTGTAAAGGCTGATATCAATGGAAAAGATAAGGAGATATATTCAATCAAATTGCCTGGAGATCCAAAGTTGGGTGAAGGAAAGCCTGAGAATCAAAACCATGCTATTGTTTTTACTCGTGGAAATGCTATTCAGACAATTGATATGAATCAGGATAATTACTTTGAAGAAGCATTGAAGATGAGAAATCTTCTCGAGGAATTTGATCATGATCATGGTATTCGTCCTCCTACCATACTGGGTGTCAGGGAACATGTATTTACGGGGAGTGTTTCATCTCTTGCTTCATTCATGTCAAATCAAGAAGCTACTTTTGTGACTCTTGGTCAACGTATTCTGGCAAATCCCTTGAAAGTGCGTATGCATTATGGCCATCCAGATGTTTTTGATAGGGTTTTTCATCTAACACGAGGTGGCATCAGCAAGGCCTCCCGTGTTATCAACATTAGTGAAGATGTCTTTGCAGGATTTAATACAACATTGAGGCAAGGGAACGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTCGGTAAAGGACGAGATGTTGGTCTTAACCAGATTACTCTTTTCGAAAGAAAGGTTGCTGGTGGTAATGGAGAACAAGTTCTTAGCCGAGATGTATACAGGCTTGGCCAACTGTTTGATTTTTTCCGGACAATGTCATTCTATTTCACCACTGTTGGCTACTACTTTTGTACTATGTTAACAGTGCTAACTGTATACATTTTTCTCTATGGAAAAGCATATTTGGCACTATTTGGAGTTGGTGAGACCATTGAAGATAGAGCTAATATTGCAAATATTATCACATTGTCAACTACTTTGAATACACAGTTCCTCATCCAAATTGGTATTTGCACTGTCGTGCCGATCTTAGGATTCATATCAGAGCAAGGTTTCTTCAAGACTATTGTCAGCTTCATAACCATGCAGCTTCAGCTTTGTTCTATCTTCTTCACATTCTCTCTTTGCACAAAAACTCACTATTTTGGCCGAACAATTCTTCATGGCGGTGCAAAGTATCAAGCAACTGGAAGGGGATTGGTGGTTCGCCATATCAAATTCTCTGAAAATTACAGATTGTACTCCCGCAGCCATTTTGTTAGAGGATTGGAAGCTGTGCTTCTGTTGGTTGTATACATGGCCTATGGATATAGTTCAGGTGGTTCATTAGCATACATCCTTGTAACTCTTAACAGTTGGTTCATGGCAATATCTTGGCTTTTTGCTCCCTATCTGTTCAATCCATCTGGGTTTGAGTGGCAGAAGACTGTGGAGGATTTCAGGGAATGGACCAATTGGCTCTTTTACCAAGGTGGAGTTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAATCATGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAAACCATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACAATTTTAAATCTAAGATTCTTTCTTTTTCAATATGGAATTGTTTATAAGCTCCATGCACAAGGATCAAACACATCAGTGTCGGTATATGGGTTCTCCTGGATTGTGTTAGCTTGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTCAGCCAGAAGATGTCGGTCAATTTTCAGTTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTTCTTCCTTTTGACACTGGCTGGCCTGGCAGTTGCATTTGCTATTATGGATTTGTCAATGCTTGATGTACTTGCTTGCATCTTGGCATTTGTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGTAGCTTGGAAACCTTTAATAAAGAAACTTGGACTCTGGAAATCCATTTGCTCAATTGCTCAGCTGTACGATGCCGGGATGGGGATGCTCATCTTTATCCCCATTGCATTCCTTTCATGGCTTCCATTTGTATCAACATTCCAAAATTTTCTTATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTTGAGATCTGTCTAACTCTTGCTGGAAAAAAACCCAACACTGCCCTATGA 3780 40.08 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1259
       

Gff information


Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 32420743 32447384 + CePI673135_03g014540.1 Cec03g1454 199078
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cec03g1454 1259 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 109 1254 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Cec03g1454 1259 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 384 1074 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
       

Duplication type information


Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cec03g1448 Cec-Chr3:32319599 Cec03g1454 Cec-Chr3:32420743 0.00E+00 dispersed
Cec03g1454 Cec-Chr3:32420743 Cec06g1965 Cec-Chr6:32898396 0.00E+00 dispersed
Cec03g1449 Cec-Chr3:32342776 Cec03g1454 Cec-Chr3:32420743 4.60E-131 proximal
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cec03g1454 K11000 - csv:101216435 2062.34