Gene search
Sequence information
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cec06g0735 | ATGGTTGTTTTTCGTATAGGAATTTTAAAGGAATTGGAAATCAGAGAAACTGTGAAAGATCAAAACAGAAGGACTGCTAAGGCGGGAATCAAGAAAGCTTTGGCAACAATAAATGGTATTGTCTTTGTGTTTGTGCTTTCTGGTTATGACGGAAATTCGACGAAGTATTTAGAGATGGGAAAATGGTTCGCTAGTGTGTGGTATTTCAAGCCTCAACCAAAACCCACATCACTTGAAGATGTCAGTGGTGAGCCGGCAACAGGTGCTGTCAATTGGACACAAAGATAG | 288 | 40.28 | MVVFRIGILKELEIRETVKDQNRRTAKAGIKKALATINGIVFVFVLSGYDGNSTKYLEMGKWFASVWYFKPQPKPTSLEDVSGEPATGAVNWTQR | 95 |
Gff information
| Chromosome | Start | End | Strand | Old_gene | Gene | Num |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 6 | 8511126 | 8511413 | - | CePI673135_06g007350.1 | Cec06g0735 | 205472 |
Annotation
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cec06g0735 | 95 | MobiDBLite | consensus disorder prediction | 74 | 95 | - | - |
Pathway
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cec06g0735 | - | - | - | - | 0.0 |
Deco-Alignment
| Select | Vvi1 | Blo1 | Blo2 | Bda1 | Bda2 | Bpe1 | Bpe2 | Bma1 | Bma2 | Cmo1 | Cmo2 | Cma1 | Cma2 | Car1 | Car2 | Sed1 | Cpe1 | Cpe2 | Bhi1 | Tan1 | Cmetu1 | Lac1 | Hepe1 | Mch1 | Lcy1 | Cla1 | Cam1 | Cec1 | Cco1 | Clacu1 | Cmu1 | Cre1 | Cone1 | Cone2 | Cone3 | Cone4 | Lsi1 | Csa1 | Chy1 | Cme1 | Blo3 | Blo4 | Bda3 | Bda4 | Bpe3 | Bpe4 | Bma3 | Bma4 | Sed2 | Cmo3 | Cmo4 | Cma3 | Cma4 | Car3 | Car4 | Cpe3 | Cpe4 | Bhi2 | Tan2 | Cmetu2 | Lac2 | Hepe2 | Mch2 | Lcy2 | Cla2 | Cam2 | Cec2 | Cco2 | Clacu2 | Cmu2 | Cre2 | Lsi2 | Csa2 | Chy2 | Cme2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Vvi5g730 | . | . | . | . | . | Bpe14g01263 | . | . | . | . | Cma06g01315 | . | Car06g01130 | Car14g01631 | . | Cpe08g00340 | Cpe03g01523 | Bhi01g00717 | . | . | . | Hepe05g1665 | . | . | Cla06g00677 | Cam06g0727 | Cec06g0735 | Cco06g0744 | Clacu06g0719 | Cmu06g0703 | Cre06g1475 | . | . | Cone7ag0331 | Cone4ag0336 | Lsi05g01742 | Csa02g01049 | Chy05g00311 | Cme06g00480 | . | Blo07g00270 | Bda11g00638 | Bda13g00056 | . | Bpe13g00551 | Bma02g00768 | Bma06g01605 | Sed02g1415 | Cmo06g01323 | Cmo14g01859 | . | . | Car08g00948 | Car17g00136 | Cpe12g00131 | Cpe17g00202 | Bhi12g01601 | Tan06g2396 | Cmetu06g1413 | . | . | . | Lcy13g0388 | Cla05g00436 | Cam05g0475 | Cec05g0484 | Cco05g0484 | Clacu05g0472 | Cmu05g0450 | Cre05g0512 | Lsi09g01222 | Csa03g01198 | Chy06g00462 | Cme05g00582 |
Syn-Orthogroups
| Select | Orthogroup | Bda | Bhi | Blo | Bma | Bpe | Cam | Car | Cco | Cec | Chy | Cla | Clacu | Cma | Cme | Cmetu | Cmo | Cmu | Cone | Cpe | Cre | Csa | HCH | Hepe | Lac | Lcy | Lsi | Mch | Sed | Tan | Vvi | Total |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| OG0039308 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |