Gene search
Sequence information

Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
---|---|---|---|---|---|---|
Cec06g1345 | ATGGGCGTCACCATTCTTCCAGATCTCGGGGCTCAGATTTTCATTCCCCTTTGTGCTCTAGTCGGAATCCTCTTCTCTTTGGTGCAGTGGTACTACGTTTCACAAGTTAAGCTCTCTTCTTCCCGAGATTCCTCTAATAACAACTCCGCCGCTGCTAAAAATGGCTACTCCGACTACCTTATTGAGGAGGAAGAAGGTGTCAACGACCATAACGTTGTCATTAAATGTGCCGAAATTCAGAACGCCATCTCTGAGGGGGCAACCTCCTTCCTTTTCACGGAGTACTACTATGTTGGCATATTTATGGTATTGTTTGCAGTCTTGATTTTTGTATTCCTTGGGTCAGTGGAGGGTTTTAGTACCAAGCCCCAAGCATGCTCATATGACAAAACAAAGACTTGCAAGCCAGCTTTGGCGACGGCTATATTCAGCACTGTATCATTTATACTTGGTGCAGTTACTTCAGTGGTTTCTGGATTCCTTGGAATGAAAATTGCTACATATGCAAATGCCAGAACCACCTTGGAGGCAAGAAAAGGTGTTGGAAAGGCATTTATTACTGCTTTTAGGTCTGGTGCTGTCATGGGCTTCCTCCTAGCTGCCAATGGTCTCTTGGTTTTGTTTATTGCCATTAACCTCTTCAAATTGTACTATGGTGAAGATTGGGGTGGTCTTTTTGAGTCTATCACTGGGTATGGTCTTGGTGGATCTTCCATGGCTCTCTTTGGTAGAGTTGGTGGTGGTATCTACACTAAAGCTGCTGATGTTGGAGCTGACCTTGTGGGTAAGGTGGAAAGGAACATTCCTGAGGATGATCCAAGAAATCCAGCTGTGATTGCTGATAACGTCGGTGACAATGTTGGGGATATTGCCGGTATGGGATCTGATCTTTTTGGTTCATATGCTGAATCATCCTGTGCTGCTCTTGTTGTTGCTTCTATCTCCTCTTTCGGCAACAACCATGAGTTCACACCAATGCTCTATCCACTCATAGTTAGTTCTATGGGTATCCTTGTTTGCCTGATCACCACTTTATTTGCAACTGATTTCTTTGAGATCAAGGCTGTTAAGGAAATTGAGCCAGCATTGAAGAAGCAACTCATAATTTCCACTGTTCTAATGACCTTTGGAATTGCAATTGTTACTTGGTTGGCTGTTCCATCGAAATTTACCATCTTCAATTTTGGAACTCAAAAAGTTGTACAGAACTGGGAACTTTTCTTGTGCGTTGCTGTTGGTCTTTGGGCTGGGCTTATAATTGGATTTGTGACAGAGTATTACACTAGCAATGCATACAGCCCCGTGCAAGATGTTGCTGATTCTTGCCGAACTGGAGCTGCTACAAATGTTATTTTTGGCTTGGCCTTGGGATACAAATCTGTCATTATCCCTATTTTTGCAATTGCAGTTAGCATTTTTGTGAGTTTCTCCTTTGCTGCAATGTATGGCATTGCCGTTGCTGCCCTTGGAATGTTGAGTACAATTGCTACTGGTTTGGCCATTGATGCATATGGTCCAATCAGTGACAATGCTGGAGGCATTGCAGAGATGGCTGGCATGAGCCACAGAATTCGGGAGAGAACCGATGCCCTCGATGCTGCTGGAAACACAACTGCAGCCATTGGAAAGGGTTTTGCCATTGGCTCAGCTGCTCTTGTGTCCCTTGCCCTCTTCGGTGCCTTTGTCAGCCGTGCTGGTGTCAGTGTTGTTGACGTTTTGACACCCAAAGTTTTCATTGGCTTGATCGTGGGTGCTATGTTGCCCTACTGGTTTTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTTGGGAGTGCAGCCCTAAAGATGGTTGAGGAGGTGCGAAGGCAATTTAACACCATCCCAGGTCTCATGGAGGGTACCGCCAAGCCTGACTATGCTACATGTGTCAAGATCTCAACTGATGCTTCTATCAAGGAGATGATCCCACCAGGTGCCCTTGTCATGTTGACACCCCTAATTGTTGGTATCCTATTTGGAGTCGAAACTCTTTCTGGCGTTCTTGCTGGATCCCTTGTTTCTGGTGTGCAGATTGCTATCTCTGCATCCAACACCGGAGGTGCCTGGGACAATGCTAAGAAGTACATTGAGGCTGGTGCCTCTGAGCATGCAAGAACCCTTGGCCCGAAAGGATCAGATCCACACAAAGCCGCTGTTATTGGTGACACAATCGGAGACCCACTCAAGGATACATCGGGACCTTCCCTCAACATTCTTATCAAGTTGATGGCTGTTGAGTCCCTTGTGTTTGCTCCTTTCTTCGCCAGCCACGGTGGTATTCTCTTCAAGATCTTCTAA | 2307 | 45.69 | MGVTILPDLGAQIFIPLCALVGILFSLVQWYYVSQVKLSSSRDSSNNNSAAAKNGYSDYLIEEEEGVNDHNVVIKCAEIQNAISEGATSFLFTEYYYVGIFMVLFAVLIFVFLGSVEGFSTKPQACSYDKTKTCKPALATAIFSTVSFILGAVTSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLAANGLLVLFIAINLFKLYYGEDWGGLFESITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGNNHEFTPMLYPLIVSSMGILVCLITTLFATDFFEIKAVKEIEPALKKQLIISTVLMTFGIAIVTWLAVPSKFTIFNFGTQKVVQNWELFLCVAVGLWAGLIIGFVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAVSIFVSFSFAAMYGIAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAGVSVVDVLTPKVFIGLIVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGTAKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLTPLIVGILFGVETLSGVLAGSLVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSDPHKAAVIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFASHGGILFKIF | 768 |
Gff information

Chromosome | Start | End | Strand | Old_gene | Gene | Num |
---|---|---|---|---|---|---|
6 | 26962332 | 26966722 | + | CePI673135_06g013450.1 | Cec06g1345 | 206082 |
Annotation information

Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cec06g1345 | 768 | PIRSF | H+-PPtase | 12 | 766 | IPR004131 | GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro) | |
Cec06g1345 | 768 | NCBIfam | V-type H(+)-translocating pyrophosphatase | 12 | 763 | IPR004131 | GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro) | |
Cec06g1345 | 768 | PANTHER | K(+)-INSENSITIVE PYROPHOSPHATE-ENERGIZED PROTON PUMP | 6 | 766 | IPR004131 | GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro) | |
Cec06g1345 | 768 | Hamap | Putative K(+)-stimulated pyrophosphate-energized sodium pump [hppA]. | 9 | 758 | IPR004131 | GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro) | |
Cec06g1345 | 768 | Pfam | Inorganic H+ pyrophosphatase | 74 | 753 | IPR004131 | GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro) |
Duplication type information

Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | E-value | Duplicated-type |
---|---|---|---|---|---|---|
Cec02g1587 | Cec-Chr2:33439336 | Cec06g1345 | Cec-Chr6:26962332 | 0.00E+00 | dispersed | |
Cec06g1345 | Cec-Chr6:26962332 | Cec09g0180 | Cec-Chr9:1573248 | 6.90E-106 | dispersed |
Pathway information

Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
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Cec06g1345 | K23025 | - | csv:101222673 | 1443.33 |