Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cec06g1722 ATGAATCTCCTTGACAAATCCCTCATCTCTTCCACACCTCAATCTTTCATTACCTCAATACCCTCTTCTTCTTCAAAACCCCTTCGCTCCCATGCTATTCGATGTTCCGTTGCTGTGGCGCCTTCTGCTTCCACCAAGGTCTCGAAGGAATTCAAGTTGAGGTCTGTGAAGGCCCGGCAGATTATTGACAGTAGAGGCAATCCCACGGTCGAGGTTGATTTGATTACTGACGATCTCTACCGATCCGCTGTCCCCAGCGGGGCTTCCACTGGGATCTATGAGGCTTTGGAGCTTAGAGATGGGGATAAAACCGTTTATGGAGGTAAAGGTGTGCTTACTGCTGTTAAGAACATCAATGATATCTTGGCTCCTAAGCTCGTCGGCGTCGATGTCAGGAATCAAGAAGAAGTTGATGCAATCATGCTGGAAATTGATGGAACCCCGAACAAATCGAAACTTGGGGCAAATGCTATACTAGGAGTTTCTTTAAGCGTTTGCAGAGCTGGTGCTGGTGCCAAGGGACTACCATTGTACAGGCACATCCAAGAATTATCAGGCACCAAGGAACTTGTTATGCCAGTTCCTGCTTTTAATGTTATAAATGGGGGTAGCCATGCTGGAAATAATCTAGCAATGCAAGAATTTATGATCTTACCTGTAGGTGCTACATCTTTTGCAGAGGCACTGCGCATGGGAAGTGAAGTTTATCACACGCTTAAGGGAATTATTAAAGCAAAATATGGACAAGATGCCTGCAATGTAGGAGATGAGGGTGGATTCGCTCCAAATGTTCAAGATAACAGAGAAGGACTGGTGTTGCTTATTGATGCCATTGAAAAGGCTGGTTATACAGGAAAGATCAAAATAGGAATGGATGTTGCAGCTTCAGAGTTCTTCACTAAAGAGGGAAAATATGATCTGAACTTCAAGAAACAGCCAAACGATGGAGCTCATGTTCACTCAGCTCATGGCCTTGGCGAACTCTATAAACAGTTTGTCAAAGATTTTCCCATTGTTTCCATCGAGGACCCCTTTGATCAAGATGATTGGAGCTCTTGGGCTTCTCTACAATCTTCTGTTGATATCCAACTTGTGGGAGATGACTTGCTTGTAACAAATCCAAAGAGAATTGCTGAAGCCATTCAGAAAAAAGCTTGTAATGCTTTACTTCTGAAGGTTAACCAGATTGGATCAGTGACCGAATCAATTCAAGCTGCTCTTGATTCCAAGGCTGCTGGCTGGGGAGTGATGGTCAGCCACCGAAGTGGTGAAACTGAAGATAATTTTATTGCTGATCTTTCTGTTGGCTTAGCTAGTGGACAGATAAAAACTGGAGCTCCATGCCGAAGTGAACGGTTAGCCAAATATAATCAGCTTCTTCGCATTGAAGAAGAACTTGGCAGTGTTCGATATGCCGGTGCGTCGTTCAGATCACCTTAG 1440 44.31 MNLLDKSLISSTPQSFITSIPSSSSKPLRSHAIRCSVAVAPSASTKVSKEFKLRSVKARQIIDSRGNPTVEVDLITDDLYRSAVPSGASTGIYEALELRDGDKTVYGGKGVLTAVKNINDILAPKLVGVDVRNQEEVDAIMLEIDGTPNKSKLGANAILGVSLSVCRAGAGAKGLPLYRHIQELSGTKELVMPVPAFNVINGGSHAGNNLAMQEFMILPVGATSFAEALRMGSEVYHTLKGIIKAKYGQDACNVGDEGGFAPNVQDNREGLVLLIDAIEKAGYTGKIKIGMDVAASEFFTKEGKYDLNFKKQPNDGAHVHSAHGLGELYKQFVKDFPIVSIEDPFDQDDWSSWASLQSSVDIQLVGDDLLVTNPKRIAEAIQKKACNALLLKVNQIGSVTESIQAALDSKAAGWGVMVSHRSGETEDNFIADLSVGLASGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSVRYAGASFRSP 479
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 30759563 30762715 + CePI673135_06g017220.1 Cec06g1722 206459

Annotation

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cec06g1722 479 Gene3D - 47 174 IPR029017 -
Cec06g1722 479 FunFam Enolase 1 175 479 - -
Cec06g1722 479 Gene3D - 175 479 IPR036849 -
Cec06g1722 479 SFLD Enolase 54 466 - -
Cec06g1722 479 Pfam Enolase, C-terminal TIM barrel domain 190 477 IPR020810 -
Cec06g1722 479 SUPERFAMILY Enolase C-terminal domain-like 189 472 IPR036849 -
Cec06g1722 479 FunFam Enolase 51 174 - -
Cec06g1722 479 PRINTS Enolase signature 84 98 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PRINTS Enolase signature 211 224 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PRINTS Enolase signature 154 170 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PRINTS Enolase signature 418 435 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PRINTS Enolase signature 389 403 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PRINTS Enolase signature 366 377 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 CDD enolase 55 465 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PIRSF Enolase 49 478 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 PANTHER ENOLASE 53 477 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000015(PANTHER)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(PANTHER)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)|GO:0006096(PANTHER)
Cec06g1722 479 SMART Enolase_N_3 53 181 IPR020811 -
Cec06g1722 479 NCBIfam phosphopyruvate hydratase 55 475 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 Hamap Enolase [eno]. 51 466 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Cec06g1722 479 SUPERFAMILY Enolase N-terminal domain-like 53 184 IPR029017 -
Cec06g1722 479 Pfam Enolase, N-terminal domain 54 181 IPR020811 -
Cec06g1722 479 ProSitePatterns Enolase signature. 389 402 IPR020809 -
Cec06g1722 479 SMART Enolase_C_3 189 479 IPR020810 -
Cec06g1722 479 SFLD enolase 54 466 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
       

Pathway

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cec06g1722 K01689 - - csv:101209516 884.019
       

Dupl-types

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cec04g1126 Cec-Chr4:30851049 Cec06g1722 Cec-Chr6:30759563 4.10E-167 dispersed
       

Deco-Alignment

Select Vvi1 Blo1 Blo2 Bda1 Bda2 Bpe1 Bpe2 Bma1 Bma2 Cmo1 Cmo2 Cma1 Cma2 Car1 Car2 Sed1 Cpe1 Cpe2 Bhi1 Tan1 Cmetu1 Lac1 Hepe1 Mch1 Lcy1 Cla1 Cam1 Cec1 Cco1 Clacu1 Cmu1 Cre1 Cone1 Cone2 Cone3 Cone4 Lsi1 Csa1 Chy1 Cme1 Blo3 Blo4 Bda3 Bda4 Bpe3 Bpe4 Bma3 Bma4 Sed2 Cmo3 Cmo4 Cma3 Cma4 Car3 Car4 Cpe3 Cpe4 Bhi2 Tan2 Cmetu2 Lac2 Hepe2 Mch2 Lcy2 Cla2 Cam2 Cec2 Cco2 Clacu2 Cmu2 Cre2 Lsi2 Csa2 Chy2 Cme2
Vvi17g393 . . . . . . . . . . . . . Car11g00221 Sed12g2041 . Cpe04g01430 Bhi02g00032 Tan09g1975 Cmetu02g0279 . Hepe09g0308 . . Cla06g01505 Cam06g1660 Cec06g1722 Cco06g1717 Clacu06g1626 Cmu06g1575 Cre06g2385 . . Cone13ag0013 Cone19ag0011 . . . . . . . Bda14g00902 . Bpe15g00556 Bma03g00876 . . . Cmo11g00246 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lsi06g01369 Csa01g00309 Chy02g02429 Cme02g01786
       

Syn-Orthogroups

Select Orthogroup Bda Bhi Blo Bma Bpe Cam Car Cco Cec Chy Cla Clacu Cma Cme Cmetu Cmo Cmu Cone Cpe Cre Csa HCH Hepe Lac Lcy Lsi Mch Sed Tan Vvi Total
OG0011033 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30