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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Chy02g01392 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TGGGTTTGAGTGGCAAAAGACCGTGGAGGATTTCAGGGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGTGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAAGCATGGTGGGACTCGGAACTGGCGCACATAAAAACCTTTGAAGGCCGGATAGCAGAGACTATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATACGGAATTGTTTATAAGCTCCATGTGCAGGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGTTCTCCTGGATCGTGTTAGCTGGGCTTATCGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTCAGCCAGAAGATGACTGTCAATTTCCAGCTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTCTTTCTTTTTGACGCTGGCTGGCCTGGCAGTTGCGGTTGCTATTACAGATTTGTCACTGCCTGATGTATTTGCTTGCATCTTGGCATTCGTACCCACTGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTTTGATAAAGAGACTGGGACTCTGGAAATCCATCCGCTCAATTGCTCGGCTATATGATGCTGGGATGGGGATGCTCGTCTTTATTCCCATTGCATTCCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCGACATTCCAAACTCGTCTTATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTTGAGATCTCTCTAATTCTTGCTGGAAACAATCCCAACACGGCCCTATGA 5712 41.14 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1904
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
2 10668510 10725390 - Chy2G036590.1 Chy02g01392 220840
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Chy02g01392 1903 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
Chy02g01392 1903 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
Chy02g01392 1903 Gene3D - 33 183 IPR023175 -
Chy02g01392 1903 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1026 1715 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Chy02g01392 1903 Coils Coil 126 146 - -
Chy02g01392 1903 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1 1902 - -
Chy02g01392 1903 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1 1902 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Chy02g01392 Chy-Chr2:10668510 Chy02g02643 Chy-Chr2:29473072 0 dispersed
Chy11g00456 Chy-Chr11:4705800 Chy02g01392 Chy-Chr2:10668510 2.43E-08 dispersed
Chy02g01392 Chy-Chr2:10668510 Chy02g01393 Chy-Chr2:10752812 0 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Chy02g01392 K11000 - csv:101216435 3771.47