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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cla03g01332 ATGGCAGTAGGTGCTGGGGAATGGTCTGTTGTCTGTGAGCATGCATATTCACTTGCGCAAAACCTGGATCCTAATAGTGAAGGAAGAGGTGTTTTGCAATCCAAAACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTAGCCAAGAAGGAGGGTGGAACCGTAGATAGAAGCCAGGACATTACTCGGTTACAGGAGTTCTACAAACTATACCGAGAGAAAAATAATGTAGATAAGCTTTGGGAAGGTGAAATGAAATTTAGGGAATCTGGTGCTTCCAGTGGTAATCTTGGAAAGTTGGAACGGAAAACGCTGAAGCGAAACAAAGTCTTTGCAACCCTGAAAGTATTAGCAATGGTACTGGAGCAACTCAGTGATGCAATTCCTGAAGAGATGAAAAGACTCATGGAATTGGATGCAGCAATGACAGAGGACCTAATTGCGTATAATATTATTCCATTAGATGCTCCTTCTGTGACAAATGCTATTGGGTCCTTGACTGAGGTGCAAGCAGCAGTGTCAGCTTTAAAGTATTTCAGTGGCCTTCCAAAGTTGCCCGCAGAATTTTCCATTCCGGAGACCAGGAGTCCTGACATGCTTGACTTTCTACACTTCGTTTTTGGATTTCAGAAAGACAATGTGTCTAATCAGCGTGAACATGTAGTGCACCTACTTGCCAATGAACAATCTCGACTTCGTATACTTGAAGAAACTGAACCAAAATTGGATGCAGCTGCTGTGGAGGGTGTTTTTAAGAAGTCTCTGGAAAACTACGTTAAATGGTGTGAATATTTATGCATTCAACCTGTTTGGAGCAGTTTGTCTGCTGTTGGCAAGGAAAAGAAGCTATTATTTATTTCCTTATACTTTCTTATATGGGGGGAAGCATCCAACGTCAGATTTCTTCCAGAATGCTTATGCTACATATTTCACCATATGGTTTGGGAAATGGATGAGGTACTGATGCATCAGATTGTGCAGCCGGCCAAGAGCTGTGAGTCTAAAGATGGTGTTTCTTTCCTTGATCAAGTTATCTGTCCTCTTTACGAGGTTCTGGCTGCTGAAGCTGCAAACAATAATAATGGGCAGGCGCCACATTCTGCATGGAGAAACTATGATGATTTTAACGAGTATTTCTGGTCGCTTAGATGCTTTGACCTCAGTTGGCCATGGCATAAAGGCAAATCTTTTTTTCAAAAGCCAACACCAATATCAAAGGATATGCTTGGTAGAAGTCGCCATCAAGGGAAAACGTCATTTGTTGAGCATCGGACTTTTCTTCATCTTTATCATAGTTTCCATCGCTTATGGATATTTTTGGTCATGACGTTTCAGGCTCTGACCATTGTTGCATTTAACAATGGAAGCTTTAATATGAAGACCCTGCTGGAAGTTCTGAGTCTTGGTCCGACATTTGTTGTAATGAAGTTGATTGAGAGTGTTCTAGACATCCTAATGATGTATGGTGCATACTCTACTTCATGGCGTCTTTTTGTTTCTCGAATTCTTCGTTTTCTTTGGTTTAGTACTGCATCAGCTTCGACAACATTTCTTTATGTGAAAGCTCTTCAGGAGGGGAGTAAACCAAATGCAGAAAGAGTGATGTTCAGACTATATGTAATTGTGATTGGAATATATGGTGGTGTACAGCTTTGTCTCAATATCCTCATGCATATACCTGCTTGCCGTCTTTTAACAAATCAATGTGATTGGTGGCCTCTTGTTCGCTTTTTCAAGTGGATGCGTCAGGAACGTTACTATGTTGGACGTGGGATGTATGAGAGGACTATTGACTTTATCAAATACATGCTTTTGTGGATTATCATTCTGGGTGGAAAATTTGCATTTGCCTATTTTCTTCAGATCAAGCCTCTTGTTGGACCTACAAGGCTTATTATAAATATGAGAGATATAAGATATTCGTGGCATGACTTTGTGTCTAAAAATAATCATAATGCTTTGACTATTCTTAGCTTATGGGCCCCCGTGGTTGCTATTTACATCTTGGATGTTCATGTTTTCTATACTGTTATATCGACTATTTGGAGTTCCTTAATTGGGGCAAGAGACCAACTTGGAAAGATTAGATCATTGGAAGCCGTACATAAACTGTTCAAGCAGTTTCCTAGAGCTTTCATGGACACTCTACATGTTCCTCTCCAAGATAGGCTTGGGTTTTCAAATCAGTCATCAAGTGAGGCTGTTGAGAAAGACAAGTTCGATGCTGCTCGATTTTCTCCCTTCTGGAATGAAATCATAGCAAGTTTACGGGAAGAAGATTATATTACAAACTTGGAAATGGAGTTACTTCAAATGCCTGAAAACAAGGGTAATCTTCCCATGGTTCAGTGGCCACTTTTTCTTCTTGTCAGCAAGATATTTCTAGCTAAGGATATTGCTGTTAAAAGACGAAATTCACAAGACAAGTTGTGGAAGCATATTTCAAGAGATGACTATATGAAATATGCAGTACAGGAATGTTACCACGCCATTAAGCTTATCTTAACAGAATTACTAGTTGGGGAAGGAAGGATGTGGGTTGAAAGGTTATTTGAAGACATTCAAGCTAGTATAGCAAACAATTCGATTCTAAATGACTTCCAGCTAAATAAGCTGCCTCTTGTGATTACAAGAGTAACTGCTCTAACGAGTATTCTGAAAGAACCAGAAACTTCGGAGCTGGAAACAGGGGTTGTTAAGGCTGTTCAAGATTTGTATGATGTTGTGCACCATGATATCCTTTTCGGTGACAAGAGGGGGCACTATGAAACATGGAACATATTAGTAAAAGCCAGAAATGAAGGTCGCTTGTTTACAAAATTAAATTGGCCTAAAGATCCAGAATTGAAGTCACAAGTCAAAAGATTGCATTCCTTGTTAACCATTAAAGATTCGGCTTCAAATATTCCAGTTAATCTTGAGGCTAGACGGAGACTGCAATTCTTTACAAATTCACTTTTCATGGAGATGCCAACTCCAAAACCTGTTCGTCAGATGCTTTCCTTCAGTGTATTCACCCCATATTATTCTGAGACGGTGCTCTATAGTATGGAGGAACTATTGAAGAAAAATGAGGATGGGATAATAACCTTGTTTTACTTGCAAAAAATTTATCCAGATGAGTGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGTCGAGATGAGAATGAAGTTGACCCAGAATCATTTGATAACCCTAATGACATCCTTGCACTACGATTTTGGGCCTCTTATCGGGGACAGACTTTAGCAAGAACAGTTCGTGGAATGATGTACTATAGGAAAGCTCTTATGCTGCAGACTTATTTAGAGAGAGGAACTTATGGAGATTTGGAAGCTGCCATTCCTTGTACCGATGCTACTGATACTTGGGGTTTTGATTTATCTCCGGAAGCACATGCATTGGCAGATCTTAAATTTACATATGTTGTGACGTGTCAGATATATGGCAAACAAAGAGAACAACAAAAACCTGAGGCCGCTGACATTGCATTGCTTATGCAAAGAAATGAAGCCCTTCGTGTTGCCTACATCGATGATATTGAAACCCTAAAGGATGGTAAGGTGCACAAAGAATTTTACTCAAAGCTTGTAAAGGCTGATATCGATGGAAAAGATAAGGAGATATATTCAATCAAATTGCCTGGAGATCCAAAGTTGGGTGAAGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTATTGTTTTTACTCGTGGAAATACTATTCAGACAATTGATATGAATCAGGATAATTACTTTGAAGAAGCATTGAAAATGAGAAATCTGCTTGAGGAATTTGGTTGTGATCATGGTATTCGTCCTCCTACCATACTAGGTGTCAGGGAACATGTATTCACGGGGAGTGTTTCATGTCTTGCTTCATTCATGTCAAATCAAGAAGCTAGTTTTGTGACTTTTTGCCAGCGTGTTCTGGCAAATCCCTTGAAAGTGCGTATGCATTATGGCCATCCAGATGTTTTTGATAGGGTTTTTCATCTAACACGAGGTGGCATCAGCAAGGCCTCCCGTGTTATCAACATTAGTGAAGATGTCTTTGCAGGATTTAATTCAACATTGAGGCAAGGGAACGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTTGGTAAAGGACGAGATGTTGGTCTTAACCAGATTACTCTTTTTGAAAGAAAGCTTGCTGGTGGTAATGGAGAACAAGTTCTTAGCCGTGATGTATATTGGCTAGGCCAACTGTTCGATTTTTTCCGGATGATGTCATTCTATTTCACCACTGTTGGCTACTACTTTTGTACTATGTTAACGATGCTAACTGTATACATTTTTCTCTATGGAAAAGCATATTTGGCACTATTTGGAGTTGGTGAGACCATTGAAGATAGAGCTAACATTACAGATATTATGGCATTGTCAACTGCTTTGAATGGACAGTTCCTCATCCAAATTGGTATCTGCTCTGCTGTACCGATCTTGGGATTCATATTGGAGCAAGGTTTCTTCAAGACTATTGTCGACTTCATAACCATGCAGCTTCAGCTTTGTTCTATCTTCTTCACATTCTCTCTTTGCACAAAAACTCACTATTTTGGCCGAACAATTCTTCATGGCGGTGCAAAGTATCATGCAACCGGAAGGGGATTTGTGGTTCACCATATCAAATTCTCTGAAAATTACAGATTGTACGCCCGCAGCCATTTTGTTAAAGGATTTGAAGTTGTGCTTCTGTTGGTTGTATACATGGCCTATGGATATAGTTCAGGTGGTTCATTAGCATACATCCTTGTAACTCTTAACACTTGGTTAATGGCAATATCTTGGCTTTTTGCTCCCTATCTGTTCAATCCATCTGGGTTTGAGTGGCAGAAGACTGTGGAGGATTTCAAGGAATGGACCAATTGGCTCTTTCATCGAGGTGGAGTTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAATCGTGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAAACCATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACAATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGAATAGTTTATAAGCTCCATACCCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGTACATGGGTTCTCCTGGATTGTGTTAGCTTGCCTTATAGTTCTGTACAAGGTGTTTACCTTCAGCCAGAAGATGACTGTCAATTTTCAGCTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTCTTTCCTTTTGACGCTGGCTGGCCTGGCAGTTGTGGTTGCTATTATGGATTTGTCAATGCCTGATGTATTTGCTTGCATCTTGGCATTTGTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGTAGCTTGGAAACCTTTAATAAAGAAACTGGGACTCTGGAAATCCATATGCTCAATTGCTCAGTTGTACGATGCCGGGATGGGGATGCTCATCTTTATCCCCATTGCATTCCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCGACATTCCAAAATTGTCTTATGTTCAACCATGCTTTCAATTGA 5481 39.9 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1826
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 28452952 28552700 + ClCG03G013850.2 Cla03g01332 269832
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cla03g01332 1826 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 10 1825 - -
Cla03g01332 1826 SMART FKS1_dom1_2 279 391 IPR026899 -
Cla03g01332 1826 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 281 388 IPR026899 -
Cla03g01332 1826 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 968 1662 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Cla03g01332 1826 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 10 1825 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cla03g01332 Cla-Chr3:28452952 Cla06g01725 Cla-Chr6:30768245 4.59E-136 dispersed
Cla03g01330 Cla-Chr3:28360532 Cla03g01332 Cla-Chr3:28452952 0 proximal
Cla03g01332 Cla-Chr3:28452952 Cla03g01335 Cla-Chr3:28576385 1.22E-155 proximal
Cla03g01332 Cla-Chr3:28452952 Cla03g01336 Cla-Chr3:28601545 0 proximal
Cla03g01332 Cla-Chr3:28452952 Cla03g01337 Cla-Chr3:28642943 0 proximal
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cla03g01332 K11000 - csv:101216435 3320.02