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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cma05g00896 ATGGCGGCGAAGCCTAACTCGGTTTCCTTGAGGGTTCCGTACAGGAACATCCATGATGCAGAAGTGGAGATGGTGGCTGTCGATGAACAGCAGCTTCAAGCGATCGATCTAAATTCTCCTCCTTCTGATGGATTTCCTTATGGAAGCCCAGACAGTTCATCGTCAGCGCCTCATGTTAGATCTACGCCCAATAGTTTGATTATCTTAATTCTCAGTTGTACTATCGCTGCCGGTGTTCAATTTGGTTGGGCATTACAGCTTTCCCTACTAACGCCATATATTCAGACACTCGGAATTGAGCATGCGTTTTCTTCGTTTATTTGGCTATGCGGTCCCATCACTGGGCTCGTGGTTCAACCATGTGTCGGTATATGGAGTGATAAGTGTTCTTCAAAATATGGAAGGAGGCGTCCCTTTATTCTTGCTGGGTCTTTAATGATAGCAGTTGCTGTGGTGTTGATTGGATTTTCTGCTGACGTTGGATATATATTAGGAGATACGAACGAACACTGCAGTGTATACAAAGGTACACGAATGAGGGCGGCTATTATCTTTGTAATAGGCTTTTGGATGCTTGATCTTGCAAACAATACGGTGCAGGGTCCTGCTCGTGCTCTTCTAGCTGATTTGTCAGGTCCTGATCAACACAATATTGCAAATGCGGTATTTTGTTCGTGGATGGCTGTTGGTAATATCCTAGGTTTTTCGGCAGGAGCTAATGGAAACTGGCACAAATGGTTTCCTTTCCTTTTGAGTAATGCTTGCTGTGAAGCCTGTGCGAACCTTAAAGCAGCATTTCTTTTTGCTGTGCTTTTTCTAACCATATGTACTCTTGTTACCATATATTTTGCCGACGAAGTTCCACTTACTGCTGTAGATCAACCGCCACGTTTATCAGATTCTGCTCCTCTGTTGAACGGGAATGAACAAAATTGTCCTGATATTTTAAAACCAGAACTTAACAGTTTGAATGGGAGCAATGTTGAGTATGGATATCAAGAAAATATGAATTTGAAAGATTCAAAATCAAAAATTGAGGAGAACCACAGCGAAGGGTATTATGATGGTCCTGCAACAGTGGTAGTTAAATTATTGACCAGTTTAAGACATTTACCACCGGCCATGCATTCAGTGCTTCTTGTGATGGCTCTTAGCTGGTTATCCTGGTTTCCCTTCTTCTTATTTGACACGGATTGGATGGGAAGGGAAGTGTACCATGGGGACCCAAAAGGCAGTTTGACTGACAAACAGGTTTATGATCAGGGTGTCAGAGAAGGTGCATTTGGTTTGCTCTTGAATTCTGTTGTTCTTGGTATCAGTTCTTTCTTTATAGAGCCAATGTGTCAGCGAATGGGAGCAAGACTTGTCTGGGCAATGAGCAACTTTATGGTGTTTGCATGCATGACGGCAACTACTATTATCAGTTTAATATCCGTCAGTCAGTACTCTGAAGGAGTCGAGCACGTTATCGGGGGAAATTCATCAATAAAAAATGCTGCCTTGGCTGTTTTTACTCTTCTTGGTTTTCCTCTCGCTATAACATATAGTGTTCCCTTCTCTTTGACAGCAGAATTGACGGCTGATTCTGGTGGTGGGCAAGGATTGGCTATAGGTGTTCTCAATCTTGCAGTTGTTATTCCCCAGATGATTGTATCCCTGGGAGCTGGGCCATGGGATGCATTATTCAGTGGAGGAAACATTCCTGCATTTGCTTTGGCGTCTATATGTGCGCTCGCGGCTGGAATTGTTGCAGTTCTTAGATTGCCTAATCAAACCAACAGTTCTTTCAAATCCACAGTGAACCAAATAATTCCTGGAGTAGCTCTTAGAAGCCTGGAGGATCTCTTAGTACCGTATACCTTCATTTAA 1869 43.07 MAAKPNSVSLRVPYRNIHDAEVEMVAVDEQQLQAIDLNSPPSDGFPYGSPDSSSSAPHVRSTPNSLIILILSCTIAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIEHAFSSFIWLCGPITGLVVQPCVGIWSDKCSSKYGRRRPFILAGSLMIAVAVVLIGFSADVGYILGDTNEHCSVYKGTRMRAAIIFVIGFWMLDLANNTVQGPARALLADLSGPDQHNIANAVFCSWMAVGNILGFSAGANGNWHKWFPFLLSNACCEACANLKAAFLFAVLFLTICTLVTIYFADEVPLTAVDQPPRLSDSAPLLNGNEQNCPDILKPELNSLNGSNVEYGYQENMNLKDSKSKIEENHSEGYYDGPATVVVKLLTSLRHLPPAMHSVLLVMALSWLSWFPFFLFDTDWMGREVYHGDPKGSLTDKQVYDQGVREGAFGLLLNSVVLGISSFFIEPMCQRMGARLVWAMSNFMVFACMTATTIISLISVSQYSEGVEHVIGGNSSIKNAALAVFTLLGFPLAITYSVPFSLTAELTADSGGGQGLAIGVLNLAVVIPQMIVSLGAGPWDALFSGGNIPAFALASICALAAGIVAVLRLPNQTNSSFKSTVNQIIPGVALRSLEDLLVPYTFI 622
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 6943697 6950776 - CmaCh05G008960.1 Cma05g00896 295014
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cma05g00896 622 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 62 588 IPR036259 -
Cma05g00896 622 CDD MFS_SLC45_SUC 69 586 - -
Cma05g00896 622 PANTHER SUGAR TRANSPORTER 51 600 - -
Cma05g00896 622 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 53 590 IPR036259 -
Cma05g00896 622 Pfam MFS/sugar transport protein 83 217 - -
Cma05g00896 622 PANTHER SUCROSE TRANSPORT PROTEIN SUC3 51 600 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cma05g00896 Cma-Chr5:6943697 Cma12g00228 Cma-Chr12:1123406 4.99E-145 dispersed
Cma12g00737 Cma-Chr12:4506858 Cma05g00896 Cma-Chr5:6943697 0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cma05g00896 K15378 - csv:101205348 1085.09