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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cme04g01311 ATGGGATCAACAGAGGAGAAAACAAATTACTTATCAGATGAAGAAATTCCATTGAAGTCATCACCAGTTGCGAAGAACGTATTGCATAGTTTTGATTGTGAGACGGCTGCTGTGCGTTCTTCCCCTGATACAAGATGGTGGAAGACTAACAACATTCGTATTAGACCTCTTAGAAGTGCTTATATTGTGTTGGTTAGAGCAAAGATCAACGTGTTACTACCTTTTGGTCCTTTGGCAATTCTGCTACATTACTTAACGGGAAAGCATGGATGGGTCTTTTTTTTCACTTTACTTGGAATTACACCCTTGGCGGAACGTCTTGGTTATGCAACTGAGCAGCTTGCTTTCTACACTGGACCAACAGTTGGTGGTCTTTTGAATGCAACATTTGGAAATGCAACTGAAATGATCATATCGATATATGCGTTAAAGAGTGGGATGATTAGGGTTGTTCAACAGTCATTGCTGGGGTCAATCTTGTCAAATATGCTCCTTGTGCTTGGTTGCGCTTTCTTCACTGGTGGGATTATTCATCATAAGAAGGTGCAGGTTTTCAATAAGGGTGCTGCTGTTGTGAATTCAGGATTGTTATTGATGGCTGTAATGGGAACGACTTTTCCGGCTGTGCTTCATTTCACACACACAGAACTTCATTCGGGAGAGTCAGCATTATCTCTTTCAAGATTTAGCAGTTGTATAATGTTAATTGCATATGCAAGCTACCTTTTCTTTCAACTAAAAAGTCAGCATAATCTCTATGGTCCTCTTGACGAGGAAGTTGATGGAGAAGTTGAGGACGATTCTGAGATTTTTGCTTGGGAAGCAATTGGATGGCTTGCAATCTTGACTGTATGGGTATCTATTTTATCTGGATACCTTGTTGATGCTATCCAGGGAGCATCTGAATCATTAAATTTGCCAGTGGCATTTATTAGTGTAATTTTGTTGCCAATTGTTGGAAATGCTGCTGAACATGCAAGTGCAATCATGTTTGCCATGAAGGATAAGCTTGACATCACTCTTGGAGTTGCTATTGGATCATCTACACAAATATCCATGTTTGTGATCCCGTTTTGCGTAGTAGTTGGATGGTGCATGGGAAAACCAATGGACTTAAACTTTAAACTCTTTGAAACAGCAACGTTGTTCATCACTGTGCTAGTAGTGGCTTTTATGTTGCAGGAGGGGACATCAAATTATTTCAAAGGTCTAATGCTTATTCTATGTTATCTCATAGTGGCTGCCAGCTTTTTTGTACACGTTGACCCTAGTAATGATGATGATTAA 1287 39.86 MGSTEEKTNYLSDEEIPLKSSPVAKNVLHSFDCETAAVRSSPDTRWWKTNNIRIRPLRSAYIVLVRAKINVLLPFGPLAILLHYLTGKHGWVFFFTLLGITPLAERLGYATEQLAFYTGPTVGGLLNATFGNATEMIISIYALKSGMIRVVQQSLLGSILSNMLLVLGCAFFTGGIIHHKKVQVFNKGAAVVNSGLLLMAVMGTTFPAVLHFTHTELHSGESALSLSRFSSCIMLIAYASYLFFQLKSQHNLYGPLDEEVDGEVEDDSEIFAWEAIGWLAILTVWVSILSGYLVDAIQGASESLNLPVAFISVILLPIVGNAAEHASAIMFAMKDKLDITLGVAIGSSTQISMFVIPFCVVVGWCMGKPMDLNFKLFETATLFITVLVVAFMLQEGTSNYFKGLMLILCYLIVAASFFVHVDPSNDDD 428
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
4 18463183 18469366 + MELO3C025789.2.1 Cme04g01311 325572
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cme04g01311 428 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 276 415 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Cme04g01311 428 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 91 246 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Cme04g01311 428 Gene3D - 120 419 IPR044880 -
Cme04g01311 428 PANTHER VACUOLAR CALCIUM ION TRANSPORTER 1 426 IPR004713 GO:0006812|GO:0008324|GO:0016021
Cme04g01311 428 TIGRFAM cax: calcium/proton exchanger 72 418 IPR004798 GO:0006816|GO:0015369
Cme04g01311 428 PANTHER VACUOLAR CATION/PROTON EXCHANGER 1 426 - -
Cme04g01311 428 TIGRFAM caca2: calcium/proton exchanger 63 418 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cme04g01311 Cme-Chr4:18463183 Cme11g01002 Cme-Chr11:14304866 0 dispersed
Cme04g01311 Cme-Chr4:18463183 Cme12g00092 Cme-Chr12:924964 8.25E-104 transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cme04g01311 K07300 - csv:101219432 830.091