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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cmetu05g0652 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7965 39.05 MATASHAQAVKSLNKSPGRRHFVFQTFSQRVQEIDIDVYRSLDKVKSEPSEGSSFFRDCLIEWRELNTAEDFISCYEEIIPLVQTLPLVILHKESIFSNLLFRVQIKARLSLEPILRLIAALARDLLEDFLPFLSQLTDALVSLLEGGAAREPEIIEQIFTSWSYIMMYLQKYLTRNITDLLRVTVSLRYYSKDYIQDFMAEATSFLLRNAPADQLKDGIKRIILEVVKKPLATREYGTSALLFHTMRGTSSRFHSRAELVFRFLISAPTFEIGRDSSQGSDAILEVFKCVCQRLCEEMDPQELELIWKCLFEEVTVAISNDYMVHINHLLMLLASAAQNVNWKKLHDYKPMLELVDLLVMKFATTPSLPMDDDLSSIVDTILQLMLVILEGLQNSEDFLCISGCSLRWAPIFQLNNSSLLIFVRGVMEKDTSVLCAFRTNILRVMNELLESSPEEVIYLLLSFCERLPTEVLCTSEEEIPRINNFILKILCQWIKEITDFVQHSSSTIDINESKLAIFWGVVRCCPYILKFQASSSLLVELINALDRLYTLEGDIFGIPKENLESIIGATIGSYLKLLSSEKAGLEELSRLVYLAKRYSSCSQVLVAVADYLDFIYGPALEADISKRIYSEEFQADKVEDAVQVFADNLRHSDKGVRLSTLRILCHYEPLQSATLTKESSIDNEMEAENLEPYSDDLVGSEVLRLLLSVESTPTSISTSRKIILFISGVQRALLAGRIPEAYLLVALNGIIGIFQNRFSYIWDQASECLAALMRKYSGFVWDKLICYFQQWLCLLDQPGRDTAESSDELNDLVRCFHSFVVPSPDSTPLFTLLCLVLQSLQKNSTIVESQSQRMLPLFLTFLGYSTGHVDSVDSFKQYTCKSKEWKCVLKEWLNLLRKTRNLKSFHKSDFLKEVLEQRLLDDNDAEIQSKVLDCLLMWKDDFLIPHEQEELTRWSLSKEKNQIDERHRPKLVPLVTRLLMPKVRKLKVLGSRKQASVNLRKAVLQFIAQLDTVELPLFFALLLKPLNIIPREADASANWFSNLHLVSMKASATNILKYFSIESIVALSWKKKYGFMHVIEEVLAVFDEMLISPFLNIILGCVVRILASCTSSLHAARQNEASLSEIGKTNDKNSLEMNKEAASPGLTCTAVKQHKDLRSLCLRVISVVLYKYEDFDFEMEFWDLFFTSVKSSIESFKHEGSSSEKPSSLFSCFLAMSRSHKLVPLLARERNLVPDIFFILTISTASQPIILFVLQFIENLLTFDGELDGNDSAVRSILLPNLDSLIQSLHVLFQSGDAKKRKLVEHLNGPMIRIFKLLSKLVRDQLHAKKFVEIILPCLSQTGRSTESHADTLQVVQNVVPILGSESTTKILKAVSPLLISVEQDLRLLVCDLINALAEVDSSILCVAQVIRGLNATSAMEIGGLDFDTIVNSYEKISVDFFCATPEEHALVVLSQCVHDMSSEELILRHSAYRCLLSFVEFSSSVLGQGGISHQESIDNITLYDNSWSKESVMRLTNKFIFKHMGEAMNRETSVKKEWINLLREMVLKFPDVANLSSLKALYSKDAEVDFFSNITHLQKLRRAKALIRFKNTIPTVNMPEVITKNVFVPLFFNMLFDLQEGKAENIRVACIEALASISGKMEWKSYFALLRRCLRDLSKHPDKKKVLMRLICSILDNFHFQENISKVGSTQLYGSMVVMNNMQACLSKDVFPKIQKFMNSQSERVDIYVHLAALKVLKLLPENVMDSQLLSIIQHIVNFLKNRLESVRDEARSALAACLKELGSEFLQVVVRVLRGSLKRGYEMHVLGYTLHFLLSKLFTGPATGKIDYLLDDLISVAEKDILGEVAEEKEVEKLASKMKETRKQKSFETLKLVAQSITFKSHALKLLRPVTDHMKKHLTPKAKTKLENMLSSVAAGFESNPSVNQTDLLIFIYGLIEDGIKVEDGQGGISSLVSANKHSRDVSRGKNFSCQTILAKAPCSHLIMVFALKLLHGYMKKMQLGKGDAQLLAMLDPFVPLLGDCLTSKYEDVLSLTLRCLTLLLRLSLPSVKSQADKIKGVVLRIAQSSVDPCNPLVESCLRLLTVLLRNEKVTLSTDQLHLLIQFPLFVDIDKNPSFVALSLLKAIVSRKLVVPEIYDLAIRVAELMVTSQVEPIRKKCGKILLQFLLDYHLSEKRLQQHLHFLLSNLRYEHSTGREAVLEMLHATVVKFSKSVVDSISETLFFHLVACLANDQDHHVRSMTGLVIKCLIDRISPGPQHDILESSLSWYSEGKQQLWSVAAQVLGLLVEVEALKEAFERRIQTSVVDVTMNEQIDISAESTITFWKEAYYSLVMLEKLMHQFPQLFFENDFEDIWEMISHLLLHPHMWIRSISNRMIASYFRKIVIENSGSTSERSLGAYSLMKPSRLFFIATSFCCQLKSQLTDKDADLIVQNLVFAIRGLHSVIGELEDVDSCPFWSTLEESEQRLFLKAFQLLDSEKGKSMLLPHMTGVFNQNDTGPEQICRLLISNLIKQMGKVALQTDTVQMTVVFNVFRNLSQSVEDCERYVFEILLPLYRVREGFSGKVIPESMVQLAQEVCDKIQNCLGIQKFVQVYSQIKKSLKTKRDKRKQEEKRMAVINPMRNAKRKLRIAEKQRASKRRKITTMRMSRRML 2654
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 15838093 15866134 - PI0009010.1 Cmetu05g0652 356356

Annotation

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cmetu05g0652 2654 Pfam Domain of unknown function (DUF6700) 1723 1939 IPR046523 -
Cmetu05g0652 2654 Coils Coil 2654 2654 - -
Cmetu05g0652 2654 Coils Coil 1847 1867 - -
Cmetu05g0652 2654 Gene3D - 1444 1842 IPR011989 -
Cmetu05g0652 2654 Coils Coil 2623 2643 - -
Cmetu05g0652 2654 PANTHER UNCHARACTERIZED 17 2652 - -
Cmetu05g0652 2654 Coils Coil 1759 1779 - -
Cmetu05g0652 2654 Coils Coil 2596 2616 - -
Cmetu05g0652 2654 Pfam Down-regulated in metastasis 887 1487 IPR011430 -
Cmetu05g0652 2654 SUPERFAMILY ARM repeat 1370 2378 IPR016024 -
       

Pathway

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cmetu05g0652 K14772 - - csv:101208309 4826.92
       

Deco-Alignment

Select Vvi1 Blo1 Blo2 Bda1 Bda2 Bpe1 Bpe2 Bma1 Bma2 Cmo1 Cmo2 Cma1 Cma2 Car1 Car2 Sed1 Cpe1 Cpe2 Bhi1 Tan1 Cmetu1 Lac1 Hepe1 Mch1 Lcy1 Cla1 Cam1 Cec1 Cco1 Clacu1 Cmu1 Cre1 Cone1 Cone2 Cone3 Cone4 Lsi1 Csa1 Chy1 Cme1 Blo3 Blo4 Bda3 Bda4 Bpe3 Bpe4 Bma3 Bma4 Sed2 Cmo3 Cmo4 Cma3 Cma4 Car3 Car4 Cpe3 Cpe4 Bhi2 Tan2 Cmetu2 Lac2 Hepe2 Mch2 Lcy2 Cla2 Cam2 Cec2 Cco2 Clacu2 Cmu2 Cre2 Lsi2 Csa2 Chy2 Cme2
Vvi5g934 . . Bda03g01138 . Bpe04g01081 . Bma04g01164 . . . . . . . . . . . . . . . . . Cla06g00778 Cam06g0832 Cec06g0846 Cco06g0856 Clacu06g0835 Cmu06g0806 Cre06g1587 . . . . . . Chy05g00581 . . . . . . . . . Sed09g0168 . . . . . . . . Bhi12g01475 Tan06g2279 Cmetu05g0652 . Hepe03g0379 . . . . . . . . . Lsi09g01121 . . Cme05g00737