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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cmo11g00052 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5721 41.9 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1906
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
11 215531 247857 - CmoCh11G000520.1 Cmo11g00052 390671
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cmo11g00052 1906 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1030 1724 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Cmo11g00052 1906 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1 1903 - -
Cmo11g00052 1906 Coils Coil 155 175 - -
Cmo11g00052 1906 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 349 457 IPR026899 -
Cmo11g00052 1906 SMART FKS1_dom1_2 347 460 IPR026899 -
Cmo11g00052 1906 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1 1903 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cmo11g00052 Cmo-Chr11:215531 Cmo11g00826 Cmo-Chr11:4114229 0 dispersed
Cmo11g00827 Cmo-Chr11:4154334 Cmo11g00052 Cmo-Chr11:215531 5.21E-56 dispersed
Cmo10g00074 Cmo-Chr10:341273 Cmo11g00052 Cmo-Chr11:215531 1.26E-17 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cmo11g00052 K11000 - csv:101217890 3618.55