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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cmo18g00478 ATGAGGAAATGGAATCTGTTATGGCCGTTTTGGGCCATAACGATTGTTCATGGTGTTGCGATTCTGATATTCGTTAAAGGATTTCTTCTTACTCGTACTGAGCTTCCTTTTTACAGTCGCTGCTCCGATGTTTCTCAGTCTCCCTGTTTCACTTCCGATTCACTTTCTGACAGCAATCCTTCGGTTCCTCCTTCCTCCGGTGCAGCGAATTCCAGCCGGTGCTGGACCAAGCCCGCCGTTAACCGCATCATCATCATTGTTTTTGACGCTCTACGGTTTGATTTTGTTGCTCCCAGTACATTCTTTGAAGAATCGAAACCATGGATGGATAAGTTACGAGTACTGCACAAGATGGCATCAGAACGGGGTTTGTCTGCCAAGATTTTCAAAGCTATTGCTGATCCACCCACAACGAGTTTGCAGCGATTGAAGGGCATTACGACTGGAGGACTTCCAACATTTATTGATGTTGGAAACAGCTTTGGTGCTCCAGCAATTATTGAAGACAACTTGATTCATCAGCTTGTTCAGAATGGAAAACGTGTGGTGATGATGGGTGATGACACATGGATGCAATTGTTTCCTCATCATTTTAAAAAAGCATTTCCCTATCCCTCGTTTAATGTTAAAGATCTTCATACGGTAGACAATGGATGCATTGAACATCTTCTTCCATCCTTGTATGAAGATGATTGGGATGTTCTTATCGCACATTTTCTTGGTGTGGATCATGCTGGGCATATATTTGGTGTTGATTCAAGTCCAATGATTGAAAAGCTGGAGCAGTATAATTCTATTTTAGAGAAAGTAGTGGATGTGCTGGAAAGGCAATCTGAACCGGGTGGGTTACATGAAAATACTCTTCTTCTTGTGATGGGTGATCATGGACAAACTTTGAATGGCGATCACGGTGGAGGAAGTGCAGAAGAGGTTGAGACGTCTCTATTTGCTATGAGCTTTAAGAAGCCTCCAGCATCCGTACCATCTGAATTTGGCACTTCTTCTTGTCAACTAGATTTGCTTGATTTCCCAGTGACATTATCTGCATTGCTTGGAATTCCTTTTCCTTTTGGAAGCATTGGGCGTGTAAATCCTGAGTTATATGCTCTAGGTGCTGGTACATGGAAGTTGGAAGGTATGAAGGTTGGAAACTACATAAATAGCAGAGAACAGGAAGAATGGATGCAGAATTACGTCAATGTACTTTGTATCAACTCCTGGCAGAGCAATAGTTTCCTCAATCTGGCCATTCATTTGAACGATGATATTGATAAGGTGAAAAGGTATATTGATAATTATACTGCTTCATCAGTCATTGGATTTTCTGATGAAGACTTGCTTCACACTGGTAGTTTGTATGCTGATGCAATGGAAAATTGGTCTTACATTTCAAAAGACTTATTATCTAATAGTGACGGAATGGATGTTGTACCTTCTCTTAAGAGGCAAATTGACGCATACTCTAATTTCCTAGCGAGTATTGCTGAGTTAGCACGCTCTAAATGGACAGAATTTAATTTAAAATTGATGACTCTTGGTTTCGGCATTATGGTAGCATCACTTTTTGTCCATTTCATTGCTATAAAGAGGGTTGGCAAACAATGCGGCAGCTCTTTTGCAACTGAAGATTGTGGAACAACTTTCGAGTTAATGCTTTCTTGCTTCATGGTGGCCATGCGTGCATGCAGCTTTCTCTCAAATAGCTTCATTTTGGAAGAAGGAAAAGTGACAAGTTTTCTTTTGGCTACTACCGGCATTTTCATGCTACGATATTCAATCACAAAGCAGAAACATTTTCTAAACGTCTTCATTTTCCTTCTTTTGATGATCTACTGTAGATTTACAATTGAAGTTGGTCTATTGAAGCAGGCCGATACTTCTGCATTCTTGAAAGCTTATCCTTCATGGGTGCTTGAAATTGCATCCCTACTGCCTGGTTGGACTTACATAACCAAATCTGTGCCAATTATTGCACTCATATTATTGGCACAGTTGCTTCTTAAAAACATTACTAGCAGCCATTCAAAGGGAGTATGGAAGTTCGTTATGTATGGAACAATTTTGTGTTATATCCTTATTGGATTCCATTGGGCTCTAGAAAATGAGGTGTTGCATTTTGCTTCTGCTATTGAGGGCATTGGAAAAAATTGCATTCCTAGAATAATCTATGCTATTGGACTAGGACAACTGTCATTACTACTATTTAGGCAACTATTTGGTGAAGACAAACTTTTAGACTGCAGAATAACTTTATTAACCAAAACAGCCGCCATGTTAGCTGCATGGAGTCCAACAATTATTATTCTAGCGGGAAAGCAAGGTTCCTTGGTGGCTTTGGCATCTCTTATTGGAGGATATTGCATAATAGGCATGGACAATCTAAAACACGGAGAGGATGGAAATGGTAGAATTCTGACAGTTGACTGTCTTCCTGTAACGCAGTGGAGCTTGTTTGCTATCTGTCTCTTCTTTAGCTCTGGCCACTGGTGTGCTTTTGATGGCCTTCGCTATGGTGCTGCATTTATTGGGTTCGATGAGTTCGTTCTCGTTCGACAAGCAATCCTTCTCACAATCGATACGTTTGGCTTCTCAGTCATCCTTCCAATTTTCGGACTTCCTTTCATTGTTGCAAAGAAATATTCATCTAGTCAGGCTTCAAAAGGGGAAAACACTCTCTTCATGCGCTTATCTCAAGCTTACTTGATGTATGGGCTCATAATGGCGGTTCCAGTTACAGCTTCTATATTGTGTGTCATAATTCAAAGGCGGCATTTGATGAGCGGGGAGCTAAGTTGGAATTCGATCTTGGCTTGTTCTGAAATGGACAATGCTGATATTGAGAGCGGGGAAGAGGATTTTCATGGGCAGAGGGGAAGGAAATATCGCCCTGTTGAAGCCCATGATCGTGCTGTTCTTGAAATGTCTTCCATGGATCCGGGGCCCGCATCCTCTACGCCTTCCATTACCACGCGGCATCCTTCTATGAATGTGAATTTTGGGTTTGGATTTGCAGCGTTGTTTCTTAATCGTTATCATGATGTTATGAAGGTAAAAGTGGGTTCTCAGACAGGCACTGATGGAAAAGAAGGGAACTCTCTTACTCTCGTCGAAATTAATGGCCCCCAGGGAGAATCCAAGCTGGAGTTTTTTGGTTTTGATTCTCTTGTCAATATTCTAGGCCTTAAGAGTATGATGGGGGAACAAATTCAAGCACCTTCTAGTCCTCGAGATGGTGAGAATGTTTCGATCTCTCAGGGGTTGCCAAAGAACGAGGAAGTCAAATCGGGAACATTGATGGGTGTATTTATCCCATGCTTACAGAACATATTGGGAATCATTTACTATATTCGATTTTCTTGGATTGTCGGCATGGCTGGGATTGGTGAGTCATTAGTGCTGGTGGCATTTTGTGGTTTATGTACGTTCTTGACTTCAATTTCACTGAGTGCTATTGCAACTAATGGTGCAATGAAGGGTGGGGGACCATATTATCTGATAGGTCGTGCCCTTGGTCCAGAGGTTGGAGTTAGCATTGGGCTATGTTTCTTTCTCGGAAATGCAGTTGCTGGTGCTCTTTATGTGTTGGGAGCTGTAGAAACATTTTTGGATGCTGTACCATCTGCAGGGATATTCAGAGAGACTGTAACAAAAGTTAATGGATCAACTGTTGAACCAATTCAAAGTCCAAGTTCACATGACTTGCAAGTTTATGGCATTATCGTGACGATTTTTCTGTGCTTCATTGTGTTTGGTGGTGTGAAAATGATTAATAGGGTTGCTCCTGCTTTCCTTATTCCAGTCTTGTTCTCAGTAGTTTGCATATTTCTTGGAATTTTTCTGGCCAAGAAAAACGACCCTGCAGATGGTGTCACAGGGTTGAGTATGGATACTTTTAAAGAAAATTGGAGTTCTGATTATCAGATGACTAACAGTGCTGGAATTCCCGATCCTCAGGGAAACGTATATTGGAATTTCAATGCATTGGTTGGTCTTTTTTTCCCTGCTGTGACGGGAATAATGGCTGGATCTAATAGATCAGCTTCACTGAAGGATACTCAACGTTCAATTCCTATGGGAACATTGTTTGCGACTCTTTTGACAACTATATTGTATCTGGTCTCTGTGCTGTTGTTTGGAGCACTGGCAACCAGAAAGAGATTGTTAACAGATAGGCTTTTTACTGCTACAGTCGCGTGGCCTTTCCCAGCAATTATTTATGTTGGAATCATTTTATCAACCCTTGGAGCTGCTCTTCAGAGCTTGACAGGAGCCCCCCGCTTACTAGCAGCCATAGCCAATGATAATATATTACCCATTCTAAACTATTTTAAAGTAGAAGATGGCTGTGAGCCATACTTTGCAACCCTCTTTACTGCAATTCTCTGCATCGGATGTGTCATAATTGGGAATCTTGATCTTATCACACCAACCGTAACCATGTTTTTCCTATTGTGCTACGCTGGCGTGAACTTATCCTGCTTCCTTTTGGATCTACTAGATGCTCCCAGTTGGCGTCCACGATGGAAATTTCATCACTGGAGCCTCTCTCTTCTTGGAGCATCACTTTGTGTAGTGATAATGTTCTTGATCTCATGGTCATTCACGATAGTGTCTCTAGCCCTTGCAAGCCTTATATATTATTATGTGTGCCTTAGAGGTAAGGCTGGGGACTGGGGTGATGGTTTCAAGAGTGCGTATTTCCAACTTGCTCTCCGCAGCCTTCGTTCACTTGGAGCGAGCCAAGTTCACCCAAAGAATTGGTATCCCATACCGTTGATATTTTGCCGGCCATGGGGAAAGCTGCCAGAAAATGTTCCTTGTCACCCAAAACTTGCGGACTTTGCAAACTGCATGAAGAAAAAAGGCCGTGGAATGTCCATATTTGTGTCCATACTAGATGGAGACTACCATGAGCGGGTTGAAGATTCCAAAGCTGCCTGCAAGCAGCTTGCTACATATATTGATTACAAACGTTGTGAAGGTGTGGCAGAGATTGTTGT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1942
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
18 3263640 3293593 + CmoCh18G004780.1 Cmo18g00478 402251
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cmo18g00478 1942 Pfam Amino acid permease 1100 1574 IPR004841 GO:0016020|GO:0055085
Cmo18g00478 1942 Pfam Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase 106 299 IPR002591 -
Cmo18g00478 1942 Gene3D Amino acid/polyamine transporter I 1093 1557 - -
Cmo18g00478 1942 PANTHER SOLUTE CARRIER FAMILY 12, CATION COTRANSPORTERS 957 1941 IPR004842 GO:0006811|GO:0015377|GO:0016021
Cmo18g00478 1942 SUPERFAMILY Alkaline phosphatase-like 81 362 IPR017850 -
Cmo18g00478 1942 TIGRFAM 2a30: K-Cl cotransporter 1037 1942 IPR004842 GO:0006811|GO:0015377|GO:0016021
Cmo18g00478 1942 Coils Coil 257 277 - -
Cmo18g00478 1942 Pfam Solute carrier family 12 1609 1730 IPR018491 GO:0006811|GO:0016020|GO:0022857
Cmo18g00478 1942 Pfam Solute carrier family 12 1741 1941 IPR018491 GO:0006811|GO:0016020|GO:0022857
Cmo18g00478 1942 Gene3D Alkaline Phosphatase, subunit A 65 323 IPR017850 -
Cmo18g00478 1942 CDD GPI_EPT_3 77 364 IPR037675 GO:0006506|GO:0051377
Cmo18g00478 1942 PANTHER CATION-CHLORIDE COTRANSPORTER 1-LIKE ISOFORM X1 957 1941 - -
       

Event-related genes

Select Gene_1 Gene_2 Event_name
Cmo13g00527 Cmo18g00478 CST
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cmo07g00574 Cmo-Chr7:2581574 Cmo18g00478 Cmo-Chr18:3263640 5.79E-47 transposed
Cmo13g00527 Cmo-Chr13:6164214 Cmo18g00478 Cmo-Chr18:3263640 0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cmo18g00478 K14427 - csv:101216218 1765.36