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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cmu03g1989 ATGAGAGGGAGAACGATGGCTTACCCAAGACGATTGACGATAGTGTGCAGCGATCGAAGACTGGTTGAAGCTAGCCCCCCATTCTCCACCAATTTGGTCACCAACGCCGAATCGGCTAAAGTGTATTCCCTTTCCCTCCTTCGCCCCTTCCCATTTAAAATCACACGAGTCTCTCTAGAAAATTACGCACCCGCACATGGATTTGAGGAGGAGACACAAAATACACGAGGATGCCAAAGGACCGACTACCCCGGAAGTTCAGTCAAAGAATTGCAAAATATGGTTAATATTAATAAAAGACTTCTCCTTGAACAGAAGAAAATTGTGTCATCAGTGTATTGGAGGTGTGATAATGACATTCTCCTTCCTGACCTAAAAATCCACGACAAAAGACTCTTCTCTACTCCTCTTGAAATGAGCCTACTCAATTTATGTGAGCATGCGTATTCACTTGCGCAAAACCTGGATCCTAATAGTGAAGGAAGAGGTGTTTTGCAATTCAAAACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTAGCCAAGAGGGATGGTGGAACCATAGATAGAAGCCAGGACATTACTCGGTTGCAGGAGTTCTACAAACTATACCGAGAGAAAAATAATGTAGATAAGCTTCGGGAAGATGAAATGAAATTGAGGGAATCTGGTGCTTTTAGTGGTAATCTTGGAGAGTTGGAACGAAAAACGTTGAAGCGAAAAAAAGTCTTTGCAACCCTGAAAGTATTAGGAATGGTACTGGAGCAACTCAGTGATGCAATTCCTGAAGAGATGAAAAGACTCATGGAATCAGATGCAGCAATGACAGAGGACCTGATTGCATATAATATTATTCCATTAGATGCTCCTTCTATGACAAATGCTATTGGGTCCCTCGTTGAGGTGCAAGCAGCAGTGTCAGCTTTAAAGTATTTCAGTGGCCTTCCAAAGTTGCCCGCAGAATTTTCTGTTCCGGAGACTAGGAGTCCTGATATACTTGACTTTCTACACTTCATTTTTGGATTTCAGAAAGACAATGTGGCTAATCAGCGCGAACATGTAGTGCACCTACTTGCCAATGAACAATCTCGCCTTCGTATTCCTGAAGAAACTGAACCAAAGTTGGATGAAGCTGCTGTGGAGGGTGTTTTTAAGAAGTCTCTGGAAAACTACGTTAAATGGTGTGAATATTTATGCATTCAACCTGTTTGGAGCAGCTTGTCTGCTGTTAGCAAGGAAAAGAAGCTATTATTTATTTCCTTATACTTTCTTATATGGGGGGAAGCAGCCAACGTCAGATTTCTTCCAGAATGCTTATGCTACATATTTCACCATATGGTTCGGGAAATGGATGAGGTATTGAGGCATCAGATTGCGCAGCCGGCCAAGAGCTGTGAGTCTAAAGATGGTGTTTCTTTCCTTGATCAAGTTATCTGTCCTCTTTACGAGGTTATGGCTGCGGAAGCTGCAAACAATAATAATGGGCAGGCACCACATTCTGCATGGAGAAACTATGATGATTTTAACGAGTATTTCTGGTCACTTAGATGCTTTGACCTCAGTTGGCCATGGCACAAAGGCAAATCTTTTTTCCAAAAGCCAACACCAAAATCAAAGAATATGCTTGGTAGAAGTCGTCATCAAGGGAAAACGTCATTTGTTGAGCATCGGACGTTTCTTCATCTTTATCACAGTTTCCATCGTTTATGGATATTTTTGGTTATGATGTTCCAGGCTTTGACCATTGTTGCATTTAACAATGGAAGCTTTAATATGAAGACACTGCTCGAAGTTCTGAGTCTTGGTCCGACGTTTGTTGTAATGAAGTTTATTGAGAGTGTTCTAGACATCCTAATGATGTATGGTGCATACTCTACTTCAAGACGTCTTGCTGTCTCTCGAATTTTTCTTCGTTTTCTTTGGTTTAGTATTGCATCAGCTTCGATAACATTTCTTTATGTGAAGGCTCTTCAGGAGGGGAGTAAACCAAATGCAGAAAGAGTGATGTTTAGACTATATGTAATTGTGATTGGAATATATGGTGGTGTGCAGCTTTGTCTCAGTATCCTCATGCGTATACCTGCTTGCCATCTTTTAACGAATCAATGTGATCGGTGGCCTCTTGTGCGTTTTATCAAGTGGATGCGTCAGGAACGGTACTATGTTGGACGTGGGATGTATGAGAGGACTACTGACTTTATCAAATACATGCTTTTGTGGATTATCATTCTGGGTGGAAAATTTGCATTTGCCTATTTTCTTCAGATCAAGCCTCTTGTTGAACCTACCAGGCTTATTGTAAATATGAGAGATATAAGATATTCGTGGCATGACTTTGTGTCTAAAAATAATCATAATGCTTTGACTATTCTTAGCTTATGGGCCCCCGTGGTCGCTATTTATATCTTGGACGTTCATGTGTTCTATACTATTATATCGGCTATTTGGAGTTTCTTAATTGGGGCAAGAGACCGTCTTGGTGAGATTAGATCATTGGAAGCCCTACATAAGCTGTTCGAGCAGTTTCCTGGAGCTTTTATGGACACTCTACATGTTCCTCTCCAAGACAGGCTTGGGTTTTCAAATCGGTCTTCAAGTCAGGTTGTTGAGAAAGACAAGTTTGATGCTGCTCGATTTTCTCCTTTCTGGAATGAAATCATAGCAAGTTTACGGGAAGAAGATTATATTACAAATTTGGAAATGGAGTTACTTCAAATGCCTAAAAACAAGGGTAATCTTCCCATGGTTCAGTGGCCCCTTTTTCTTCTTGCCAGCAAGATATTTCTAGCTAAGGATATTGCTGTTGAGAGACGAGATTCACAAGCCGAGTTGTGGGAGCGTATTTCAAGAGATGACTATATGAAATATGCAGTACAGGAATGTTACCACGCCATTAAGCTTATCTTAACGGAATTACTAGTTGGGGAAGGAAGGATGTGGGTTGAAAGGGTATTTGAAGACATTCAAGCTAGTATAGCAAACAATTCCATTATAAATGACTTCCAGCTAAATAAGCTGCCACTTGTGATTACAAGAATAACTGCTCTGACGGGTATTCTGAAAGAGCCAGAAACTTCGGAGCTGGAAAAAGGGGCTGTTAAGGCTGTTCAAGATTTGTATGATGTTGTGCACTATGATATCCTTTTCGGTGACAAGAGGGGGCACTATGAAACATGGAACATATTAGTAAAAGCCAGAAATGAAGGTCGCTTGTTTACAAAGTTAAATTGGCCGAAAGATCCAGAATTGAAGTCACAAGTCAAAAGATTGCATTCCCTCTTAACCATTAAAGATTCAGCTTCAAATATTCCAGTTAATCTTGAGGCCCGACGAAGACTGCAATTCTTTACAAATTCACTTTTCATGGTGATGCCAACTCCAAAACCTGTTCGTCAGATGCTTTCCTTCAGTGTATTCACTCCATATTATTCCGAGACGGTGCTCTATAGTATGGGGGAACTCCTGAAGAAAAATGAGGATGGGATAACAACCTTGTTTTACTTGCAAAAAATTTATCCAGATGAATGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGCCGAGATGAGAATGAAGTTGACCCAGAATCGTTTGACAACCCTAATGACATCCTTGCACTGCGGTTTTGGGCCTCTTATCGGGGACAGACGTTAGCAAGAACTGTTCGTGGAATGATGTACTATAGGAAAGCTCTTATGCTGCAGACTTATTTAGAGAGAGGAACCTATGGAGATTTGGAAGCTGCCATTCCTTGTACTGATGCTACTGATACTCGAGGTTTCGATTTATCTCCTGAAGCACGTGCACAGGCAGATCTTAAATTTACATATGTTGTGACGTGTCAGATATATGGAAGACAAAGAGAACAACAAAAACCTGAGGCCTCTGACATTGCACTGCTCATGCAAAGGAATGAAGCCCTTCGTGTTGCATACATTGATGATATTGAAACCCTAAAGGATGGTAAGGTGCACAAAGAATTTTACTCAAAGCTTGTAAAGGCTGATATCAATGGAAAAGATAAGGAGATATATTCAATCAAATTGCCTGGAGATCCAAAGTTGGGTGAAGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTATTGTTTTTACTCGTGGAAATGCTGTTCAGACAATTGATATGAATCAGGATAATTACTTTGAAGAAGCATTGAAGATGAGAAATCTTCTTGAGGAATTTGGTTGTGATCATGGTATTCGTCCTCCTACCATACTGGGTGTCAGGGAACATGTATTTACGGGGAGTGTTTCATCTCTTGCATCATTCATGTCAAATCAAGAAGCTAGTTTTGTGACTCTTGGTCAGCGTGTTCTGGCAAATCCCTTGAAAGTGCGTATGCATTATGGCCATCCAGATGTTTTTGATAGGGTTTTTCATCTAACACGAGGTGGCATCAGCAAGGCCTCCCGTGTTATCAACATTAGTGAAGATATCTTTGCAGGATTTAATACAACATTGAGGCAAGGGAACGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTCGGTAAAGGACGAGATGTTGGTCTTAACCAGATTGCTCTTTTCGAAGGAAAGGTTGCTGGTGGTAATGGAGAACAAGTTCTTAGCCGTGATGTATATAGGCTTGGCCAACTGTTTGATTTTTTCCGGATGATGTCATTCTATTTCACCACTGTTGGCTACTACTTTTGTACTATGTTAACGGTGCTGACTGTGTACATTTTTCTCTATGGAAAAGCATATTTGGCACTATCTGGAGTTGGTGAGACCATTGAAGATAGAGCTAATATTACAGATAATACGGCATTGTCAGCTGCTTTGAATACACAGTTCCTCATCCAAATTGGTATCTTCACTGCCGTGCCTATGATCTTGGGGTTCATATTGGAGCAAGGTTTCTTCAGGGCTATTGTCAGCTTCATAACCATGCAGCTTCAGCTTTGTTCTGTCTTCTTCACATTCTCTCTTGGCACAAAAACTCACTATTTTGGCCGAACAATTCTTCATGGTGGCGCGAAGTATCATGCAACTGGAAGGGGATTTGTGGTTCGCCATATCAAATTCTCTGAAAATTACAGATTGTACTCCCGCAGCCATTTTGTTAAAGGATTGGAAGTTGTGCTTCTGTTGGTTGTATACATGGCCTATGGATATAGTTCAGGTGGTTCGTTAGCATACATCCTTGTAACTCTTAGCAGTTGGTTCATGGCAATATCTTGGCTTTTTGCTCCCTATCTGTTCAACCCGTCAGGGTTTGAGTGGCAGAAGACCGTGGAGGATTTCAGGGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGAGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAAGCATGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAAACCATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACAATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGAATTGTTTATAAGCTCCATGTGCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGTTCTCTTGGATTGTGTTAGCTGGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTCAGCCAAAAGATGACTGTCAATTTTCAGCTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTCTTTCCTTTTGACGCTAGCTGGCCTGGCAGTTGCTGTTGCTATTACAGATTTGTCACTGCCTGATGTGTTTGCTTGCATCTTGGCATTTGTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTTTAATAAAGAAACTGGGACTCTGGAAATCCATTCGCTCAATTGCTCGGCTGTATGATGCTGGGATGGGGATGCTCATCTTTATCCCCATTGCATTCCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCGACATTTCAAACTCGTCTTATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTCGAGATCTCTCTAATTCTTGCTGGAAACAATCCCAACACTGCCTTATGA 5940 41.04 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1979
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 27901461 27960824 + CmPI595203_03g019890.1 Cmu03g1989 412775
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cmu03g1989 1979 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 135 1973 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Cmu03g1989 1979 SMART FKS1_dom1_2 412 524 IPR026899 -
Cmu03g1989 1979 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1102 1791 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
Cmu03g1989 1979 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 414 521 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cmu03g1989 Cmu-Chr3:27901461 Cmu06g1813 Cmu-Chr6:29038063 0.00E+00 dispersed
Cmu03g1989 Cmu-Chr3:27901461 Cmu03g1991 Cmu-Chr3:27980224 6.80E-97 proximal
Cmu03g1989 Cmu-Chr3:27901461 Cmu03g1992 Cmu-Chr3:27998019 3.10E-73 proximal
Cmu03g1989 Cmu-Chr3:27901461 Cmu03g1993 Cmu-Chr3:28009576 1.70E-127 proximal
Cmu03g1988 Cmu-Chr3:27861554 Cmu03g1989 Cmu-Chr3:27901461 0.00E+00 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cmu03g1989 K11000 - csv:101216435 3539.58