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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cmu06g1226 ATGGGCGTCACCATTCTTCCAGATCTCGGGGCTCAGATTTTCATTCCCCTTTGTGCTCTAGTCGGTATCCTCTTCTCTTTGGTGCAGTGGTACTACGTTTCACAAGTTAAGCTCTCTTCTTCCCGAGATTCCTCTAATAACAACTCCGCCGCTGCTAAAAATGGCTACTCCGACTACCTTATTGAGGAGGAAGAAGGTGTCAACGACCATAACGTTGTTATTAAATGTGCCGAAATTCAGAACGCCATCTCTGAGGGGGCAACCTCCTTCCTTTTCACGGAGTACTACTATGTTGGCATATTTATGGTATTGTTTGCAGTCTTGATTTTTGTATTCCTTGGGTCAGTGGAGGGTTTTAGTACCAAGCCCCAAGCGTGCTCATATGACAAAACAAAGACTTGCAAGCCAGCTTTGGCGACGGCTATATTCAGCACTGTATCATTTATACTTGGTGCAGTTACTTCAGTGGTTTCTGGATTCCTTGGAATGAAAATTGCTACATATGCAAATGCCAGAACCACCTTGGAGGCAAGAAAAGGTGTTGGAAAGGCATTTATTACTGCTTTTAGGTCTGGTGCTGTCATGGGCTTCCTCCTAGCAGCCAATGGTCTCTTGGTTTTGTTTATTGCCATTAACCTCTTCAAATTGTACTATGGTGAAGATTGGGGTGGTCTTTTTGAGTCTATCACTGGGTATGGTCTTGGTGGATCTTCCATGGCTCTCTTTGGTAGAGTTGGTGGTGGTATCTACACTAAAGCTGCTGATGTTGGTGCTGACCTTGTGGGTAAGGTGGAAAGGAACATTCCTGAGGATGATCCAAGAAATCCAGCTGTGATTGCTGATAACGTCGGTGACAATGTTGGGGATATTGCTGGTATGGGATCTGATCTTTTTGGTTCATATGCTGAATCATCCTGTGCTGCTCTTGTTGTTGCTTCTATCTCCTCTTTCGGCAACAACCATGAGTTCACACCAATGCTCTATCCTCTCATAGTTAGTTCTATGGGTATCCTTGTTTGCCTGATCACCACTTTATTTGCAACTGATTTCTTTGAGATCAAGGCTGTTAAGGAAATTGAGCCAGCATTGAAGAAGCAACTCATAATTTCCACTGTTCTAATGACCTTTGGAATTGCAATTGTTACTTGGTTGGCTGTTCCATCGAAATTTACCATCTTCAATTTTGGAACTCAAAAAGTTGTACAGAACTGGGAACTTTTCTTGTGCGTTGCTGTTGGTCTTTGGGCTGGGCTTATAATAGGATTTGTGACAGAGTATTACACTAGCAATGCATACAGCCCCGTGCAAGATGTTGCTGATTCTTGCCGAACTGGAGCTGCTACAAATGTTATTTTTGGCTTGGCCTTGGGATACAAATCTGTCATTATCCCTATTTTTGCAATTGCAGTTAGCATTTTTGTGAGTTTCTCCTTTGCTGCAATGTATGGCATTGCCGTTGCTGCCCTTGGAATGTTGAGTACAATTGCTACTGGTTTGGCCATTGATGCATATGGTCCAATCAGTGACAATGCTGGAGGCATTGCAGAGATGGCTGGCATGAGCCACAGAATTCGGGAGAGAACCGATGCCCTCGATGCTGCTGGAAACACAACTGCAGCCATTGGAAAGGGTTTTGCCATTGGCTCAGCTGCTCTTGTGTCCCTTGCCCTCTTCGGTGCCTTTGTCAGCCGTGCTGGTGTCAGTGTTGTTGACGTCTTGACACCCAAAGTTTTCATTGGCTTGATCGTGGGTGCTATGTTGCCCTACTGGTTTTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTTGGGAGTGCAGCCCTAAAGATGGTTGAGGAGGTGCGAAGGCAATTTAACACCATCCCAGGTCTCATGGAGGGTACCGCCAAGCCCGACTATGCTACATGTGTCAAGATCTCAACTGATGCTTCTATCAAGGAGATGATCCCACCAGGTGCCCTTGTCATGTTGACACCCCTAATTGTTGGTATCCTATTTGGAGTCGAAACTCTTTCTGGCGTTCTTGCTGGATCCCTTGTTTCTGGTGTGCAGATTGCTATCTCTGCATCCAACACCGGAGGTGCCTGGGACAATGCTAAGAAGTACATCGAGGCTGGTGCCTCTGAGCATGCAAGAACCCTTGGCCCGAAAGGATCAGATCCACACAAAGCCGCTGTTATCGGTGACACAATCGGAGACCCACTCAAGGATACATCGGGACCTTCCCTCAACATTCTTATCAAGTTGATGGCTGTTGAGTCCCTTGTGTTTGCTCCTTTCTTCGCCAGCCACGGTGGTATTCTCTTCAAGATCTTCTAA 2307 45.82 MGVTILPDLGAQIFIPLCALVGILFSLVQWYYVSQVKLSSSRDSSNNNSAAAKNGYSDYLIEEEEGVNDHNVVIKCAEIQNAISEGATSFLFTEYYYVGIFMVLFAVLIFVFLGSVEGFSTKPQACSYDKTKTCKPALATAIFSTVSFILGAVTSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLAANGLLVLFIAINLFKLYYGEDWGGLFESITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGNNHEFTPMLYPLIVSSMGILVCLITTLFATDFFEIKAVKEIEPALKKQLIISTVLMTFGIAIVTWLAVPSKFTIFNFGTQKVVQNWELFLCVAVGLWAGLIIGFVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAVSIFVSFSFAAMYGIAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAGVSVVDVLTPKVFIGLIVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGTAKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLTPLIVGILFGVETLSGVLAGSLVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSDPHKAAVIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFASHGGILFKIF 768
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 23444840 23449198 + CmPI595203_06g012260.1 Cmu06g1226 418886
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cmu06g1226 768 PIRSF H+-PPtase 12 766 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cmu06g1226 768 NCBIfam V-type H(+)-translocating pyrophosphatase 12 763 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cmu06g1226 768 PANTHER K(+)-INSENSITIVE PYROPHOSPHATE-ENERGIZED PROTON PUMP 6 766 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cmu06g1226 768 Hamap Putative K(+)-stimulated pyrophosphate-energized sodium pump [hppA]. 9 758 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
Cmu06g1226 768 Pfam Inorganic H+ pyrophosphatase 74 753 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cmu02g1501 Cmu-Chr2:28718131 Cmu06g1226 Cmu-Chr6:23444840 0.00E+00 dispersed
Cmu06g1226 Cmu-Chr6:23444840 Cmu09g0169 Cmu-Chr9:1850284 4.40E-116 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cmu06g1226 K23025 - csv:101222673 1443.33