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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cone6ag0490 ATGGGTTATATTGGGGCACATGGTGTGGCGGCTCTGCATAGATACAAGTATAGTGGTGTGGATAACTCATATACAGCTAAATATGTATTGCAACCCTTTTGGACTCGCTTCGTTACTTTCTTCCCGCTTTGGATGCCCCCAAACATGATAACACTCATGGGATTCATGTTCTTGGTCACATCAGCACTGCTTAGCTATATATATTCACCTCGATTAGATACACCTCCACCAAGATGGGTTAATTTTGCTCATGGAGTAATTCTCTTTCTATATCAGACCTTTGATGCTGTGGATGGGAAGCAAGCAAGGAGGACAAATTCCTCAAGTCCCTTGGGAGAACTCTTTGATCATGGTTGTGATGCGCTTGCTTGTGCATTCGAAGCCTTGGCTTTGGCAAATACGGCCATGTGTGGAAGGCTTACTTTCTGGTTCTGGGTAATCTCAGCCGTTCCTTTTTATTGCGCTACTTGGGAACACTATTTCACCAATACCCTGATTCTTCCTGCTATAAATGGACCTACGGAGGGTCTCATGCTGATCTATTTGTGTCATATCTTCACAGCCTTTGTTGGTTCTGAGTGGTGGGCTCAAGAATTTGGGAAGTCCTTGCCAATTTTTAGTTGGGTTCCATTTGTTAGTGAAATCAAGACAAATGAAGCTGTGTTGTTTTTAATGATATTTTTTGCTGTTATCCCGACAGTCACATTCAATGTGTCAAATGTTTATAAGGTTGTTCAATCGAGAAATGGAAATATGCTACTAGCTTTAGCAATGCTCTTCCCTTTTGTGGTGCTGCTGGGAGGGGTTTTAGCATGGGATTATTTGTCTCCTTCGGATATTCTTCGAAACTATCCACATTTGGTTGTAATTGGAACTGGACTCACTTTTGGATTTATGGTGGGAAGGATGATTCTAGCTCACCTTTGTGATGAACCCAAGGGCTTGAAAACTGGAATGTGCATGTCACTATTGTATCTCCCTTTTGCTATTGCAAATGCACTTACAGCTAGACTTAATGATGGGGTTCCTTTAGTAGATGAAAAATTGGTTCTTCTTGGTTATTGTGTGTTTGCCGTGGCTCTCTATATGCACTTTGCTACCTCTGTCATTCACGAGATTACAGATGCTTTGGGAATTTGTTGCTTCAGGATAACTAGGAAAGAAGCTTGA 1170 41.71 MGYIGAHGVAALHRYKYSGVDNSYTAKYVLQPFWTRFVTFFPLWMPPNMITLMGFMFLVTSALLSYIYSPRLDTPPPRWVNFAHGVILFLYQTFDAVDGKQARRTNSSSPLGELFDHGCDALACAFEALALANTAMCGRLTFWFWVISAVPFYCATWEHYFTNTLILPAINGPTEGLMLIYLCHIFTAFVGSEWWAQEFGKSLPIFSWVPFVSEIKTNEAVLFLMIFFAVIPTVTFNVSNVYKVVQSRNGNMLLALAMLFPFVVLLGGVLAWDYLSPSDILRNYPHLVVIGTGLTFGFMVGRMILAHLCDEPKGLKTGMCMSLLYLPFAIANALTARLNDGVPLVDEKLVLLGYCVFAVALYMHFATSVIHEITDALGICCFRITRKEA 389
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 2438873 2445621 - Conep06aG0050000.1 Cone6ag0490 439374
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cone6ag0490 389 ProSitePatterns CDP-alcohol phosphatidyltransferases signature. 98 120 IPR048254 -
Cone6ag0490 389 PANTHER ETHANOLAMINEPHOSPHOTRANSFERASE 2 387 IPR014472 -
Cone6ag0490 389 Gene3D - 22 272 IPR043130 -
Cone6ag0490 389 Pfam CDP-alcohol phosphatidyltransferase 46 163 IPR000462 GO:0008654(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:0016780(InterPro)
Cone6ag0490 389 FunFam Choline/ethanolaminephosphotransferase 1 22 248 - -
Cone6ag0490 389 PIRSF CHOPT 1 389 IPR014472 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cone6ag0490 Cone-Chr6:2438873 Cone9ag0502 Cone-Chr9:2404909 4.76E-286 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cone6ag0490 K00993 - vvi:100259768 679.478