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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cpe04g00947 ATGGTTGCTTTCTTTGCTATTCTTATGGGTTGTGGCTTGAGGGGAACATGGAGTGTTGAGGCTCTGACCATAGTTGCATTTAACAATGGAAACTTTAATATGAAGACCCTGCTGGAAGTTCTGAGTCTTGGTCCAACGTTTGTTGTTATGAAGTTTATTGGGAGTGTTCTAGACATCCTAATGATGTATGGTGCATACTCTACCTCAAGGCGCCTTGCTATTTCTCGAATTTTTCTTCGTTTCCTTTGGTTCAGTATTGCTTCTGCTTCGATAACGTTTCTTTATGTGAAAGCTCTTCAGGAGGGTAGTAACCCAAATGCAGAAAGGGTGATGTTTAGACTATATGTAATCGTGATTGGAATATATGGTGGTGTGCAGCTTTGCCTCAGTATTCTGATGTGTATACCTGCTTTCCATCTTCTAACAAATCAATGTGATCGGTGGCCTCTTGTTCGCTTTATCATGTGGATGCAACAGGAACGGTACTATGTTGGACGTGGGATGTATGAGAAGACTACTGATTTTATCAAGTACATGCTCTTGTGGGTAATCATTCTGGGTGGAAAATTCGCATTTGCCTATTTTCTTCAGATCAAGCCTCTTGTTAAACCTACCAGGCTTATTGTGAACATGAAAGATCTAAAATATTCGTGGCATGACTTTGTGTCTAAGAATAATCATAATGCTTTGACGGTTCTTAGCTTATGGGCCCCAGTGTTTGCTATTTACATCGTGGACCTTCATGTGTTCTATACCGTTGTATCTGCTATTTGGAGTTTATTAATTGGTGCAAGAGATCGTCTTGGAGAGATTAGATCATTGGAATCGCTTCGTAAGCTGTTTGAGCAGTTTCCAGGAGCCTTTATGAACACTTTACATGCTACTCCCCGGGACAGGATTTCAAATCAGTCTTCAACTCCGGTTGTTGAAAAAGATAAGTTTGATGCTGCCCGATTTTCTCCCTTCTGGAATGAAATCGTAGCAAGTTTAAGGGAAGAAGATTATATTACAAACTTGGAATCGGAGTTGCTTCAAATGCCTAAAAACAAGGGTAATCTTCCCCTGGTTCAGTGGCCCCTTTTTCTTCTTGCCAGCAAGATATTTCTAGCAAAGGATATTGCTGTTGAGAGACGGGATTCACAAGACGAGTTGTGGGAGCGTATTTCAAGAGATGACTATATGAAATATGCAGTACAGGAATGTTACCATGCAATTAAGCTCATCTTAACAGAATTACTGGTTGGGGAAGGAAGGACGTGGGTTGAAAGGGTATTTGAAGACATTCAAGCTAGTATAGCAAACAATTCCATTCAAAATGACTTCCAGCTAAATAAGCTACCACTTGTGATTACAAGAGTAACTGCTCTGACGGGTATTCTGAAAGAGCCAGAAACTCCGGAGCTCGAAATAGGTGCTGTTAAGGCTGTTCAAGATTTGTATGATGTTGTGCACCATGATATCCTTTTTGGTGACAAGAGGGGGCATGATGAAACATGGAACATATTGGTAAAAGCTAGAAATGAAGGTCGCCTGTTTACAAGGTTAAATTGGCCCAAAGATCCAGAATTGAAGTCTCAAGTGAAAAGATTACATTCCCTGTTAACCATAAAAGATTCAGCTTCAAATATTCCAGTTAATCTTGAGGCCAGACGTAGACTGCAATTCTTTACAAATTCACTTTTCATGGCTATGCCAAATCCAAAACCTGTTCGTCAGATGCTTTCTTTCAGTGTATTTACTCCATATTATTCTGAGACGGTGCTCTATAATGAATGGAAGAATTTTCTTGCTCGAATTGGCCGAGATGAGAATGAAGTTGACCCAGAATCGTTTGATAATCCTAATGACATCCTTGCACTACGATTTTGGGCCTCTTATCGAGGACAGACATTAGCAAGAACTGTTCGTGGAATGATGTACTATAGGAAAGCTCTTATGCTGCAGACTTATTTAGAAAGAGGAACTTACGGAGCTGCCATTCCTTGTACTGATGCTACTGATACTCGGGGTTTCGATTTATCTCCTGAAGCACGTGCACAGGCAGATCTTAAATTTACGTATGTTGTGACCTGTCAGATATATGGAAGACAAAGAGAACAACAAAAACCTGAGGCTTCTGATATTGCATTGCTTATGCAAAGAAATGAAGCTCTTCGTGTTGCCTACATTGAAGATATTGAAACCCAAAAGGATGGTAAGGTGCACAAAGAATTTTACTCAAAGCTGGTGAAGGCTGATATCAATGGAAAAGATAAGGAGATATATTCCATCAAATTGCCTGGAGATCCAAAGTTGGGTGAAGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTGTTATTTTTACTCGTGGAAATGCTGTTCAGACAATTGATATGAATCAGGATAATTACTTTGAAGAAGCATTGAAAATGAGAAATCTTCTTGAGGAATTTAGTAAAGATCATGGTATTCGTCCTCCTACCATACTGGGTGTCAGGGAACATATATTTACGGGCAGTGTTTCATCTCTGGCTTCATTCATGTCAAATCAAGAAGCTATTTTTGTGACTCTTGGTCAGCGTGTTCTGGCAAATCCCTTGAAAGTTCGTATGCATTATGGCCATCCCGATGTTTTTGATAGGGTTTTCCATCTAACACGAGGTGGCTTCAGCAAGGCCTCCCGTGCTATCAACATTAGTGAAGATATCTATGCAGGATTTAATACAACTTTGCGACAAGGAAACGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTCGGTAAAGGACGAGATGTTGGTCTTAATCAGATTGCTCTTTTCGAAGGGAAGATTGCTGGTGGTAATGGAGAACAAGTTCTTAGCCGTGATGTATACAGACTTGGCCAACTGTTTGATTTTTTCCGGATGATGTCATTCTATTTTACGACTGTTGGCTACTACTTTTGTACTATGTTAACGGTGTTGACTGTGTACATTTTTCTCTATGGAAAAGCATATTTGGCACTGTCTGGAGTTAGCGAGGGCATGGAAGATAGAGCCCATATTACAGATACTGCTGCATTGTCAGCTGCTTTGAATAAACAGTTCCTTATCCAAAATGGTATCTTCACTGCAATGCCGATGATCTTGGGATTTATTTTGGAGCAAGGTTTCTTCAGGGCTATTGTCAGCTTTATAACCATGCAGCTTCAGCTTTGTTCTGTCTACTTCACATTCTCTCTTGGCACAAATACTCACTATTTTGGCCGAACAATTCTTCATGGTGGTGCAAAGTATCATGCAACTGGAAGGGGCTTTGTGGTTCGCCATATCAAATTCTCAGAAAATTACAGAATGTACTCTCGCAGCCATTTTGTTAAAGGATTGGAAGTTGTGCTCCTGTTGGTTGTATACATGGCCTACGGATATAGTTCAGGTGGTTCGTTAGCATACATCCTTGTCACTCTTAGCAATTGGTTCATGGCAATATCGTGGCTTTTTGCTCCCTATTTGTTCAATCCATCGGGGTTTGAATGGCAGAAGACCGTGGAGGACTTCAGAGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGTGGTGGAGTTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAAACTCTTGAAGGGCGGATAGCAGAGACTATTCTGAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGCATTGTTTACAAGCTCAATGTGCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGCATATGGGTTCTCCTGGATTGTGTTAGCTGGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTTCTTACCTTGAGCCAGACGATGACCGTCAATTTTCAGCTTTTGTCGCGTTTTATCCAAGGTCTATCTTTCCTTTTGACGCTGGCTGGCATGGCCGTTGCGGTTGCTATTACAGACTTGTCACTGCCTGATATATTCGCTTGCATCTTGGCATTTGTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTCTAGAATGACACAAGTTGAGGAGTTATGGGAACGCTTAGTTCGAGCTGCCTTGAGAAGAGATAGAATTGGCATTGATGCATATGGACGCCCTGAAAGTGGCATTGCTGGAAATGTACCATCTTCACTTGCAAACAATAGGGATATTGATGAAATCTTGAGAGCTGCAGATGAAATCCAAGATGAAGATCCCAATGTTGCGAGAATATTATGTGAGCATGCATATTCGCTTGCACAAAACCTGGATCCGAATAGTGAAGGAAGAGGTGTTTTGCAATTCAAAACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTAGCCAAGAGGGAGGGTGGAACCATAGATAGAAGTCAGGACGTTACTCGGTTACAAGAGTTCTACAGACTATACCGAGAGAAAAATAATGTAGATAAGCTTCGGGAAGATGAAATGAAATTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGTGGTAACCTTGGAGAGTAA 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1471
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
4 8558581 8584553 + Cp4.1LG04g11840.1 Cpe04g00947 468509
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cpe04g00947 1471 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 18 590 - -
Cpe04g00947 1471 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 18 590 - -
Cpe04g00947 1471 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 590 1315 - -
Cpe04g00947 1471 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1317 1465 - -
Cpe04g00947 1471 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1317 1465 - -
Cpe04g00947 1471 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 590 1315 - -
Cpe04g00947 1471 Gene3D - 1349 1461 IPR023175 -
Cpe04g00947 1471 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 613 1204 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Cpe04g00947 1471 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 543 591 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cpe04g00947 Cpe-Chr4:8558581 Cpe04g01602 Cpe-Chr4:12446130 1.45E-49 dispersed
Cpe18g00887 Cpe-Chr18:8029246 Cpe04g00947 Cpe-Chr4:8558581 1.92E-08 dispersed
Cpe04g00947 Cpe-Chr4:8558581 Cpe04g00948 Cpe-Chr4:8591331 0 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cpe04g00947 K11000 - csv:101216435 2372.04