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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cpe04g00948 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5190 41.16 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1729
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
4 8591331 8624883 + Cp4.1LG04g11850.1 Cpe04g00948 468510
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cpe04g00948 1729 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 172 275 IPR026899 -
Cpe04g00948 1729 SMART FKS1_dom1_2 170 283 IPR026899 -
Cpe04g00948 1729 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1129 1568 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Cpe04g00948 1729 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1128 1574 - -
Cpe04g00948 1729 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1128 1574 - -
Cpe04g00948 1729 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1574 1728 - -
Cpe04g00948 1729 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 22 1129 - -
Cpe04g00948 1729 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 22 1129 - -
Cpe04g00948 1729 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1574 1728 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Cpe04g00948 Cpe-Chr4:8591331 Cpe05g01061 Cpe-Chr5:7017017 0 dispersed
Cpe04g00946 Cpe-Chr4:8537719 Cpe04g00948 Cpe-Chr4:8591331 4.79E-16 proximal
Cpe04g00947 Cpe-Chr4:8558581 Cpe04g00948 Cpe-Chr4:8591331 0 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cpe04g00948 K11000 - csv:101216435 2907.09