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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa01g00076 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1906
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
1 450196 483763 - CsaV3_1G000760.1 Csa01g00076 514573
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa01g00076 1905 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1 1903 - -
Csa01g00076 1905 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 349 457 IPR026899 -
Csa01g00076 1905 SMART FKS1_dom1_2 347 460 IPR026899 -
Csa01g00076 1905 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1030 1723 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Csa01g00076 1905 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1 1903 - -
Csa01g00076 1905 Coils Coil 155 175 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa01g00076 Csa-Chr1:450196 Csa02g01614 Csa-Chr2:15195777 0 dispersed
Csa01g00076 Csa-Chr1:450196 Csa01g03112 Csa-Chr1:27136646 0 transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa01g00076 K11000 - csv:101217890 3791.51