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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa01g03112 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CAATCCGTCTGGGTTTGAGTGGCAAAAGACAGTGGAGGATTTCAGGGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGTGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGTTGGGAAGCATGGTGGGACTCGGAACTGGCGCACATAAAAACCTTTGAAGGCCGGATAGCAGAGACTATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATACGGAATTGTTTATAAGCTCCATGTGCAGGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGTTCTCCTGGATCGTGTTAGCTGGGCTTATCGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTCAGCCAGAAGATGACTGTCAATTTCCAGCTTTTGTTGCGATTTATCCAAGGTCTTTCTTTCTTTTTGACGCTGGCTGGCCTGGCAGTTGCGGTTGCTATTACAGATTTGTCACTGCCTGATGTATTTGCTTGCATCTTGGCATTCCTACCTACTGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTTTGATAAAGAGACTGGGACTCTGGAAATCCATTCGCTCAATTGCTCGGCTATATGATGCTGGGATGGGGATGCTCGTCTTTATTCCCATTGCATTCCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCAACATTCCAAACTCGTCTTATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTTGAGATCTCTCTAATTCTTGCTGGAAACAATCCCAACACTGCCCTATGA 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1907
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
1 27136646 27191095 - CsaV3_1G042280.1 Csa01g03112 517609
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa01g03112 1906 Gene3D - 33 183 IPR023175 -
Csa01g03112 1906 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
Csa01g03112 1906 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 1 1905 - -
Csa01g03112 1906 Coils Coil 126 146 - -
Csa01g03112 1906 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1029 1718 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Csa01g03112 1906 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 1 1905 - -
Csa01g03112 1906 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa01g03112 Csa-Chr1:27136646 Csa02g01614 Csa-Chr2:15195777 0 dispersed
Csa01g03112 Csa-Chr1:27136646 Csa01g03113 Csa-Chr1:27196174 0 tandem
Csa01g00076 Csa-Chr1:450196 Csa01g03112 Csa-Chr1:27136646 0 transposed
Csa01g03112 Csa-Chr1:27136646 Csa07g02056 Csa-Chr7:19892115 0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa01g03112 K11000 - csv:101216435 3808.84