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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa02g00853 ATGGAGCATGGAGGTGTTGTGTCGAAGGGGATGGCGTCAGACCCTTCAAGTTCGTACCAAAAAATAATAATAGTTGCAGCTATTGCAGCCGGAGTCCAATTTGGTTGGGCTCTACAGCTTTCATTGCTAACACCTTACGTCCAACAACTTGGAGTTTCACATACATGGTCCGCTTTCATATGGCTTTGCGGACCATTATCAGGACTTATTGTGCAACCCACTGTCGGGTACTACAGTGATCGCTGCACCTCTAGGTTTGGTCGTCGTCGGCCGTTCATTGTTGCTGGATCTACTTTTGTGGCAACTGCAGTTTTCCTCATTGGCTTTGCTGCAGACATTGGGCATGCAGTGGGTGATCCGCTTAACAAACCCACAAAACCAAGAGCTGTTGCCATCTTTGTGGTTGGATTTTGGGTTCTTGATGTTGCTAACAACATGCTCCAAGGCCCTTGTAGAGCTCTGTTGGCAGATATGTCATGTAACAACCACAAGAAGATGAGAATGGCCAATGGATTTTTCTCATTCTTCATGGGGGTAGGGAATGTTTTGGGGTACGCAGCTGGGTCCTATAACAAACTCTACAAATTCCTTCCCTTCACACTAACCAAAGCATGTGACAGTTACTGTGCCAACCTCAAAACATGCTTCTTGATCGACATTGTATTCCTTCTCCTCGTTACCACGTTCGCTGTGTTGATGGTGAGCGAGAACCAATTTGACCCATTGGAGATTGACGAAGAAGCAACACCCTTTTTCGGGAAATTGTTTGGAGCACTCAAGAAGTTGGAGAGGCCAATGTGGCTTTTGTTGCTGGTAACAGCCTTGAACTGGATCGGTTGGTTCCCATTTATCATGTACGATACTGACTGGATGGGTTTGGAAGTGTACGGAGGAAAGCCAAAGGGGAGTCCTGAAGAAGTCAAGTTCTATGACCTTGGTGTTCGTGCTGGGGCCCTTGGGTTGATGGTAAACTCATTTGTTTTGGGATTTTCAGCTTTGGGAATTGAGCCAATAAGTCGTATTTTAGGAGGCCTCAGATGGTGGTGGGGAATTGTTAACATTATATTTACAGTTTGCATGGGATCCACCGTCGTGGTTACAAAGGTTGCTGAGCGTTGGAGGTCCGTTAATGGTTTGCGTCCTCCTCCACTAAACGTCAGGGCAGGAGCATTTTCGATCTTTGCGATATTGGGTATTCCATTGTCAGTCACTTTTAGTGTTCCATTTGCGCTTGCGTCCATCTTTTCTTCAGAATCGGATGCGGGTCAAGGCCTCTCCTTGGGAATTCTCAACCTCTTCATTGTGATTCCACAGTTTATCGTATCCGCAGTTAGTGGGCCATTAGATGCTGCTTTCGGAGGAGGAAACTTACCCGCATTCGTAATGGGTGGAATTGCTTCTTTTGCAAGTGCAATGTGTGCAATGTTCGTCCTCCCGCGATCCACCACCTCAATCCGATGTCTCCTTAACAATGGGCGGTGGTCATTGATTCTTCCAACTTTATCAGATTTTCACCGTTCCTCTCATTATTTTTTGTCCATTTTCTCTACTCTTTTCTTTGTTAATTCTTTGTATGAGATAATAAACGTAGAATAA 1596 45.49 MEHGGVVSKGMASDPSSSYQKIIIVAAIAAGVQFGWALQLSLLTPYVQQLGVSHTWSAFIWLCGPLSGLIVQPTVGYYSDRCTSRFGRRRPFIVAGSTFVATAVFLIGFAADIGHAVGDPLNKPTKPRAVAIFVVGFWVLDVANNMLQGPCRALLADMSCNNHKKMRMANGFFSFFMGVGNVLGYAAGSYNKLYKFLPFTLTKACDSYCANLKTCFLIDIVFLLLVTTFAVLMVSENQFDPLEIDEEATPFFGKLFGALKKLERPMWLLLLVTALNWIGWFPFIMYDTDWMGLEVYGGKPKGSPEEVKFYDLGVRAGALGLMVNSFVLGFSALGIEPISRILGGLRWWWGIVNIIFTVCMGSTVVVTKVAERWRSVNGLRPPPLNVRAGAFSIFAILGIPLSVTFSVPFALASIFSSESDAGQGLSLGILNLFIVIPQFIVSAVSGPLDAAFGGGNLPAFVMGGIASFASAMCAMFVLPRSTTSIRCLLNNGRWSLILPTLSDFHRSSHYFLSIFSTLFFVNSLYEIINVE* 532
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
2 7858083 7859796 - CsaV3_2G010690.1 Csa02g00853 518910
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa02g00853 531 Pfam MFS/sugar transport protein 28 278 - -
Csa02g00853 531 PANTHER SUGAR TRANSPORTER 18 487 - -
Csa02g00853 531 CDD MFS_SLC45_SUC 31 476 - -
Csa02g00853 531 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 22 480 IPR036259 -
Csa02g00853 531 PANTHER SUCROSE TRANSPORT PROTEIN SUC2-LIKE 18 487 - -
Csa02g00853 531 TIGRFAM GPH_sucrose: sucrose/H+ symporter 19 482 IPR005989 GO:0005887|GO:0008515|GO:0015770
Csa02g00853 531 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 16 480 IPR036259 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa02g00853 Csa-Chr2:7858083 Csa02g02236 Csa-Chr2:20093960 1.63E-157 dispersed
Csa02g00853 Csa-Chr2:7858083 Csa02g00855 Csa-Chr2:7878090 0 proximal
Csa02g00853 Csa-Chr2:7858083 Csa02g00856 Csa-Chr2:7878961 2.13E-123 proximal
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa02g00853 K15378 - csv:116401998 954.125