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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa02g01840 ATGTTGAACCTCTTCTCTTTGTCTCACCGCATTTTCATTTCCATCTTCATCTTCCTCTTCCTCGTCTCTCCGCCGTTGCTTCCTTCCTCCGCTCTTCCTCTCTCCGACTCCGATCAACCGCTTCTCGCTAATACTACGCTCCAGTCCAATAATGTTTCCGTTCCGAGGAATAAGGAAGGTAGTTTTGCTGACATCATTGATCGTGCTTTGGAGAATGAGTTCAAGGAGAATGACCAGAATGAAGCAATTGATTCAGGAAGCTTCAACAACAGTGTAGCAGAGCAGCAGGCAACTCTGGAGACTGTGGCAAGGGTGAAGTCAAAGAAAAATGATACGAAAGAGGAAAAGTTTCAGCTTCAAAACGTTTTCAATTTGGACAGTGATAATAGAGCTGAAGATACCCCTACATTGATTGATCGAAAGGACAATGTCTTTATCATATCCAACTTTAAGTCTAAATATCCAGTGCTACAATTAGACTTGAGATTGATATCTGATTTGGTTATCGTAATTGTCTCTGCAACTTGTGGCGGCATTGCCTTTGCCTGTGCTGGACAACCAGTTATAACTGGATACCTTCTAGCAGGATCTATTATTGGACCTGGAGGATTTAACTTTGTCAGTGAAATGGTTCAAGTTGAAACGGTAGCTCAATTTGGTGTAATTTTTCTTCTTTTTGCACTGGGTTTGGAGTTCTCAACAACTAAGCTACGAGTTGTTCGTGCAGTTGCTGTTCTTGGCGGGCTTCTTCAAATTTTCCTATTTATGTGCCTCAGTGGAATCACAGCCTCGTCATGTGGTGGGAGTGCTTCTGAAGGAGTTTTTGTCGGAGCATTCCTATCTATGTCCTCAACAGCAGTGGTGCTGAAATTTTTGATGGAAAAGAACTCTACTAATGCTCTTCATGGACAAGTCACAATTGGCACCCTTATTCTGCAGGACTGTGCTGTTGGGTTACTGTTTGCTTTGCTTCCAGTACTAGGTGGGAATTCTGGTATTCTTCAAGGAGTGATGTCTATGAGTAAAGTGTTGGTGATCTTGGTTGGTTTTTTGGTTGCTTTGTCAATTTTATCCCGTACATGTATTCCTTGGCTCTTAAAACTGATGATAAGTCTATCATCACAGACCAACGAACTTTATCAATTAGCCTCAGTGGCGTTCTGCTTGCTTGTAGCCTGGTGTAGTGATAAGTTGGGCCTCAGTCTAGAATTGGGTTCCTTTGCCGCTGGAGTGATGATATCCACAACTGATCTTGCTCAACACACACTTGAACAAATAGAGCCTATAAGGAACTTTTTTGCGGCCCTTTTTCTTGCCAGCATTGGAATGCTGATACACGTTCAGTTTTTGTGGAACCACGTTGATATATTATTAGCAGCTGTTATACTGGTGATAATTGTAAAAACAATCGTAATTAGCACAGTGGTGAAGGGATTTGGGTATAACAACAGGACAGCACTTTTGGTTGGAATGTCTTTGGCTCAGATAGGAGAATTTGCTTTTGTTCTTCTCAGCCGTGCTTCTAATCTTCATCTAGTTGAGGGGAAACTGTATCTATTGCTTATTGGGACCACAGCCCTCAGTCTGGTGACAACTCCTTTTCTTTTCAAGCTAATACCTGCTGTAGTACATTTAGGCGTGCTATTGCGGTGGTTTTCTCCAGATAGTCTCGTTGAGATTGGATTGAAAGGAGACATCATTCGCTCGGACAGTGTAAAGCAACGGGTTATGTTGATAGTCCAGGGACCTCACGATTCATGA 1761 42.42 MLNLFSLSHRIFISIFIFLFLVSPPLLPSSALPLSDSDQPLLANTTLQSNNVSVPRNKEGSFADIIDRALENEFKENDQNEAIDSGSFNNSVAEQQATLETVARVKSKKNDTKEEKFQLQNVFNLDSDNRAEDTPTLIDRKDNVFIISNFKSKYPVLQLDLRLISDLVIVIVSATCGGIAFACAGQPVITGYLLAGSIIGPGGFNFVSEMVQVETVAQFGVIFLLFALGLEFSTTKLRVVRAVAVLGGLLQIFLFMCLSGITASSCGGSASEGVFVGAFLSMSSTAVVLKFLMEKNSTNALHGQVTIGTLILQDCAVGLLFALLPVLGGNSGILQGVMSMSKVLVILVGFLVALSILSRTCIPWLLKLMISLSSQTNELYQLASVAFCLLVAWCSDKLGLSLELGSFAAGVMISTTDLAQHTLEQIEPIRNFFAALFLASIGMLIHVQFLWNHVDILLAAVILVIIVKTIVISTVVKGFGYNNRTALLVGMSLAQIGEFAFVLLSRASNLHLVEGKLYLLLIGTTALSLVTTPFLFKLIPAVVHLGVLLRWFSPDSLVEIGLKGDIIRSDSVKQRVMLIVQGPHDS* 587
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
2 17589047 17598403 + CsaV3_2G025600.1 Csa02g01840 519897
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa02g01840 586 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 168 537 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Csa02g01840 586 Gene3D - 161 544 IPR038770 -
Csa02g01840 586 PANTHER POTASSIUM/PROTON ANTIPORTER-RELATED 14 586 IPR045158 GO:0015386|GO:0071805|GO:1902600
Csa02g01840 586 PANTHER K(+) EFFLUX ANTIPORTER 6 14 586 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa01g02914 Csa-Chr1:25556439 Csa02g01840 Csa-Chr2:17589047 0 dispersed
Csa02g01840 Csa-Chr2:17589047 Csa03g01643 Csa-Chr3:12274677 0 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa02g01840 - - csv:101217282 1027.31