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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa03g01643 ATGGGTTTTCGATTCCATATGGCGAGAAGAGGTGGTGCAATTGGATCGTTCCTCTGTATCCTCGTGGTTTTAATTTCTTCGCATATTCATGTTACAGCCAGATCGGATAAGGAAATTAGGGAGAGATTTTATGGAAACTTGATAAACTCGACGGCTCCGACTTCCGGTGACGGCAGCTTTGCTCAAATGTTCGATAAGGTTCTTGAGAAGGAGTTCTCAGACAATGATCTGCCTGAAGGTTCTGGTGGAAGCAGCTTTAATAGCAGTGTCGCTGATCAGGAGGCAGAGCTGGAAACAGTAGCTAAAATCACACATGAGAAGGGCAAGAAAAATGATAGTCAAAAGGCAAATGGGACAAGAGCATTCCAGTTACAGGATGTTTTTTCTCTGGAAAATGAAGAATCTGATGACGTTACAACGTTGATTGATAAAAAAGACAATGTATTTGTGATGTCAAACAAGAAGTCAAAGTATCCAGTACTTCAAGTAGATTTGAGATTGATCTCAGACTTGGTGGTGGTTATTGTTTCTGCCGCAATTGGAGGAATTATCTTTTCTTGTTTAGGGCAACCTGTTATTGTGGGATATCTTCTTGCGGGATCAATCATTGGACCAGGAGGTCTAAAATTCATCAGCGAAATGGTGCAGGTTGAGACAGTGGCACAATTTGGTGTTGTATTTCTTCTTTTTGCTCTAGGATTGGAGTTTTCTTTGACAAAGTTAAAAGTTGTGGGAGCTGTGGCTATTTTTGGAGGTTTTCTACAGATCATCATATTTATGTTCTTGTGTGGTATCGTTGCCATGTTAAGTGGAGCTAAATTATCCGAGGGTGTATTTGTTGGTTCATTTCTATCAATGTCATCTACAGCAGTGGTGGTCAAGTTCTTGGTAGAACGGAATAGCAGTAATACACTTCATGGTCAAGTTACTATTGGAACACTCATCTTACAGGACTGTGCCGTTGGTTTGTTGTTTGCCTTGCTCCCAGTTTTGGGTGGTCACAATGGTCTTATCTTAGGAATGATATCTATGGGAAAGTTGCTACTGGTGTTGTCAGTATATCTCACAGCCGCATCTATTTTGTCATGGTCATTTGTTCCCCGCTTTCTTAAGTTGATGATGCAGCTGTCGTCTCAAACAAATGAGTTATATCAGCTTGCTGCTGTGGCATTCTGCTTGCTGTCTGCTTGGTGCAGTGATAAGCTGGGCCTCAGTCTTGAGTTGGGTTCCTTTGTAGCTGGAGTTATGGTATCTACCACTGACTTCGGTCAACATACTTTAGATCAGGTGGAACCAATCCGCAATTTGTTTGCAGCTTTGTTCCTTTCAAGTATTGGAATGCTCATTCATGTACATTTTCTGTGGAGCCATTTGGACATTTTGCTAGCGTCTGTAATGCTGGTTGTGTTTGTCAAGACAGCAGTTGCTACCATTGTTGCAAAGGCATTTGGATACGGTATTAGGACTTCTTTCCAGGTCGGGGTCATGCTTGCTCAAATTGGAGAATTTGCTTTTGTCCTCCTAAGCCGTGCTTCAAACCTTCATCTCATTGGGGGGAAGGTTTATCTTCTTCTTCTTGGAACAACGGCACTTAGTCTGGTGACCACCCCTCTTCTGTTCAAATTGATTCCTGCCGTTCTAAATTTAGGGGTTCTCATGCATTGGTTCCCTTCTGAAAACAACATACAAAACGAGGAGAAAGTATCAATGATTGAAGCACATAACAGAATGTTGTGA 1737 41.85 MGFRFHMARRGGAIGSFLCILVVLISSHIHVTARSDKEIRERFYGNLINSTAPTSGDGSFAQMFDKVLEKEFSDNDLPEGSGGSSFNSSVADQEAELETVAKITHEKGKKNDSQKANGTRAFQLQDVFSLENEESDDVTTLIDKKDNVFVMSNKKSKYPVLQVDLRLISDLVVVIVSAAIGGIIFSCLGQPVIVGYLLAGSIIGPGGLKFISEMVQVETVAQFGVVFLLFALGLEFSLTKLKVVGAVAIFGGFLQIIIFMFLCGIVAMLSGAKLSEGVFVGSFLSMSSTAVVVKFLVERNSSNTLHGQVTIGTLILQDCAVGLLFALLPVLGGHNGLILGMISMGKLLLVLSVYLTAASILSWSFVPRFLKLMMQLSSQTNELYQLAAVAFCLLSAWCSDKLGLSLELGSFVAGVMVSTTDFGQHTLDQVEPIRNLFAALFLSSIGMLIHVHFLWSHLDILLASVMLVVFVKTAVATIVAKAFGYGIRTSFQVGVMLAQIGEFAFVLLSRASNLHLIGGKVYLLLLGTTALSLVTTPLLFKLIPAVLNLGVLMHWFPSENNIQNEEKVSMIEAHNRML* 579
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 12274677 12282950 - CsaV3_3G016430.1 Csa03g01643 522548
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa03g01643 578 PANTHER K(+) EFFLUX ANTIPORTER 6 39 572 - -
Csa03g01643 578 PANTHER POTASSIUM/PROTON ANTIPORTER-RELATED 39 572 IPR045158 GO:0015386|GO:0071805|GO:1902600
Csa03g01643 578 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 172 541 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Csa03g01643 578 Gene3D - 165 548 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa02g01840 Csa-Chr2:17589047 Csa03g01643 Csa-Chr3:12274677 0 dispersed
Csa03g01643 Csa-Chr3:12274677 Csa07g00629 Csa-Chr7:4555610 3.34E-32 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa03g01643 - - csv:101207607 1074.69