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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa03g03357 ATGGACAAAGCTTCCAAAAATCAGGTATCATTGAGGGGAGCGAGTGCAAAAGAAATTACGAGGGATGCTCTTGTTCAGAAGGTTATCCAGGAGAGAGAGCTACGTCAATATGCAAGAAAAGCGGCAGCTGCCGCTCTCTTTATTCAGAGAGTTTGGAGGCGCTTCAGAGTGACTAAGATTGCTGCTTTGCAGCTTCAAGAAGAATGGGAGGATTTGTTGAATAATCATTCTGGTGCACAGGGCGGCACATTCATTTCCTGTAATATTTTGAGACCATTTCTCTTCTTTATCTCGTCTTTTCTGAAACGACCGCAAAATATCAAGACCAAAGATATAGATTGTATGAAGAATTGCTTTAAAATCTTGTTAGAAAGCATCAATTCTACTGAATCAAAGAACAACTTCTGCTCCTTGGCCACTGGTACATCTGAAGAAAGAAGAATGTGGACTTACCAATCAAGGAAGCTTATTTCTGTATGCTTATTTATTCTTGTGCATTTTGACAAATTGCAAGTGAAGGAGCAAGAAATTATTGTTACGACCTCTTTGGCCATGCGCCTTGTAGTTGTCTTAACCGATCATCATGTGTGGAAGAATGCTAATGAAAGTAGTCAGGCTGTTGCTGATGCAGCATTGGAGGATTTAATTCATTATCTGGGAACTTCTGAAAGTGGTCTTTACGTTTCAGTCAGGGAATACATGTATAAATGGAGTGTCCTCCAGTCCACACAAAACAACAGTACCATCAAGACAAATGATTTATTAGTTATTACTGTGAGTGCTATAACTTTAGCATTACGACCATTTCATTTAATGATTTCTGATACGATTGGTACTACTCCGTGGGAAGGGCATCATGTTGCTGAACAGTTTTGCCTGTTTCTACTTACAATTCCTGGGTTTATTCAAAATCTGCCACAACTTCTTGTGCCAGCTGTAAAGCATCGATCTATCTTGTTTCCATGCTTCTCGACTCTATTGGCCAAGAAAGAGACAATTTTGCTGGGAATGTCTAATTTAAGTCAATTATCAGTTGAATGTGGCTCTAAGGTTGTTCCGGCAGTCGGGTGGGCTCTTGCTAACATTATATGTTTGGTAGCAGGGAGTGAAACTAAGGCAAGGGATTCTGGTTGGTTCAGTCAGAGTTTAGACTATGTGTTGTATGTTCGTGTGGTTTTCACTTTGGCAGAAAACTTTTTGGATTTGAGTGGGGATTTAGGATGTGGTAAAAAGGAGAACCCAGATATCCTGAGCGTCAATGTAACTTCTTATGAACCCTCTAATGCAGCTGTTCCCAAGAATGAAACGACATCTATGTCCTTGAGCACATCTTTCATTGATATGCTTAGGCCTGTTTGTGACCAGAGGCATCTCACAGATCTTTTGAAAATAGTAAATACAGATGTTTATTCTGATGTTAGCATCGATCAATCAAATAATATGGAATGTATGAAAAGCTTGAAACTGCTTGATATATCATACTTCTACATGTACATGCTCAGAATATTTTCATTATTGAATCCAGTGGTTGGATCCTTACCCATTCTTAATATGTTATCTTTTACTCCTGGATTTCTTGTTGATCTGTGGGGAGTGTTAGAAAGTTCCCTTTTCCCCAGTGATGTTGATGAACCTGAAGATCACTTTCCTGGCTCAAGTAAAATATTAAATAAAGGAAAAAATGAAGGTTCTGGCAAAAAGCAAAATCAAGTCAGTAAGGATGGAAGTAGTAGGTGGGTAACTGTCTTCAATAAGTTCACGAGCAAGTCATCACCAGGTAGTGATCATATGGACACAATTGAAGTACAATCTAGTTCAAGACAGGGGGATGACGACTCGTGCGATTTATGGGACATAAAATCTTTAAGTTGTGGTCCACAAGGTATTTCAAAAGATTTGTCATGTCTGCTCTATCTTTTCAGTGCCACTTATGCTCATCTGCTGTTAGTTCTAGATGACATAGAGTTCTATGAAAAACAGGTTCCATTCAGGCTGGAGCAGCAAAGGAAACTTGCATCAATGCTTAACACGCTTGTGTATAATGGTTTATCCCACGGTACTGGTCAGCAAAACACATCCCTTATGGAATCTGCAATCAGGTGCCTGCATTTGATGTATGAGAGGGATTGCAGACATCAGTTTTGTCCTCCTAGGCTATGGCTTTCACCTGCTAGAACAAGTAGACCACCTGTTGCAGTTGCTGCAAGAACTCACGAAGCTTTATCAGGCAACTTAGGGGCAGATGATACCTCAACAGTTCCAAGTGTAGGATCAATTATTACTACCACACCGCATGTGTTCCCATTTGAGGAAAGAGTTGAAATGTTCAGAGAGTTTGTCAAGATGGACAAAGTCTCCCGAAAAATGGCAGGTGAAGTTGGTGGACCTGGTTCACGATCATTTGAAATCGTAGTTCGTCGTAGCCATGTTGTTGAAGATGGATTCAGACAGTTAAATTCTCTTGGGTCAAAGCTGAAATCAGCTATCCATGTTTCATTTGTTAGTGAATGTGGCCTTCCTGAGGCTGGCCAAGACTGTGGTGGATTATCCAAAGAGTTTCTGACTGATATAGCCAAAGCAGCATTTTCCCCCGAATATGGACTGTTCTCTCAAACCTCTACTCCAGACAGGCATCTTATCCCAAATGCAGCTGCACGATATCTCGACAATGGTATCCAGATGATCGAGTTTCTTGGTAGAGTTGTTGGGAAGGCTCTCTATGAAGGAATATTGCTTGACTATTCATTTTCGCATGTTTTTGTCCATAAGCTATTAGGGCGGTATAGCTTCCTTGATGAGCTATCAACCCTTGATCCTGAGCTCTACAGGAATCTCATGTGTGTCAAGTCTTACGAGGATGACGTCAAAGAACTCTCGTTGGATTTCACTGTAACTGAAGAATCATTTGGCAAACGACATGTTATTGAGCTTAAACATGGTGGCAAGGATATTTCTGTTACAAATGAGAATAAGATGCAGTATGTTCATGCTATTGCTGATTATAAACTTAATCGACAGATATTGCCTTTCTCAAATGCGTTTTATAGGGGTTTAACTGATCTTATATCACCATCTTGGTTGAAGTTATTTAATGCAAGTGAATTCAATCAGTTGCTTTCAGGAGGAAACCATGATATCGACGTCAATGATTTGAGGAATAATACACGATATACAGGTGGTTACACAGAGGGCAGCCGAACAATTAGTATTTTTTGGGAGGTTATTAAAGGATTTGAACCAAAAGATCGATGTTCGCTTCTTAAATTTGTCACCAGTTGTTCTCGAGCTCCATTACTTGGATTCAAATACCTGCAACCAGCTTTTACCATTCATAAGGTTTCGTGTGACGTACCTATTTGGGCTTCAATAGGAGGACAGGATGTTGAGCGGCTTCCAACTGCTTCCACTTGCTACAATACTCTCAAGCTTCCGACGTATAAACGTTCAAGTACTTTGAGATCAAAACTTCTCTACGCGATCAATTCCAACTCAGGATTTGAACTCTCTTAA 3510 40.14 MDKASKNQVSLRGASAKEITRDALVQKVIQERELRQYARKAAAAALFIQRVWRRFRVTKIAALQLQEEWEDLLNNHSGAQGGTFISCNILRPFLFFISSFLKRPQNIKTKDIDCMKNCFKILLESINSTESKNNFCSLATGTSEERRMWTYQSRKLISVCLFILVHFDKLQVKEQEIIVTTSLAMRLVVVLTDHHVWKNANESSQAVADAALEDLIHYLGTSESGLYVSVREYMYKWSVLQSTQNNSTIKTNDLLVITVSAITLALRPFHLMISDTIGTTPWEGHHVAEQFCLFLLTIPGFIQNLPQLLVPAVKHRSILFPCFSTLLAKKETILLGMSNLSQLSVECGSKVVPAVGWALANIICLVAGSETKARDSGWFSQSLDYVLYVRVVFTLAENFLDLSGDLGCGKKENPDILSVNVTSYEPSNAAVPKNETTSMSLSTSFIDMLRPVCDQRHLTDLLKIVNTDVYSDVSIDQSNNMECMKSLKLLDISYFYMYMLRIFSLLNPVVGSLPILNMLSFTPGFLVDLWGVLESSLFPSDVDEPEDHFPGSSKILNKGKNEGSGKKQNQVSKDGSSRWVTVFNKFTSKSSPGSDHMDTIEVQSSSRQGDDDSCDLWDIKSLSCGPQGISKDLSCLLYLFSATYAHLLLVLDDIEFYEKQVPFRLEQQRKLASMLNTLVYNGLSHGTGQQNTSLMESAIRCLHLMYERDCRHQFCPPRLWLSPARTSRPPVAVAARTHEALSGNLGADDTSTVPSVGSIITTTPHVFPFEERVEMFREFVKMDKVSRKMAGEVGGPGSRSFEIVVRRSHVVEDGFRQLNSLGSKLKSAIHVSFVSECGLPEAGQDCGGLSKEFLTDIAKAAFSPEYGLFSQTSTPDRHLIPNAAARYLDNGIQMIEFLGRVVGKALYEGILLDYSFSHVFVHKLLGRYSFLDELSTLDPELYRNLMCVKSYEDDVKELSLDFTVTEESFGKRHVIELKHGGKDISVTNENKMQYVHAIADYKLNRQILPFSNAFYRGLTDLISPSWLKLFNASEFNQLLSGGNHDIDVNDLRNNTRYTGGYTEGSRTISIFWEVIKGFEPKDRCSLLKFVTSCSRAPLLGFKYLQPAFTIHKVSCDVPIWASIGGQDVERLPTASTCYNTLKLPTYKRSSTLRSKLLYAINSNSGFELS* 1170
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
3 30374999 30385236 - CsaV3_3G036630.1 Csa03g03357 524262
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa03g03357 1169 MobiDBLite consensus disorder prediction 589 611 - -
Csa03g03357 1169 Gene3D Hect, E3 ligase catalytic domain 1044 1168 - -
Csa03g03357 1169 MobiDBLite consensus disorder prediction 557 576 - -
Csa03g03357 1169 SUPERFAMILY Hect, E3 ligase catalytic domain 800 1162 IPR035983 GO:0004842
Csa03g03357 1169 MobiDBLite consensus disorder prediction 589 610 - -
Csa03g03357 1169 CDD HECTc 801 1167 IPR000569 GO:0004842
Csa03g03357 1169 PANTHER UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE E3C 3 1169 IPR044611 GO:0000209|GO:0061630
Csa03g03357 1169 SMART hect_3 819 1169 IPR000569 GO:0004842
Csa03g03357 1169 MobiDBLite consensus disorder prediction 543 576 - -
Csa03g03357 1169 Gene3D Hect, E3 ligase catalytic domain 927 1006 - -
Csa03g03357 1169 PANTHER UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE E3C 3 1169 - -
Csa03g03357 1169 Pfam HECT-domain (ubiquitin-transferase) 856 1169 IPR000569 GO:0004842
Csa03g03357 1169 Gene3D Hect, E3 ligase catalytic domains 803 1041 - -
Csa03g03357 1169 ProSiteProfiles HECT domain profile. 825 1169 IPR000569 GO:0004842
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa03g00420 Csa-Chr3:3559773 Csa03g03357 Csa-Chr3:30374999 1.14E-56 dispersed
Csa03g03245 Csa-Chr3:29760254 Csa03g03357 Csa-Chr3:30374999 6.17E-25 dispersed
Csa03g03357 Csa-Chr3:30374999 Csa06g03461 Csa-Chr6:28422957 6.03E-28 dispersed
Csa06g01845 Csa-Chr6:16359762 Csa03g03357 Csa-Chr3:30374999 2.23E-15 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa03g03357 K10588 - csv:101205886 2313.88