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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa04g00214 ATGATCCCGCCGGAGCTTCAATCCCGCTCATTTCGCCCTTACATCTCCGCCTCTACCAGCGCCCCTTCCTTCTCCTCCATCACCAATGGCACCACCTCCTACGACCAAAACCCTAGTCCCTTTCTCGATCGTCGTGCTTCTTCTTCTTCTTCACCTTCTTCTTCTTCCTCCAGATCCTTCAACAATTCCCGTTTCTCCCCTTCTTCCTTCATCTACAATTCTCGTATTGCCATTGCTCTTGTCCCTTCTGCTGCCTTCCTTCTCGACCTCGGCGGTACTCCCGTTATTGCTACTTTGACTCTTGGCCTTATGATTTCCTACATCCTTGATTCTCTCAATTTCAAGCCTGGTGCCTTTTTTGGTGTTTGGTTCTCTCTTCTTTTTTCTCAGATTGCTTTCTTCTTCAGTTCTTCTCTTAATCTCACTTTTAATTCCATTCCTTTGACTATCCTTGCTGCTTTCCTTTGCGCCGAGACTAATTTCTTGATTGGTGCATGGGCTTCGCTTCAGTTTAAGTGGATTCAGATCGAAAATCCTTCTATTGTTCTTGCTCTTGAGCGTCTTTTGTTTGCTTCTGTTCCGTTTGCTGCTTCGGCTATGTTTACTTGGGCCACTATTTCTGCTGTTGGTATGGTTAATGCTTCTTATTATCTTATGGTATTCAATTGTGTCTTCTACTGGTTGTATTCTATTCCTCGTCTCTCGTCGTTCAAGAATAAGCAAGAAGCGAAGTTTCATGGTGGAGAGATTCCTGATGATAATTTGATACTTGGTCCTTTGGAGAGCTGTATTCATACCTTGAATCTTTTGTTTTTTCCTCTGGTTTTTCACATTGCATCTCATCACTCGGTGGTGTTTTCTTCTGCTGCTTCCGTTTGTGATTTGCTGCTTCTCTTTTTCATTCCGTTTGTCTTTCAACTGTATGCGTCGACGAGAGGTGCACTTTGGTGGGTCTCTAAAAATGCCAATCAAGTACACAGTATTCGGGTCGTCAATGGGGCTGTTGCTTTAGTTGTAGTAGTTGTCTGTTTGGAAATTAGAGTTGTTTTCCACTCCTTTGGGCGATATATTCAGGTGCCACCGCCTTTTAATTACCTACTTGTTACTATAACGATGCTCGGAGGGGCAGCTGGAGCTGGTGCTTATGTTATGGGTATGATCTCGGATGCTTTTAGTACGGTTGTGTTCACTACTTTGGCTGTGATCGTTAGTGCTGCCGGAGCAATTGTTGTAGGATTTCCAGTAATGTTCCTTCCACTACCATCTGTGGCTGGTTTTTATCTGGCTCGGTTCTTTACAAAGAAGAGCTTGCCATCTTACTTTGCTTTTGTTGTGCTTGGGAGCTTGATGACTATGTGGTTTGTGATGCATAATTACTGGGATCTAAATATTTGGCTGGCTGGCATGTCCCTCAAGTCTTTCTGCAAACTCATTGTGGCTGATGTGGTTCTTGCCTTGGCTGTTCCTGGTCTAGCTATATTACCGTCAAAAGTTCAGTTTTTGACGGAAGCCTGTTTGATTGGCCATGCATTACTACTATGTCATATTGAGAACCGTTTTCTAAGTTACTCCAGCATATATTATTATGGTCTTGACGATGATGTGGTTTATCCAAGCTATATGGTTATTATGACTACATTCATTGGCTTGGTCCTGGTACGCAGATTATTTGTTGATAACAGAATTGGACCAAAGGCAGTCTGGGTTCTCACTTGTCTGTATGCTTCAAAGCTGGCTATGCTGTTTATTGCTTCCAAATCTGTTGTATGGGTGTCAGCTATTCTCTTACTGGCCGTTTCACCCCCATTGCTCCTTTACAAAGATAAATCAAGAACAGCCTCCAAAATGAAGGCATGGCAAGGTTATGCACATGCTGGAGTTGTTGCTTTAGCAGTGTGGATTTTCCGTGAAACAATATTTGAAGCCCTTCAATGGTTTAATGGGAGACCACCATCAGATGGTTTGCTTTTAGGGTGCTGTATTTTTATGGCAGGGTTGGCTTGCATACCATTAGTTGCTCTCCACTTTCCTCATGTCCTGTCAGCGAAGAGATGCTTAGTACTAGTTGTGGCAACTGGTTTGCTATTTATCTTGATGCAGCCACCAATTCCCTTGTCTTGGACGTACCGTTCTGATCTTATTAAAGCTGCCCGTCAGTCCTCTGATGATATTTCCATCTATGGTTTTGTTGCCTCAAAACCTACCTGGCCTTCTTGGCTGCTTATGTTAGCAATTCTGCTCACTCTTTCAGCTATCACATCCATAATACCCATTAAATATTTTGCTGAGTTGAGAGTATTGTACTCCATAGCTATGGGTATTGCACTTGGCATTTACATATCTGCTGAGTACTTTCTTCAGGCAGCTGTTCTGCATATCCTTATTGTTGTGACCATGGTTTGTGCTTCGGTGTTTGTGGTGTTCACTCATTTTCCATCTGCTTCAAGCACCAAGGTCTTACCTTGGGTGTTTGCGTTGCTTGTTGCACTATTCCCTGTGACATATCTTCTGGAAGGGCAAGTAAGGTTAAACAGCATTTTAGGAGACAGCGTTAGAAATATGGGAGAGGAAGAGCAGATGATCACAACACTATTAGCAGTTGAAGGAGCAAGGACATCGTTGCTTGGCCTTTATGCAGCAATCTTCGTGCTAATTGCATTAGAAATAAAGTTTGAACTTGCGTCTCTCGTGAGAGAGAAAACTTCTGAAAGGGGTGGAATGAGACACACAAAATCTGGTGAAAGTAGCATTGGTAGTCTTAACACAAGAACAAGATTTATGCAACAACGACGGGCTTCTTCCATGTCAACATTCACCATGAAGCGAATGACAGCTGAAGGAGCATGGATGCCAGCAGTTGGCAATGTTGCTACAGTGATGTGTTTCGCTATATGCTTAATTTTGAATGTCAATCTCACAGGTGGTTCAAACTATGCTATATTTTTTCTTGCTCCTATCCTTCTGCTCTTGAACCAGGACTCAGATTTTGTTGCTGGATTTGGAGATAAGCAAAGATATTTCCCTGTTACCATAGTAATATCAGCATACTTGATCCTCACTGCAATATACAACATAGGAGAAGATGTTTGGCATGGAAATGCTGGATGGGGTCTAGATATCGGTGGGCCAGATTGGATATTTGCTGTTAAAAACTTAGCTCTTCTCGTTCTTACATTCCCAAGTCAGATCCTTTTCAACAGATTTGTATGGAGCTTTACGAAGCATTCGGACTCAACACCACTGCTAACGGTGCCCCTTAATCTACCATCTGCCATCATGACAGATGTGCTTAAGGTTAGAATATTGGGGATTTTAGGAATTATTTATTCCTTCGCCCAATATATAATCTCCAGACAACAGTATATGTCGGGATTAAAGTATATTTAG 3387 42.49 MIPPELQSRSFRPYISASTSAPSFSSITNGTTSYDQNPSPFLDRRASSSSSPSSSSSRSFNNSRFSPSSFIYNSRIAIALVPSAAFLLDLGGTPVIATLTLGLMISYILDSLNFKPGAFFGVWFSLLFSQIAFFFSSSLNLTFNSIPLTILAAFLCAETNFLIGAWASLQFKWIQIENPSIVLALERLLFASVPFAASAMFTWATISAVGMVNASYYLMVFNCVFYWLYSIPRLSSFKNKQEAKFHGGEIPDDNLILGPLESCIHTLNLLFFPLVFHIASHHSVVFSSAASVCDLLLLFFIPFVFQLYASTRGALWWVSKNANQVHSIRVVNGAVALVVVVVCLEIRVVFHSFGRYIQVPPPFNYLLVTITMLGGAAGAGAYVMGMISDAFSTVVFTTLAVIVSAAGAIVVGFPVMFLPLPSVAGFYLARFFTKKSLPSYFAFVVLGSLMTMWFVMHNYWDLNIWLAGMSLKSFCKLIVADVVLALAVPGLAILPSKVQFLTEACLIGHALLLCHIENRFLSYSSIYYYGLDDDVVYPSYMVIMTTFIGLVLVRRLFVDNRIGPKAVWVLTCLYASKLAMLFIASKSVVWVSAILLLAVSPPLLLYKDKSRTASKMKAWQGYAHAGVVALAVWIFRETIFEALQWFNGRPPSDGLLLGCCIFMAGLACIPLVALHFPHVLSAKRCLVLVVATGLLFILMQPPIPLSWTYRSDLIKAARQSSDDISIYGFVASKPTWPSWLLMLAILLTLSAITSIIPIKYFAELRVLYSIAMGIALGIYISAEYFLQAAVLHILIVVTMVCASVFVVFTHFPSASSTKVLPWVFALLVALFPVTYLLEGQVRLNSILGDSVRNMGEEEQMITTLLAVEGARTSLLGLYAAIFVLIALEIKFELASLVREKTSERGGMRHTKSGESSIGSLNTRTRFMQQRRASSMSTFTMKRMTAEGAWMPAVGNVATVMCFAICLILNVNLTGGSNYAIFFLAPILLLLNQDSDFVAGFGDKQRYFPVTIVISAYLILTAIYNIGEDVWHGNAGWGLDIGGPDWIFAVKNLALLVLTFPSQILFNRFVWSFTKHSDSTPLLTVPLNLPSAIMTDVLKVRILGILGIIYSFAQYIISRQQYMSGLKYI* 1129
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
4 1266108 1275433 + CsaV3_4G002140.1 Csa04g00214 525824

Annotation

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa04g00214 1128 MobiDBLite consensus disorder prediction 11 62 - -
Csa04g00214 1128 PANTHER NO EXINE FORMATION 1 1 1128 - -
Csa04g00214 1128 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 62 - -
       

Pathway

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa04g00214 - - - csv:101204901 2100.48
       

Deco-Alignment

Select Vvi1 Blo1 Blo2 Bda1 Bda2 Bpe1 Bpe2 Bma1 Bma2 Cmo1 Cmo2 Cma1 Cma2 Car1 Car2 Sed1 Cpe1 Cpe2 Bhi1 Tan1 Cmetu1 Lac1 Hepe1 Mch1 Lcy1 Cla1 Cam1 Cec1 Cco1 Clacu1 Cmu1 Cre1 Cone1 Cone2 Cone3 Cone4 Lsi1 Csa1 Chy1 Cme1 Blo3 Blo4 Bda3 Bda4 Bpe3 Bpe4 Bma3 Bma4 Sed2 Cmo3 Cmo4 Cma3 Cma4 Car3 Car4 Cpe3 Cpe4 Bhi2 Tan2 Cmetu2 Lac2 Hepe2 Mch2 Lcy2 Cla2 Cam2 Cec2 Cco2 Clacu2 Cmu2 Cre2 Lsi2 Csa2 Chy2 Cme2
Vvi1g1368 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Cone14ag0642 Cone15ag0652 . . . Csa04g00214 . . . . . . Bpe14g00826 . . . . . . . . . . . Cpe03g01171 . . . . . . . . . . . . . . . . Chy07g01555 Cme07g02002
       

Syn-Orthogroups

Select Orthogroup Bda Bhi Blo Bma Bpe Cam Car Cco Cec Chy Cla Clacu Cma Cme Cmetu Cmo Cmu Cone Cpe Cre Csa HCH Hepe Lac Lcy Lsi Mch Sed Tan Vvi Total
OG0008018 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 36
       

Transcriptome

Select Gene Chr Type da1 da2 da3 da4 da5 da6 da7 da8 da9 da10
Csa04g00214 Csa_Chr04 FPKM 67.560173 66.887817 49.398804 50.647728 44.729702 42.909168 47.049644 35.220291 33.783947 36.815613