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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa04g00347 ATGTCTTTCCTCTGTTTCTTCGCTCTTTCCCTTTTGGGATCCATCTCCACTCTTCTTCAAAATGCCATTGCCTTCAATGAACTTTATCCTCAACTCAACGACGATATCCTCGGCTTAATCGTTTTCAAATCCGACCTTCAAGACCCTTCTTCCGTTCTTTCCTCCTGGAGTGAAGACGATGACTCCCCTTGTTCTTGGAAGTTCATTAAATGCAACCCCATTAATGGCAGAGTTTCTGAGGTTTCCATTGATGGGTTGGGATTATCTGGGAGAATCGGAAGAGGGCTTGAGAAATTACAGCATCTCAAGGTATTGTCTCTCTCTGGGAATAATTTCACTGGGAATCTTAGTCCTCAGCTTGTTCTTCCTCCTAGTCTCGACAGAGTTAATTTCAGCGGCAATAGTTTATCTGGGCGGATTCCTGTTTCTCTTATCTCTATGTCTTCCATTAGATTTCTTGATTTTTCTGATAATCTCTTATCTGGGCCACTTCCTGATGAAATGTTTGTTAATTGTTCTTCTCTTCATTATCTTTCTCTTGCTTCTAATATGCTTCAAGGCCCTGTTCCCAACACATTGCCCACAAGGTGTTTATATTTAAACACTCTCAATCTTTCAACCAATCAATTCTCCGGTAGCTTAAATTTTGCTCCTGGGATTTGGTCTTTAGCAAGGCTGAGGACATTAGATCTCTCAAAAAATGATTTCTCTGGTGTTTTACCACAAGGGATTTCAGCTATTCATAATCTAAAAGAGCTCAAGTTGCAGAACAACCAATTCTCAGGGCCATTACCTTCAGACTTGGGATTATGCGTCCACTTAGCTACATTGGATGTCAGTGGAAACCGTCTCACCGGGCCGCTACCGAACTCAATGAGGCTCTTAACCTCCTTAACCTTCCTCAATATAGGATTCAACAGTTTTTCAGATGAGCTCCCACAGTGGATTGGAAACATGGGAAGGTTAGAATACATGGATTTCTCAAGCAATGGCTTCACTGGTAGTCTTCCCTTAACAATGGGGGGATTAAGATCGGTGAAATACATGAGTTTTTCAAACAATAAGCTGACTGGGAACATCCCAGAGACATTGATGGAATGTTCTGAGCTATCTGTGATCAAGCTTGAAGGAAACAGTTTGAATGGAAGGGTGCCAGAAGGGTTGTTTGAACTGGGGTTAGAGGAGATGGATTTGTCTAAGAATGAGCTGATTGGTTCAATTCCAGTGGGATCAAGTAGGCTATATGAGAAGCTGACAAGAATGGACTTGTCAAGTAACAGATTAGAAGGGAACTTTCCAGCAGAAATGGGGTTGTATAGAAATTTGAGGTACTTGAATCTGTCATGGAATGAGTTTAAGGCAAAGATTCCACCAGAAATGGGGTTGTTTGAGAATCTGAATGTGTTAGATATTAGAAGCAGTGATTTGTATGGTTCAATTCCTGGAGAATTGTGTGATTCTGGGAGTTTGAAGATTCTTCAACTTGATGGAAACTCTCTGGTTGGTCCAATTCCTGATGAGATTGGGAATTGTCTCTCACTTTACTTGCTGAGTTTATCCCACAACAATCTAAGTGGAGAAATTCCCAAGTCAATCTCCAAACTAAGCAAGTTAGAGATTCTAAGACTTGAATCAAATGAACTAAGTGGAGAAATACCTCAAGAGCTTGGAATTCTTCAAAACCTACTAGCTGTTAATATTTCATACAATATGTTAACAGGCAGACTTCCTGTTGGTGGCATTTTTCCAAGCTTAGATCAAAGTGCTTTGCAAGGAAACCTAGGCCTTTGCTCCCCTTTACTTAAAGGACCTTGCAAAATGAATGTCCCTAAGCCCCTTGTTCTTGATCCCAATGCCTATCCCAATCAAATGGGTGGCCAAAGCAGCAGAAACAGACCTTCACAATTATCTAATCATTCCTCACATCATGTTTTCTTCAGTGTCTCTGCCATTGTTGCCATCTCTGCTGCCACTTTGATTGCCCTTGGGGTGCTTGTAATCACCTTGCTCAATGTCTCTGCTCGGAGGAGATCGCTTGCGTTTGTCGACAATGCGTTGGAAAGCTGTTCGAGCTCTTCGAAATCAGGGACAGTCACTGCTGGTAAGCTTATTTTGTTTGATTCAAACTCAAAGGCATCGTTGAATTGGGTTAGTAACCATGAAGCCTTGCTGAATAAGGCCTCTGAGATTGGTGGTGGAGTTTTCGGAACGGTTTATAAGGTTTCATTGGGAGATGGAGGAGATGTAGCTATGAAGAAGCTTGTGAAATCAGACATTATTCAAAATCCGGAAGATTTTGACCGGGAAATCCGAGTTTTGGGGAAGGTTAAACACCCTAATTTGATCAGCTTAAAGGGTTATTATTGGACTGTTCAAACTCAGCTATTGGTAATGGAGTATGCTAACAATGGAAGTCTTCAAACTCAACTCCATGGAAGACTTCCTTCAGCTCCACCATTGTCTTGGGATAACAGGTTCAAGATTGTGCTTGGGACAGCCAAAGGACTAGCACATTTACACCACTCATTCCGCCCGCCAATCGTTCACTACAATCTAAAGCCAACCAACATCCTCCTCGATGAAAACTTCAACCCAAAGATCTCTGATTACGGGCTCGCAAGACTCCTAACAAAGCTTGACAAGCACGTCATGAACAACAGATTCCAAAGTGCATTGGGATACGTCGCACCGGAACTAGCATGCCAGAGCATAAGGGTGAATGAGAAATGCGACGTACACGGTTTTGGGGTGATGATTCTAGAGATCGTGACGGGACGAAGGCCGGTGGAGTATGGAGAAGACAATGTGGTTATATTGACAGACCATGTGAGGTATTTGCTTGAGAGAGGTAATGTGTTGGATTGTGTTGATCCAAGTATGACTCAATATTCAGAAGATGAAGTTGTGCCTATCCTCAAATTGGCTTTGGTATGCACTTCTCAAATTCCTTCAAGTAGGCCTTCCATGGCTGAAGTTGTGCAGATTCTTCAAGTTATCAAGGCTCCACTTCCTCAAAGAATATAA 3024 42.16 MSFLCFFALSLLGSISTLLQNAIAFNELYPQLNDDILGLIVFKSDLQDPSSVLSSWSEDDDSPCSWKFIKCNPINGRVSEVSIDGLGLSGRIGRGLEKLQHLKVLSLSGNNFTGNLSPQLVLPPSLDRVNFSGNSLSGRIPVSLISMSSIRFLDFSDNLLSGPLPDEMFVNCSSLHYLSLASNMLQGPVPNTLPTRCLYLNTLNLSTNQFSGSLNFAPGIWSLARLRTLDLSKNDFSGVLPQGISAIHNLKELKLQNNQFSGPLPSDLGLCVHLATLDVSGNRLTGPLPNSMRLLTSLTFLNIGFNSFSDELPQWIGNMGRLEYMDFSSNGFTGSLPLTMGGLRSVKYMSFSNNKLTGNIPETLMECSELSVIKLEGNSLNGRVPEGLFELGLEEMDLSKNELIGSIPVGSSRLYEKLTRMDLSSNRLEGNFPAEMGLYRNLRYLNLSWNEFKAKIPPEMGLFENLNVLDIRSSDLYGSIPGELCDSGSLKILQLDGNSLVGPIPDEIGNCLSLYLLSLSHNNLSGEIPKSISKLSKLEILRLESNELSGEIPQELGILQNLLAVNISYNMLTGRLPVGGIFPSLDQSALQGNLGLCSPLLKGPCKMNVPKPLVLDPNAYPNQMGGQSSRNRPSQLSNHSSHHVFFSVSAIVAISAATLIALGVLVITLLNVSARRRSLAFVDNALESCSSSSKSGTVTAGKLILFDSNSKASLNWVSNHEALLNKASEIGGGVFGTVYKVSLGDGGDVAMKKLVKSDIIQNPEDFDREIRVLGKVKHPNLISLKGYYWTVQTQLLVMEYANNGSLQTQLHGRLPSAPPLSWDNRFKIVLGTAKGLAHLHHSFRPPIVHYNLKPTNILLDENFNPKISDYGLARLLTKLDKHVMNNRFQSALGYVAPELACQSIRVNEKCDVHGFGVMILEIVTGRRPVEYGEDNVVILTDHVRYLLERGNVLDCVDPSMTQYSEDEVVPILKLALVCTSQIPSSRPSMAEVVQILQVIKAPLPQRI* 1008
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
4 2104623 2109263 - CsaV3_4G003470.1 Csa04g00347 525957
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa04g00347 1007 PANTHER LRR RECEPTOR-LIKE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE-RELATED 14 1006 - -
Csa04g00347 1007 SUPERFAMILY Protein kinase-like (PK-like) 727 1000 IPR011009 -
Csa04g00347 1007 Gene3D Phosphorylase Kinase; domain 1 730 801 - -
Csa04g00347 1007 Pfam Protein kinase domain 726 994 IPR000719 GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
Csa04g00347 1007 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 367 611 IPR032675 -
Csa04g00347 1007 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 31 90 IPR032675 -
Csa04g00347 1007 SUPERFAMILY L domain-like 48 385 - -
Csa04g00347 1007 Gene3D Transferase(Phosphotransferase) domain 1 802 1004 - -
Csa04g00347 1007 Pfam Leucine Rich repeat 99 114 IPR001611 GO:0005515
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 247 271 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 223 246 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 439 463 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 295 319 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 99 123 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 147 171 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 SMART LRR_typ_2 535 559 IPR003591 -
Csa04g00347 1007 ProSitePatterns Protein kinases ATP-binding region signature. 730 752 IPR017441 GO:0005524
Csa04g00347 1007 PANTHER BNAA09G02190D PROTEIN 14 1006 - -
Csa04g00347 1007 ProSiteProfiles Protein kinase domain profile. 724 999 IPR000719 GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468
Csa04g00347 1007 SUPERFAMILY L domain-like 312 587 - -
Csa04g00347 1007 Pfam Leucine rich repeat N-terminal domain 33 72 IPR013210 -
Csa04g00347 1007 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 91 366 IPR032675 -
Csa04g00347 1007 CDD STKc_IRAK 730 997 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa03g00336 Csa-Chr3:2797580 Csa04g00347 Csa-Chr4:2104623 5.48E-166 dispersed
Csa04g00347 Csa-Chr4:2104623 Csa05g00901 Csa-Chr5:6985023 0 dispersed
Csa04g00347 Csa-Chr4:2104623 Csa06g00234 Csa-Chr6:1602954 0 transposed
       

Transcription factors information

Select Gene Hmm_acc Hmm_name Score E-value Regulatory Factors Family
78111 PF00069 Pkinase 3.50E-42 CL0016 Csa PK
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa04g00347 - - csv:101217545 1939.85