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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa04g01416 ATGGCGTCTCTGGCGCTTACTTCCTTGTATCTTCCTTCTCTTCGGTCGCGTCTTCCGAACTCTGAATCTAATGCTCGAATTCGTTGCTCATCTCTTCGTTCCAGTATTCCCAAATCTGCCATTTTCGGTAGTGGCGTTAGAACTAGCTTTCACATTCCGTCTTCTCTATCTAATGAAGCTAAATTCGTTAAACCAGGTCTAAATTTCGGAAGTTCTGGTCGGAATCTTGGTGGTTTTACTGTCCGGGCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTGCTGCTGCTGTTCCGGCTCCAGCTCCTCAGCCATGGCAAGGTGCGGCGATTAAGCCATTGATTGCATCGATTGCTACGGGTATCATTCTATGGTTTGTTCCGGTGCCGTCTGGTGTTTCTCGAAACGCGTGGCAATTGCTTGCGATTTTCCTTGCTACTATCGTTGGGATTATTACTCAGCCCTTGCCTCTTGGTGCTGTTGCTTTGCTGGGACTTGGCGCCTCTGTTCTGACTAAAACCCTAACTTTCTCTGCTGCATTCTCTGCGTTTGGTGATCCCATTCCATGGCTCATAGCTCTTGCCTTCTTCTTTGCTCGAGGGTTCATTAAGACCGGACTTGGTAATCGAATTGCTTATCAATTTGTTTCTCTATTCGGTAGTTCGTCGTTAGGTTTAGGGTATAGTTTAGTATTTAGTGAGGCCTTGTTGGCGCCAGCAATTCCTTCGGTATCGGCCAGAGCAGGAGGGATATTCCTTCCACTGGTAAAATCCCTCTGTGTTGCTTGTGGTAGCAATGTTGGTGATGGGACGGAGAATAGGTTGGGAGCTTGGTTGATGCTCACTTGCTTTCAAACTTCGGTGATTTCATCATCTATGTTTTTGACAGCCATGGCTGCTAATCCCCTGAGTGCAACTCTAACGTATAACACAATTAAGCAGACGATTGGATGGACTGACTGGGCTAAAGCAGCCATTGTTCCAGGATTGATCTCCTTGATTGTGGTGCCATTGCTTTTGTATGTCGTTTATCCGCCCACAGTGAAGAGCAGCCCAGATGCACCGAAGCTTGCAAGAGAGAAATTGGAAAAGATGGGGCCAATGACCAAGAATGAGATTATAATGGCTGGAACTCTGCTTCTCACGGTGGGTCTTTGGGTTTTTGGAGGGGTTCTTAATGTGGATGCTGTTACTGCTGCTATTTTGGGATTGTCTGTTCTTCTTGTGACTGGGGTTGTGACATGGAAAGAGTGCTTGGGAGAAGCTGTTGCCTGGGACACTCTAACATGGTTTGCTGCACTCATTGCAATGGCAGGGTATCTCAACAAATATGGTCTCATCTCCTGGTTCAGCCAAACTGTAGTGAAGTTTGTTGGCGGCCTAGGTCTTTCATGGCAGCTCTCATTCGGCATTTTAGTTCTTCTCTATTTCTACTCTCATTACTTCTTTGCGAGTGGAGCTGCTCATATAGGCGCGATGTTTACAGCCTTCTTATCTGTTGCTAGTGCTTTGGGGACTCCCCCCTACTTTGGAGCAATTGTGCTTTCCTTCTTATCTAATCTGATGGGTGGCCTAACTCACTACGGCATCGGCTCAGCACCTGTTTTCTATGGTGCCAACTATGTTCCTCTCGCTCAATGGTGGGGCTACGGATTCCTCGTATCTGTCGTCAACATCATTATCTGGCTCGGCATTGGAGGAATTTGGTGGAAGGCCATTGGTTTGTGGTGA 1719 47.12 MASLALTSLYLPSLRSRLPNSESNARIRCSSLRSSIPKSAIFGSGVRTSFHIPSSLSNEAKFVKPGLNFGSSGRNLGGFTVRASSSSSSAAAAVPAPAPQPWQGAAIKPLIASIATGIILWFVPVPSGVSRNAWQLLAIFLATIVGIITQPLPLGAVALLGLGASVLTKTLTFSAAFSAFGDPIPWLIALAFFFARGFIKTGLGNRIAYQFVSLFGSSSLGLGYSLVFSEALLAPAIPSVSARAGGIFLPLVKSLCVACGSNVGDGTENRLGAWLMLTCFQTSVISSSMFLTAMAANPLSATLTYNTIKQTIGWTDWAKAAIVPGLISLIVVPLLLYVVYPPTVKSSPDAPKLAREKLEKMGPMTKNEIIMAGTLLLTVGLWVFGGVLNVDAVTAAILGLSVLLVTGVVTWKECLGEAVAWDTLTWFAALIAMAGYLNKYGLISWFSQTVVKFVGGLGLSWQLSFGILVLLYFYSHYFFASGAAHIGAMFTAFLSVASALGTPPYFGAIVLSFLSNLMGGLTHYGIGSAPVFYGANYVPLAQWWGYGFLVSVVNIIIWLGIGGIWWKAIGLW* 573
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
4 14178993 14183150 + CsaV3_4G024240.1 Csa04g01416 527026
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa04g01416 572 PANTHER DICARBOXYLATE TRANSPORTER 1, CHLOROPLASTIC 81 572 - -
Csa04g01416 572 PANTHER DICARBOXYLATE TRANSPORTER 2.1, CHLOROPLASTIC 81 572 IPR030676 -
Csa04g01416 572 TIGRFAM dass: transporter, divalent anion:Na+ symporter (DASS) family 124 566 IPR001898 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
Csa04g01416 572 Pfam Sodium:sulfate symporter transmembrane region 109 572 IPR001898 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
Csa04g01416 572 CDD ArsB_NhaD_permease 144 554 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa04g00955 Csa-Chr4:7249812 Csa04g01416 Csa-Chr4:14178993 7.17E-146 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa04g01416 - - csv:101204366 989.564