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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa05g02350 ATGGTTATGGATCTGGAAAGTGGAGTTGTTAATGAAAAGAACGCGAAGAAAGATTCATGGAAGACGATTTTGATGATGGCTTATCAGAGTCTTGGGGTTGTTTATGGAGAGTTGGGAACTTCGCCTTTATATGTGTATAGGAACACTTTTGCAGAAGAAGATATCAATCATACCAAGAGCAACGATGAGATTTATGGGGTTTTGTCCTTTGTTTTCTGGACTCTCACCATTGTTCCTTTGCTCAAGTACATATTTATCGTTCTTAAAGCTGATGATAATGGGGAGGGTGGGACATTTGCTCTGTATTCGTTACTGTGTCGACATGCTCGAGTTAGCTCATTGCCTAATACCCAGTTGGCTGATTCTGAACTTACTGAGTATAAGATGAATGTCCTTGGTCCACCATCTCAACAAAGTTTTGGATTTAAACTCAAATCAGCATTAGAAAAGCGTCGGGTTCTGCAGAAATTCTTGCTTGTTCTTGCTTTAATTGGGACTTGCATGGTGATAGGGGATGGCATCTTAACTCCAGCTATTTCTGTTCTTTCGGCGGTTTCTGGTCTTGAGCATACCATGGCAAAAGAACATCACCAATATATAGTGATCCCAATTGCATGCATCGTACTGATATGCCTGTTTGCTCTTCAGCACTATGGCACGCACAGGATTGGCTTCTTGTTTGCTCCCATAGTGATAGTTTGGCTATTGTGTATTAGTGTTATTGGCCTTTACAATATTATCCATTGGAATCCCCGTGTTTATAGAGCAATTTCTCCTCGTTACATGTTCCAATTTCTTAAGAAAACCCAAAAAGGAGGCTGGATGTCACTTGGTGGAATAATGTTGTGCATTACTGGTTCGGAAGCGATGTTTGCTGACCTTGGTCATTTTTCTCAGTTGTCAATTAAGATTGCTTTCACTTTTATGGTTTATCCATCTCTTCTCCTAGCATACATGGGGCAAGCTGCTTATCTGTCTCAACATCATCCCTCTTCAAATGAACATCCAATTGGATTTTATGTATCTGTTCCTGATAAATTGAAGTGGCCTGTCCTTATAATTGCCGTGCTTGCAGCAGTAGTCGGAAGTCAGGCTATAATCACCGGAACTTTCTCGATTATAAAGCAGTGCTCTGCTTTGGGTTGCTTTCCTCGGGTCAAAATTATTCATACGTCTTCGAAAGTTCACGGTCAGATCTATATCCCAGAGGTCAATTGGATTTTGATGCTGTTATGCTTGGCAGTTACCTTAGGTTTCAGAGACACTAAGCGCTTGGGCCATGCCTCAGGTTTGGCAGTGATAACTGTGATGCTTGTTACTACATGCTTGATGTCGCTCGTTATTGTCCTGTGCTGGCACCGAAGTGTATTTCTTGCAATAGGCTTCATCTTCTTCTTTGGCACCATTGAATCTCTCTACTTCTCAGCTTCTCTCATAAAGTTTCTTGAAGGAGCTTGGGTTCCTATTGCGATTTCTTTTGTATTCCTGATCGTTATGTATGTCTGGCACTACGGAACTCTTAAGAAGTTTGAATTTGACATCCAAAACAAGGTTTCTATTAACTGGCTACTTAGTTTGGGTCGCAGCTTAGGCATTGTAAGAGTCCGTGGGATTGGTGTTGTACAGACAGAGCTTGTTTCGGGTATCCCTGGTATCTTCACCCACTTTGTCACTAATATCCCTGCCTTCCATCAAGTTCTTGTTTTCCTTTGCATCAAACATGTCCCAGTGCCACACGTTAGACCAGAAGAACGGTTTCTAATTGGTCGTATTGATACGAGTGAATACAGACTCTATCGGTGCATTGCACGATATGGGTATCGAGATGTTCACAAAGACGACGTAGAGTTTGAGAATGATCTTATATGCAGCATAGCAGAGTTTATAAGATCAGGGACTCCACAGTCCAGTGATTGTAAACTGGACTTTGATAAAGACGGTGAAAAGATGTCAGTCGTTGGGACATCTTCTAACCATGAAGATAGGATTCAGATGGCCGAGACAGATAACGAGGAAGACTCTGAAGAACTGTACCAAGCTTCAGATACAAGAGAAATAAGGTCACCAACTCCAGTCCAATTGAGAAAAAGAGTACGCTTCATCTTACCCGAGAGCCCGAAAATCAACACTGATGCAATGGAAGAATTACAGGAGCTAAGGGAAGCAAGAGAAGGAGGAGTAGCTTACATATTAGGACGATCACACATGAAAGCAAAACAAGGATCGAGCATGCTGAAAAGAGTGTCGATTGACTTCATTTACGAGTTCTTGAGAAAAAACAGCAGAGAAGCTGACTTCCCAGTAGGTTTATCACATTCATCATCAACACTTGAGGTGGGTATGATGTATCTTGTTTAA 2358 41.6 MVMDLESGVVNEKNAKKDSWKTILMMAYQSLGVVYGELGTSPLYVYRNTFAEEDINHTKSNDEIYGVLSFVFWTLTIVPLLKYIFIVLKADDNGEGGTFALYSLLCRHARVSSLPNTQLADSELTEYKMNVLGPPSQQSFGFKLKSALEKRRVLQKFLLVLALIGTCMVIGDGILTPAISVLSAVSGLEHTMAKEHHQYIVIPIACIVLICLFALQHYGTHRIGFLFAPIVIVWLLCISVIGLYNIIHWNPRVYRAISPRYMFQFLKKTQKGGWMSLGGIMLCITGSEAMFADLGHFSQLSIKIAFTFMVYPSLLLAYMGQAAYLSQHHPSSNEHPIGFYVSVPDKLKWPVLIIAVLAAVVGSQAIITGTFSIIKQCSALGCFPRVKIIHTSSKVHGQIYIPEVNWILMLLCLAVTLGFRDTKRLGHASGLAVITVMLVTTCLMSLVIVLCWHRSVFLAIGFIFFFGTIESLYFSASLIKFLEGAWVPIAISFVFLIVMYVWHYGTLKKFEFDIQNKVSINWLLSLGRSLGIVRVRGIGVVQTELVSGIPGIFTHFVTNIPAFHQVLVFLCIKHVPVPHVRPEERFLIGRIDTSEYRLYRCIARYGYRDVHKDDVEFENDLICSIAEFIRSGTPQSSDCKLDFDKDGEKMSVVGTSSNHEDRIQMAETDNEEDSEELYQASDTREIRSPTPVQLRKRVRFILPESPKINTDAMEELQELREAREGGVAYILGRSHMKAKQGSSMLKRVSIDFIYEFLRKNSREADFPVGLSHSSSTLEVGMMYLV* 786
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 25816821 25822718 + CsaV3_5G031690.1 Csa05g02350 530737
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa05g02350 785 PANTHER OSMOTIC STRESS POTASSIUM TRANSPORTER 3 784 IPR003855 GO:0015079|GO:0016020|GO:0071805
Csa05g02350 785 Pfam K+ potassium transporter 28 609 IPR003855 GO:0015079|GO:0016020|GO:0071805
Csa05g02350 785 PANTHER POTASSIUM TRANSPORTER 6 3 784 - -
Csa05g02350 785 TIGRFAM kup: potassium uptake protein 26 783 IPR003855 GO:0015079|GO:0016020|GO:0071805
       

Event-related genes

Select Gene_1 Gene_2 Event_name
Csa03g03914 Csa05g02350 CCT
Csa03g03914 Csa05g02350 ECH
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa05g02350 Csa-Chr5:25816821 Csa05g02908 Csa-Chr5:29584874 0 dispersed
Csa03g03914 Csa-Chr3:34316948 Csa05g02350 Csa-Chr5:25816821 0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa05g02350 K03549 - csv:101212925 1541.94