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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa05g02513 ATGTGGAAGAGAGTTCTATGTTTAATTCCTCACAGGTCGTTTTCCTCTGTACCAGAAAACCCCCCATCTCTCTACTCCTTCCTCCAACCCTCCCTTTTTGCCCGAAAGAGAACTCCATTTTCTCCTTCTCAAGACTCCACCGACCTCCGTCAGGATCCAACTCCTCAAAATTTAACTCCAGACGGTGTTGCCGTTGTAGAAACTGCCCTCCACAAGTCCCTCCTCACTAGCGACACTGATGAGGCATGGAAATCCTTCAAATTGCTCACGAGAAGCTCTGCTTTCCCATCTAAGTCTCTTACCAATTCACTTATTGCTCACTTGTCCTCAATTGGGGACGTTCATAATCTGAAAAGGGCCTTTGCTTCTGTGGTGTTTGTTATTGAGAAGAAACCTGAACTGTTGGATTTTGGGTCTGTTAAAGCTTTACTGGCTTCTATGAAATGTGCCAACACTGCTGCCCCTGCTCTTTCTTTGATTAAATGCATGTTTAAGAATCGATGCTTCGTACCTTTTAGTGTCTGGGGCAAAGAACTTGTTGATATTTGCAGACAGAGTGGGAGTTTGATTCCATTTTTAAGAGTTTTTGAAGAGAACTGTAGGATTGCTTTAGATGAGAGGTTGGATTTTTTGAAACCAGACCTTATTGCTTGTAATGCAGCACTTGAGGGGTGTTGCCATGAGCTTGAATCTGTGACAGATGCCGAGAAAGTTATTGAAACAATGTCACTTTTGTATCTTCGGCCTGATGAGGTAAGTTTTGGTGCTCTTGCTTATTTGTATGCACTGAAGGGTCTTGACCAGAAAATAATCGAGTTAGAGGTCTTGATGGGAAGTTTCGGTTTTACTTGTAAAGATCTCTTTTTTAGTAATTTGGTCAGTGGATACGTTAATGCGAGCAACTTTGCTGCTGTTTCGAAGACTATGCTGCGTAGTTTAAAGGATGAATGTGGTTCACATGTGCATTTTGGTGAGAAAACATATTTGGAAATGGTCAAGGGCTTTATTCAAAGTGGAAATCTGAAGGAATTATCTGCATTAATTATTGACGCTCAGAATTTAGAGTCTTCATCAGCTGTTGATGGATCTATTGGATTCGGTATCATTAATGCATGTGTTAATATTGGATGGTTAGATAAGGCACAATACATTCTGGACGAAATGAATTCCCAGGGAGTTTCTCTGGGCCTTGGAGTCTATTTGCCAATCTTGAAAGCTTACCGGAAGGAGCATCGAACAGCTGCAGCCACCCAATTAATTATGGATATTAGCAGTTCTGGGATTCAGTTGGATGCAGAGAATTACGATGCTCTAATAGAGGCATCAATGTCGAACCAAGATTTTCAGTCAGCTTTTACTTTGTTCAGGAGCATGAGAGAAACAAGAAAATCTGACACGAAAGCTAGTTATCTAACTATTATGACTGGCTTAATGGAGAACCATAGGCCTGAGTTGATGGCTGCCTTTTTAGATGAAATTGTCGAAGATCCTCTTGTTGAAGTTGGAACTCATGATTGGAACTCTATTATACATGCCTTTTGCAAAGCTGGAAGACTCGAGGATGCGAGGAGAACATACCGAAGAATGAAATTTCTGCAGTTTGAACCAAACGAGCAGACCTTCTTGTCCCTAATTAATGGCTATGTGTCTGCAGAGAGATATTTCTGTGTTCTAATGCTGTGGAACGAACTTAAGTGGAAGGTTACACCAAACGGGGAGAGCGGAATTAAACTTGACAACAACTTGGTTGATGCGTTTCTGTATGCTTTGGTCAAGGGAGGTTTCTTTGACGCCGTGATGCAAGTTGTTGAAAAAACTAAGGATACGAAGATCTTCATTGATAAGTGGAAATACAAGCAAGCATTCATGGAGACTCATAAGAAACTCAAAGTGGCAAAGTTGAGGAGGAGGAACTACAAGAAAATGGAATCGCTAATTGCTTTCAAGAACTGGGCTGGTCTGAATGCTTGA 1971 41.35 MWKRVLCLIPHRSFSSVPENPPSLYSFLQPSLFARKRTPFSPSQDSTDLRQDPTPQNLTPDGVAVVETALHKSLLTSDTDEAWKSFKLLTRSSAFPSKSLTNSLIAHLSSIGDVHNLKRAFASVVFVIEKKPELLDFGSVKALLASMKCANTAAPALSLIKCMFKNRCFVPFSVWGKELVDICRQSGSLIPFLRVFEENCRIALDERLDFLKPDLIACNAALEGCCHELESVTDAEKVIETMSLLYLRPDEVSFGALAYLYALKGLDQKIIELEVLMGSFGFTCKDLFFSNLVSGYVNASNFAAVSKTMLRSLKDECGSHVHFGEKTYLEMVKGFIQSGNLKELSALIIDAQNLESSSAVDGSIGFGIINACVNIGWLDKAQYILDEMNSQGVSLGLGVYLPILKAYRKEHRTAAATQLIMDISSSGIQLDAENYDALIEASMSNQDFQSAFTLFRSMRETRKSDTKASYLTIMTGLMENHRPELMAAFLDEIVEDPLVEVGTHDWNSIIHAFCKAGRLEDARRTYRRMKFLQFEPNEQTFLSLINGYVSAERYFCVLMLWNELKWKVTPNGESGIKLDNNLVDAFLYALVKGGFFDAVMQVVEKTKDTKIFIDKWKYKQAFMETHKKLKVAKLRRRNYKKMESLIAFKNWAGLNA* 657
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 26709198 26711168 + CsaV3_5G033320.1 Csa05g02513 530900
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa05g02513 656 Pfam PPR repeat 368 393 IPR002885 -
Csa05g02513 656 MobiDBLite consensus disorder prediction 39 58 - -
Csa05g02513 656 ProSiteProfiles Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. 502 536 IPR002885 -
Csa05g02513 656 PANTHER OS01G0788900 PROTEIN 1 656 - -
Csa05g02513 656 PANTHER BNAC05G43320D PROTEIN 1 656 - -
Csa05g02513 656 Pfam PPR repeat family 506 549 IPR002885 -
Csa05g02513 656 Pfam Pentatricopeptide repeat domain 419 470 IPR002885 -
Csa05g02513 656 Gene3D Tetratricopeptide repeat domain 62 363 IPR011990 GO:0005515
Csa05g02513 656 Gene3D Tetratricopeptide repeat domain 468 654 IPR011990 GO:0005515
Csa05g02513 656 TIGRFAM PPR: pentatricopeptide repeat domain 506 538 IPR002885 -
Csa05g02513 656 Gene3D Tetratricopeptide repeat domain 364 467 IPR011990 GO:0005515
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa05g02513 Csa-Chr5:26709198 Csa07g01686 Csa-Chr7:17333339 7.36E-67 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa05g02513 - - csv:101212045 1298.11