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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa05g02776 ATGGGGGTTAGCGAAGGAACATTGAGATGCTTCGACATAAAAAGCATAGTTGTCTACGTCATAACCGGACGGTGGTTCGTGGTGTTTGCTTCACTCCTAATCATGGCGGTGTTTGGAACAACGTTCTTGTTTGGTTTGTATTCGAGCGACATTAAATCGGCTTTGGGTTACAACCAAACGACGTTGAATTTGTTGAGTTTTTTTAAGGATTTGGGTGCAAACGTTGGCATTTTATCTGGTCTTATTAACGAGTTTATGCCACCGTGGGTGGTTCTATTAATTGGTGCAGTTATGAACTTTTTTGGTTACTTTATGATTTGGCTCGGTGTTACTCGCCGAATCTCCACCCCAAAAGTTTGGCAAATGTGTTTCTATATTTGTATGGGAGGAAGTTCCCAATCCTTTGCTAATACCGGTTCTATGGTTACTTGTGTTAATAACTTTCCCGAAAGGCGTGGCGTTGTTCTCGGTCTTTTGAAGGGATACATCGGGCTAAGCGGCGCCATAATCACACAGCTCTTCCACGCATTCTACGGCGGCGACACTAAATCCCTCATTCTCTTCATCGGATGGCTTCCGGCTGCAATTTCCTTCGCATTCTTACGAACAGTTCGTATCATGAAAGTCATCCGACAGCCAAATGAGCTCAAAGTTTTCTATAATTTCCTCTACATTTCTCTTCTCCTCGCCGGATTCCTCATGCTAATGATCATTGTACAAAGCAAGACAGAGTTCACTCAAAACCAATATGGTGGCAGCGCGGCTGCCATAGTCGTTCTTCTCCTCCTACCACTCGCCGTTGTCACTATCGAAGAATGCAATCTCCAGAAACTTAAAACCAAATCTCCAAATTCTTCTGTTCAAATCATAACTGAGAAACTCCCAAAAACAGAGCATTCAAAACAAAAAGAACCATCGTGTTGGACAACAATTTTCAACCCACCACAACGAGGCGAGGATTTCACAATTCTCCAAGCTGTCTTCAGTGTCGACATGCTGATTTTATTCATATCTGTAATTTGTGGCGCTGGTGGAACGTTAACGGCGGTCGACAATTTGGGTCAAATCGGAATGTCTTTGGGATACCCAAAAAGAAGCATTAGCACATTTGTATCATTAGTCAGTATTTGGAATTACCTCGGTCGAGTTGTCTCTGGTTTCGTCTCTGAAATCGTTTTGATAAAATACAAATTCCCTCGTCCTTTAATGCTTTCTCTGAACCTTCTTTTATCCTGTGTCGGCTACTTGGTCATCGCATTTGACGTCCCAAATGGATTATATGTTGCTTCCATCGTAATCGGATTCTGTGTTGGAGCACAGTGGCCGTTGATTTACGCCATAATTTCAGAGATTTTTGGGTTGAAATATTACTCAACGCTTTACAATTTCGGGACGGTTGCGATGCCAATTGGACTTTATATTATGAATGTGAAAGTGGCTGGGAACTTCTACGACAGAGAAGCAGAGAAACAGCTAAAAGCAAAAGGGATTATACGAAAAGCAGGGGAAGACTTAAAGTGCTATGGAGGGGAATGCTTTAAGCTTTCGTTCATCGTAATCACTGCAGTTACTTTGATGGGTATGTTTATTTCATTGATTTTAGTGATTAGAACAAGAAGTTTTTACAAAAGTGATATTTATAAAAAGTTTAGAGATGAAGCCGAAACAGAGGTGGCCGGAAATGAGGCTGTGGCGACGGCGGGAGGAGCAGAAGAGAGAGAGAAAATTATAATGCAAAGAAGAAGTTGA 1749 41.91 MGVSEGTLRCFDIKSIVVYVITGRWFVVFASLLIMAVFGTTFLFGLYSSDIKSALGYNQTTLNLLSFFKDLGANVGILSGLINEFMPPWVVLLIGAVMNFFGYFMIWLGVTRRISTPKVWQMCFYICMGGSSQSFANTGSMVTCVNNFPERRGVVLGLLKGYIGLSGAIITQLFHAFYGGDTKSLILFIGWLPAAISFAFLRTVRIMKVIRQPNELKVFYNFLYISLLLAGFLMLMIIVQSKTEFTQNQYGGSAAAIVVLLLLPLAVVTIEECNLQKLKTKSPNSSVQIITEKLPKTEHSKQKEPSCWTTIFNPPQRGEDFTILQAVFSVDMLILFISVICGAGGTLTAVDNLGQIGMSLGYPKRSISTFVSLVSIWNYLGRVVSGFVSEIVLIKYKFPRPLMLSLNLLLSCVGYLVIAFDVPNGLYVASIVIGFCVGAQWPLIYAIISEIFGLKYYSTLYNFGTVAMPIGLYIMNVKVAGNFYDREAEKQLKAKGIIRKAGEDLKCYGGECFKLSFIVITAVTLMGMFISLILVIRTRSFYKSDIYKKFRDEAETEVAGNEAVATAGGAEEREKIIMQRRS* 583
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 28446206 28448277 - CsaV3_5G035950.1 Csa05g02776 531163
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa05g02776 582 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 24 540 IPR036259 -
Csa05g02776 582 Pfam Major Facilitator Superfamily 353 537 IPR011701 GO:0022857|GO:0055085
Csa05g02776 582 Pfam Nodulin-like 24 268 IPR010658 -
Csa05g02776 582 CDD MFS_Mch1p_like 23 528 - -
Csa05g02776 582 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 325 543 IPR036259 -
Csa05g02776 582 PANTHER UNCHARACTERIZED NODULIN-LIKE PROTEIN 10 568 - -
Csa05g02776 582 PANTHER MFS TRANSPORTER 10 568 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa05g02774 Csa-Chr5:28442948 Csa05g02776 Csa-Chr5:28446206 5.87E-88 dispersed
Csa05g02776 Csa-Chr5:28446206 Csa05g02780 Csa-Chr5:28460136 0 dispersed
Csa05g02775 Csa-Chr5:28443878 Csa05g02776 Csa-Chr5:28446206 1.64E-33 tandem
Csa05g02776 Csa-Chr5:28446206 Csa05g02777 Csa-Chr5:28449849 0 tandem
Csa03g03303 Csa-Chr3:30105502 Csa05g02776 Csa-Chr5:28446206 0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa05g02776 - - csv:101205265 1130.16