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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa05g02777 ATGGTAGTCAGCAAAGGATCATCGAGATGCTTTGACATAAAAAACATAGTCGTTCACGTCATCATCGGACGATGGTTCGTGGTGTTTGCTTCACTCCTAATCATGGCGGTGTCTGGATCAACGTTCATGTTTGGTTTGTATTCGGGCGACATTAAATCGGTTTTGGGATACAATCAAACGACGTTGAATTTGTTGAGTTTCTTTAAGGATTTAGGTGCAAATGTCGGCATTTTATCTGGTCTTATTAACGAGGTTACGCCACCATGGGTGATTCTATTAATTGGTGCCCTTATGAATTTTTTTGGTTACTTTATGATTTGGCTCAGTGTTACTCGTCGAATTTTCGCCCCAAAAGTTTGGCAAATGTGTCTCTATATTTGTATGGGAGGAAGTTCTCAGAACTTTGCTAATACAGGTGCTTTGGTTACTTGTGTTAATAACTTTCCCGAAAGACGTGGCATTGTTCTCGGTCTCTTGAAGGGATACGTCGGTCTAAGCGGCGCCATAATCACACAGCTCTTCCACGCATTCTACGGCGGCGACACTAAATCCTTCATTCTCCTCATCGGATGGCTTCCGGCTGCAATTTCCTTAGCATTCTTACGAACAGTTCGTATCATGAAAGTCATCCGACAGCCAAATGAGCTCAAAGTTTTCTACAATTTCCTCTACATTTCTCTTCTCCTCGCCGGATTCCTCATGCTAATGATCATTGTACAAAGCAAGACAGAGTTCACTCAAAACCAATATGGTGGCAGCGCGGCTGCCATAGTCGTTCTTCTCCTCCTACCACTCGCCGTCGTCACTACCGAAGAATACAATCTCTGGAAACTTAAAACCAAATCTCCAAATCCCTCTGTTCAAATCATAACAGAGCAACTCCCAAAAACAGAGCATCCAGAACAAAAAGAACCATCGTGTTGGACAACAATTTTCAACCCACCACAACGAGGCGAGGATTTCACAATTCTCCAAGCTGTCTTCAGTGTCGACATGCTGATTTTATTCCTATCTGTAATTTGTGGCACTGGTGGACAGTTAACGGCGATCGAAAATTTGGGTCAAATTGGAATGTCTTTGGGATACCCAAAGAAAAGCATTAGCACATTTGTATCATTAGTCAGTATTTGGAATTACCTCGGTCGAGTTGTCTCTGGTTTCGCCTCTGAAATCGTTTTGATAAAATACAAATTCCCTCGTCCTTTAATACTCTCTCTAACCCTTCTTTTATCCTGTATCGGCCACTTGATGATCGCATTCGACGTCCCAAATGGATTATATGTTGCTTCCATCGTAATCGGATTCTGTTTAGGAGCACAATGGCCGATGATTTACGCCATAATTTCAGAGATTTTTGGGTTGAAATATTACTCAACGCTTTACAATTTCGGGGCAGCTGCAATCCCAATTGGACTTTATATTATGAATGTGAAAGTGACTGGGAAGTTGTACGACAGAGAAGCAGAGAAACAGCTCAAAGCAAAAGGGATTATACGAAAAGCAGGGGAAGAATTAAAGTGCTTTGGAAGGGAATGCTTTAAGCTTTCGTTCATCATAATCACTGCAGTTACTTTGGTGGGTATGTTTATTTCATTGATTTTAGTGATTAGAACAAGGAGTTTCTACATAAGTGATATTTATAAAAAGTTTAGAGAGGAAGCCGAAAAAGAAGTGGCCGGAAATGAGGCTGTGGCGACGGCCGGAGCAGCGGAAGAGACAGAGAAAGTTATAATACAAAGAAGAAGTTGA 1749 41.62 MVVSKGSSRCFDIKNIVVHVIIGRWFVVFASLLIMAVSGSTFMFGLYSGDIKSVLGYNQTTLNLLSFFKDLGANVGILSGLINEVTPPWVILLIGALMNFFGYFMIWLSVTRRIFAPKVWQMCLYICMGGSSQNFANTGALVTCVNNFPERRGIVLGLLKGYVGLSGAIITQLFHAFYGGDTKSFILLIGWLPAAISLAFLRTVRIMKVIRQPNELKVFYNFLYISLLLAGFLMLMIIVQSKTEFTQNQYGGSAAAIVVLLLLPLAVVTTEEYNLWKLKTKSPNPSVQIITEQLPKTEHPEQKEPSCWTTIFNPPQRGEDFTILQAVFSVDMLILFLSVICGTGGQLTAIENLGQIGMSLGYPKKSISTFVSLVSIWNYLGRVVSGFASEIVLIKYKFPRPLILSLTLLLSCIGHLMIAFDVPNGLYVASIVIGFCLGAQWPMIYAIISEIFGLKYYSTLYNFGAAAIPIGLYIMNVKVTGKLYDREAEKQLKAKGIIRKAGEELKCFGRECFKLSFIIITAVTLVGMFISLILVIRTRSFYISDIYKKFREEAEKEVAGNEAVATAGAAEETEKVIIQRRS* 583
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 28449849 28451842 - CsaV3_5G035960.1 Csa05g02777 531164
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa05g02777 582 PANTHER UNCHARACTERIZED NODULIN-LIKE PROTEIN 10 572 - -
Csa05g02777 582 PANTHER MFS TRANSPORTER 10 572 - -
Csa05g02777 582 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 24 543 IPR036259 -
Csa05g02777 582 Pfam Nodulin-like 24 268 IPR010658 -
Csa05g02777 582 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 327 541 IPR036259 -
Csa05g02777 582 CDD MFS_Mch1p_like 23 528 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa05g02775 Csa-Chr5:28443878 Csa05g02777 Csa-Chr5:28449849 7.33E-35 dispersed
Csa05g02777 Csa-Chr5:28449849 Csa05g02780 Csa-Chr5:28460136 0 dispersed
Csa05g02776 Csa-Chr5:28446206 Csa05g02777 Csa-Chr5:28449849 0 tandem
Csa05g02777 Csa-Chr5:28449849 Csa05g02778 Csa-Chr5:28453067 0 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa05g02777 - - csv:101205029 1099.35