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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa07g00020 ATGGGCGATACCCGAGGTGGTTGCTGTCCATCCATGGATCTCTTCCGCTCCGAGCCTATGCAGCTCGTCCAGCTCATCATTCCCATCGAGTCTGCGCATCGCACCATCTCCTACCTCGGTGATCTCGGCCTTCTTCAGTTCAAAGATCTCAATGCGGATAAAAGCCCATTCCAGCGTACTTATGCTGCACAGATTAAAAGATGTGGAGAGATGGCACGCAAATTGAATTTTTTCAAGGAACAGATATTGAGGGCTGGATTATCAAGCAAAAGCTCTGTGTCACAAGTTGATATCAATATAGACGACCTTGAGGTCAAACTTGGTGAGCTTGAGGCAGAACTGGTTGAGATAAATGCCAATAGTGAGAAGCTACAACGTTCTTACAATGAACTTTTGGAGTATAAGCTTGTTCTGCAGAAGGCTGGAGAGTTTTTCATTGCAGCGCAAAGCAGTGCTGTAGAGCAGCAAAGGGAGTTTGAATCACGACAAACTGGTGGAGATTCAATAGAAGTTCCATTGTTGTTGGAACAAGAATCACTTGTGGATCAGTCAAAGCCGGTTAATTTGGGATTTCTCTCTGGTCTTGTTCCTCGGGAAAAATCTATGGCATTTGAGAGGATACTTTTTCGTGCTACCAGGGGCAATGTGTTTCTGAAGCAGACTGCTGTTGAGGATCCTGTTGCAGATCCTATTTCTGGAGAGAAGGTTGAAAAAAATGTGTTTATTGTTTTCTACTCTGGAGAAAGAGCAAAGAATAAAATTCTAAAAATATGTGAGGCATTTGGTGCAAATCGATACCCTTTTACTGAGGATGTGGGGAAACAAGCCCAAATGATTGCTGAGGTTTCTGGAAAACTGTCTGAGCTGAAGACTACGATAGATATAGGGCTGCTGCACCGGGGTAATCTGTTGCAGACTATTGGAGAACATTTTGAAAATTGGAATCTCCTGGCGAGGAAGGAAAAGTCCATATACCATATCTTGAACATGCTTAGCCTTGATGTAACAAAAAAATGTCTGGTCGCTGAGGGGTGGGGTCCTGTTTTTGCTACAAAGCAGATCCAAGATGCACTCCAGCGAGCAGCATCTGATTCCAACTCCCAGGTTGGACCAATTTTCCAGGTTTTATTAACCACGGAGGCACCACCTACGTATTTTCGGACAAACAAATTCTCCTCTGCTTTTCAAGAAATTGTCGATGCCTATGGGGTGGCAAGGTATCAAGAAGCAAATCCTGGTGTATACACCATTGTCACGTTCCCATTTCTATTTGCTGTTATGTTTGGCGATTGGGGGCATGGAATATGTCTGCTCCTTGCAACCCTGTATTTTATATTACGGGAAAAAAAACTTTCTTCTCAGAAGCTTGGAGATATCACTGAAATGGCCTTTGGTGGACGCTATGTCATTTTGATGATGTCACTATTTTCAATATACACTGGTCTGATCTATAATGAGTTCTTTTCAGTCCCATTTGGACTGTTTGGTCGCTCAGCCTATGCATGTCGGAGTCCTGATTGCAGTGATTCTACCACTGTGGGGTTGCTAAAGGTGGGTTCTACATATCCATTTGGCTTGGATCCTGTATGGCATGGCACTCGAAGTGAACTTCCATTTCTCAACTCTTTGAAAATGAAAATGTCCATCCTCCTTGGAGTTGCACAAATGAACCTTGGGATTATAATAAGCTATTTCAATGCTACATTTTTTAGGAACAGCATTAATATCTGGTTCCAATTTCTACCACAAATGATATTCCTGAACAGCCTATTCGGCTATCTTTCCCTTCTCATCATCATAAAGTGGTGCACTGGTTCAAATGCTGATCTGTACCATGTAATGATATACATGTTTCTAGGCCCTACTGAAGATCTGGCTGAAAACCAACTTTTTCCTGGGCAGAAAAATGTTCAGATTGTGCTGCTCTTACTGGCCCTTGTTGCCGTGCCGTGGATGCTGCTTCCAAAGCCTTTTCTTTTGAAGAGACAGCACGAACAGAGGTTCCAAGGCCAATCTTATGCACCCCTTCCAAGTGGTGATGATTCCCTCGAGTTGGATTCACATCATGATTCGCATGGTCATGAGGAGTTCGAGTTCAGTGAGATTTTTGTGCATCAGCTTATTCATACCATTGAATTTGTGCTTGGAGCAGTGTCAAATACAGCTTCCTATCTTCGTCTATGGGCTTTAAGTCTTGCGCACTCAGAGTTGTCAAGCGTGTTTTACGACAAGGTTCTCGTTCTATCCGCAGGGTTCAACAACATTATAATCTTAATAGTAGGCATTATCGTTTTCATTTTCGCTACGGTTGGGGTGTTGCTACTGATGGAGACTTTAAGTGCCTTCCTTCATGCACTGCGTCTTCATTGGGTCGAGTTCCAAAACAAGTTCTACGAGGGAGACGGGTACAAATTCCATCCCTTTTCATTCGCATTGCTAGATGAAGATGATGATTGA 2457 43.22 MGDTRGGCCPSMDLFRSEPMQLVQLIIPIESAHRTISYLGDLGLLQFKDLNADKSPFQRTYAAQIKRCGEMARKLNFFKEQILRAGLSSKSSVSQVDINIDDLEVKLGELEAELVEINANSEKLQRSYNELLEYKLVLQKAGEFFIAAQSSAVEQQREFESRQTGGDSIEVPLLLEQESLVDQSKPVNLGFLSGLVPREKSMAFERILFRATRGNVFLKQTAVEDPVADPISGEKVEKNVFIVFYSGERAKNKILKICEAFGANRYPFTEDVGKQAQMIAEVSGKLSELKTTIDIGLLHRGNLLQTIGEHFENWNLLARKEKSIYHILNMLSLDVTKKCLVAEGWGPVFATKQIQDALQRAASDSNSQVGPIFQVLLTTEAPPTYFRTNKFSSAFQEIVDAYGVARYQEANPGVYTIVTFPFLFAVMFGDWGHGICLLLATLYFILREKKLSSQKLGDITEMAFGGRYVILMMSLFSIYTGLIYNEFFSVPFGLFGRSAYACRSPDCSDSTTVGLLKVGSTYPFGLDPVWHGTRSELPFLNSLKMKMSILLGVAQMNLGIIISYFNATFFRNSINIWFQFLPQMIFLNSLFGYLSLLIIIKWCTGSNADLYHVMIYMFLGPTEDLAENQLFPGQKNVQIVLLLLALVAVPWMLLPKPFLLKRQHEQRFQGQSYAPLPSGDDSLELDSHHDSHGHEEFEFSEIFVHQLIHTIEFVLGAVSNTASYLRLWALSLAHSELSSVFYDKVLVLSAGFNNIIILIVGIIVFIFATVGVLLLMETLSAFLHALRLHWVEFQNKFYEGDGYKFHPFSFALLDEDDD* 819
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
7 346023 357462 - CsaV3_7G000200.1 Csa07g00020 535583
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa07g00020 818 Pfam V-type ATPase 116kDa subunit family 38 810 IPR002490 GO:0033179|GO:0046961|GO:1902600
Csa07g00020 818 PIRSF ATP6V0A1 10 818 IPR026028 GO:0000220|GO:0046961
Csa07g00020 818 PANTHER VACUOLAR PROTON ATPASES 6 818 IPR002490 GO:0033179|GO:0046961|GO:1902600
Csa07g00020 818 PANTHER V-TYPE PROTON ATPASE SUBUNIT A 6 818 - -
Csa07g00020 818 Coils Coil 93 127 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa06g01652 Csa-Chr6:14511145 Csa07g00020 Csa-Chr7:346023 0 transposed
Csa02g02102 Csa-Chr2:19116549 Csa07g00020 Csa-Chr7:346023 0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa07g00020 K02154 - csv:101211364 1566.98