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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa07g00128 ATGGCGAATCTCTCCGCTCTGGTTCACGAGCTTCGAGAACGTATAGCAGCTTCCTCATCCACTCCTAATCGCGCAGATGACTTCGGTCTCGAAGTCCGATTTCGCGCCTTCCTTCCCAATCTTCTTCACGATCACGTCGTTCCATCTTCCTCAGTAAATGAGAGAGAAGTAGTTGCTGTATTGAAGCTCATCTCGATCACTGCCAGGAACTTTCCTGGCGTTTTTTACCATGGAAAGGCTAGCGCCATTTTGCCTGTGATTGCTCGGATATTGCCTTTTTTTGCGGAGACTACTATCCAGGCACAACATGGAGTCATTTTTGAAACCGTTGGTTCCCTTTTATCCTTGCTTCGTACTGGAGCACGGGATGCGTACCGTCAATTTTTTCTCGATGCCATGTCAGTTGTTGAAGATATTTTATACACTGCATCACTTGGCACTGATACTTCAAGCTTTGTGGAGTCCACAAGTATCAATTTGAGTTGTTTCTGTGAATCTTTAAAAGGAATCTTTGAGGATCCCGATCATCTTGGGGATCTTCCAGAAGTCAACAGACCAACTAATGGCTCTGGTATTTTGATAAATCTAACGGGGAAAAAGAGGTGGCGGCCTTTTGCAACTTGGATTATTAAGCTTCTTGGTAGATGCTTGGCTGAGGGAACTGTATATGTTGAAGGACTTATCAGTATGTCAGATGTTTCAGCAGCATGTTCATTATTATGTTATGGGGATGCTGATTTGCAAATGGCATGTTTTGACTTTGCACGTATTGTTGGCTTGGTGATAGACGACATCGTTCCTTATCAGCCTTTAATCCAGTCAATATCTACTATATTAAGTGAAGACAAACAGGGGCTTCCTGTATTTAGGAACATACCATATGATAATTCTATTGGGGGTTGTCTTAATGTGCTATACTCCAATTGTTGTGACGATGTTGTCAAGCTAACTGCTGCAGACATGGTTGGCATATTTTCACAGTCATTGTGGAGAACCAAGAGCATGGAGCTCAAGGTTTCCTTATGCAATGCATACATGCGGATTGCTAAAATCTGTCCTCCTCATATCTGGAGGCCTGAAATACTCGTTGATATGCTTTCTTTTCCAGAACCTTGCTTTGCTTTGATAGATTGCTTCAAAGCAGTTCTATCTATTCTTGGTCCTGATTATGTTGGAGGGTCTTTACCAGGCATGGGTTCATCAGAATTGAGCAATAAATCAACTGAAATCTCTCGAATTGGAGAAAAGAGACCCTTTGAGGAGTTGGATATCGTGAAGAAAAAAAGACCAAAGATGGATGGAGAAATTGTGAGCTCCGAAGCTGATATTATGGTTGAGTGCAAGAAGCCTCACATCAAAATTTGTGAAACTGAAGAAACTTATGCAAATAATTTGCATAATTTACTTGTTTCATTTGTTGGATGTTTAAAAGCTTCTTCCTTCAGGGCTGATGCTTTAAGACCAGAAGTTTCACTAACAGCTCTTAGCATGCTGTGTATTGCTTTCTGTCGGTACCCTGAAACTCGTTTGTCCATGGTCATATTTCAGGAAATGGTTTCATGGATTCCCTGGATATATGAGCAGGCGAAGAAAGGAAGCTCAATTTCCATCGACATCTCCATTTTTCTTGAAGGAATTCACAACATACTTCTTTTACCAAACCATATATCTTCATGTTTATTTTCACTCTTGTCTGGAAGTAATGGTGAATGTGCTGAAACAATGTCTGTGATACTTAAAGTTCCATGGACCCATTCAATCACCAGTACTGAATCTCACAAGCCATGGAAGACAAGATGCATCTCTGTTCAGGTTTCGTCAAAAATTACTTCTATCACGAAGGATGAAACTGATCTTGAGATCCTGGATTTGAGTCTTGTTGATGAAAATGATGAAGTTAGAACTGAGGCTGCCATTTCAATTCCAGTGATTGCTCTATGGACTGGTTTTGACAGGCTAACACCGTTGTTTAGGAGACTGGAGATCTTGAAGGAAGAAATGCATGAAAAAGTTAAGAAGATTATCCCAGTTTCTCTTGGGTTTTTATCATGCCTGTATGGATCTTGCCATTCAGTGAGTAGGTGCAAATTATTTTTAAATACCAACAGTGATAGATGTTGCCAGACAGTTAACTATGTGTTACAAGGATTTTGGTGTTCAAAATGTGATCGGACTGTTCTGCATGATCATAAACTTTATGCAAATATAATTGAGCAATCTGACTTTTACCCAAAAATGAATTTGGATAGTGATTTTGTCCATTTAGTGTCGATGTTTTTCAAACTTCTTTTTGATGAGTCTTCAGAAGAGGTTCAATTGTCCTGCGTGGGAACTCTTAGACGAATTCTGGTCCATGGGAGTAGGGATGTTCTACATCAAACGAAGACCGATTGGCTTAAATGTGTTGAGTTTTTGCTTCTGAACAGAAAAAAGTCAATTAGAGAAGCATTCTGCCTTCAAATTAGTTCCTTCCTAGAGGATCACATCACAAGTTGCTTTTTCTCAGAAGAAGATATTTCAAACAAAAGGAAAGAGCTAATGTTTTTGGATTTTATTAAAACTGCAATGGTATCAACTGCAGATCCCCAAATTCTGGACACTATACTAGAATCTGTAGCAGAGCTCATGAATGCAGTTGATATTCACAGTGACTTTTTCTCCCTGTCTCTTTTATTGTTGGTTGATCATCTTGATAATCCATACATAGCAGTGAGGTTGAGTGCTTCAAGGGCTATCCACAGAGCTTGTTGTTTCCATTTTAAAGGGAATTTTAATATGATATTTTCAAAAGTTATCCATCTACGTAATGAGCTATTTGATCACGTCTCTAGCAGACTTGTTAACCATCCAAAAATCGTACAAGAATTTGCAGAAGCTGTTTTGGGTGTTGAAACTGAAGTGTTTGTTAAGAAAATGATTCCTGTTGTTCTTCCGAAGCTGATTGTCTCTCATCAGAACAATGATCAAGCTGTTGAATCTTTATATGAATTAGCTAAATGTGTGGACACAGATATGGTTACGTTAATAGTAAATTGGTTGCCAAAAGTTCTTGCCTTTGTTCTCTACCAAGCAAATGGGAAGGAGTTATGTTCTGCCTTGGAATTTTATCATGCTCAGACGGGTTCAACTCAGGAAGAAATTTTTGCTGCTGCATTACCTGCACTTCTTGATGAACTAGTATGCTTTGTGGATGGTGGCAATTCAGATGAGGTCAGTAAAAGGTTAGCAAGAGTTCCTGAGATGATATTACAAGTTGCTAGAGTTCTTACTGGAGGAGATGATCTTCCAGGATTTTTGAGGAATCATTTTGTTGGCCTCCTTAACAGCTTGGATAGGAAAATGCTCCATGCAGAGGATGTTTGCCTGCAGAAACAAGCCCTGCAACGAATTGAAATGCTGATAAAGTTGATGGGTTCTCATCTTAGTACCTATGTGCCAAAACTAATGGTTCTTCTTATGCATGCTATTGGGAAAGAAGAACTGCAAAGTGAAGGTCTCATTGTTTTGAATTCTTTTATCCAACAACTGGCTATGGTATCACCATCTAGCATCAAGTATGTGATTTCTCAAGTCTTTGCTGCACTTGTGCCTTTCCTGGAGAGAGATGAAACTTCCACACATTTAGATATGGTGGTAAAAATTTTGGAAGAGCTTGTTTTAAAAAACAAGAGTATACTAAAGGTGCACATACGCGAATTCCCTCCACTGCCTTGTATTTCTGCTCTGACAGAAGTGAACAGAGCTATAAATGAAACTCGTGGATCAATGACTCTAAAGGATCAATTACGAAATGTTGTAGATGGCTTAAATCACGAGAACTTAAAAGTGAGATACATGGTGGCATGTGAATTGAGAAAATTGTTGAACATGAGAAGCAAGGAGGTTACAACTTTGATAAGTGCTGAAGCTGATCTAGACATGGATGTTCTGAGCTTACTAATCTCATCCTTGCTAAGAGGGTGTGCTGAGGAGTCAAGGACTGCAGTGGGCCAACGGCTGAAATTGATTTGCGCTGATTGTATTGGTGCACTAGGTGCTGTTGATCCTGCTAAAGTGAAGAGTTTTTCTTGTGAACGATTTAAAATTGAATGTTCTGATGATGATCTAATTTTTGAGTTGATTCACAAACACTTAGCTCGGGCTTTTGGAGCTGCACCAGATACCATTATTCAAGATTCAGCGGCATTAGCCATTCAGGAGCTTCTAAAAATTGCAGGGTGTAAGGCATCGTTAGATGACAATACTGCTCCTTCAGCATCACCATCGTTGAAAGATAAAGAAACTTCAAAAACTGTCGCATCTGATTCTTCTGATGATGATCATGCGATGAGTATAAGAGGTCAGAGATTGTGGGGACGTTTCTCTGATTATGTGAAAGAAATTATAGCGCCGTGCTTAACCTCAAGATTTCAACTCCCAAATGTGGTTGACTCTGCATTTGCTAGTTCAATATATCGACCAGGCATGTCATTCAGAAGGTGGATATATTTTTGGATAAGAAAACTAACTGCACATGCAACTGGGTCTCGTGCAGGTATTTTTCATGCTTGTCGCGGTATAGTGCGGCATGATATGCAGACAGCTGTTTATTTGCTGCCTTATTTAGTTCTTAGTGCTGTCTGTCATGGGACAGAGGAAGCACGACATGGCATAACAGAAGAAATCTTGTCTGTTCTCAATGCTGCAGCAGCAGAGAATGGTGTGGCTTTGATTCACGGAAATACTGGGGGGCAAAGTGATGTTTGTATTCAAGCCGTGTTTACTCTTCTTGATAATCTAGGACAGTGGGTGGATGATGTTGAACGAGGATTGTCACTTTCTCAATCTGGTCAGTCATCGTCTTCTAAGCATTTGGTGGCCAAATCAAAGGAATCAAGTTCAAATGTTCATGTTGATCAGGAGCAACTCCTGGTTCAGTGTAGGTATGTTTCACAGCTTTTAGATGCAATTCCAAAGACCACTCTTGCTAGGGCTTCCTTGAGTTGTCAGGCCTATGCTAGATCTTTGATGTATTTTGAGTCATATGTACGAGGAAAATCTGGTTCTTTTAACCCTGCGGCTGAGAGGAGTGGCATCTTTGAGGATGAAGATATTTCATATCTCATGGAAATATATAGTTTCCTTGATGAGCCTGATGGTCTATCTGGCTTGGCATGTTTACGTAAATCCTTGAGGTTACAAGACCAACTTTTGATAAATAAAAAAGCTGGAAACTGGGCAGAAGTTTTGACTTTTTGTGAACAGGCCTTGCATATGGAACCAAATTCAGTTCAAAGGCATTCGGATGTTCTTAATTGTTTGTTAAATATGTGCCACCTCCAAGCTATGGTTACTCATGTGGATGGTTTAATCACGAGGATTCCTCAGTACAAGAAAACGTGGTGCATGCAAGGAGTGCAGGCAGCTTGGAGGCTTGGCAGGTGGGACCTCATGGACGAATACCTCAAGGGAGCTGATGAGGAAGGCCTTCTTTGTAGCAGCTCTGAGAGTAATGCTTCTTTTGACATGGACGTAGCAAAAATTCTGCAGGCAATGATGAAGAAGAATCAGTTTTCAGTTTCTGAGAAAATTGCTCTATCCAAACAGTCTCTGATTGCCCCTCTTGCTGCTGCTGGCATGGATTCTTACGCACGTGCTTATCCATTTGTTGTGAAACTCCACCTTTTGAAAGAGCTTGAGGACTTCCATAACCTTCTCTTTAATGACTCTTTCTTGGAAAAATCATTTCATGTAGATGATCAGGAATTTTCAGAAATGATACAAAATTGGGAGAACCGGCTGAAATTTACTCAGTCATCACTCTGGGCAAGAGAGCCACTCCTGTCATTTCGGAGATTGGTTTTTGGTGCTAGTAGTCTTGGTGCTCAAGTTGGGAACTGTTGGCTTCAGTATGCAAAGCTCTGTCGCTCTGCTGGCCATTATGAAACAGCAAACCGTGCAATTCTTGAAGCTCAAGCCTCTCGTGCACCTAATGTCCATATGGAGAAAGCAAAACTTTTATGGAGTACTAGGCGGTCTGACGGTGCTATCTCAGAATTGCAACAATCTCTTCTAAATATGCCTGTGGAAGTCATAGGATCTGCTGCAATGTCATCAATAACAAGCCTTTCCTTGGTTCCAATGAACCCAGCTCCTTTAATCTGTGATACACAAACTTTGAATGAGAATAGAGATATTGCAAAGACTCTTCTCCTATACTCAAGGTGGATACATTGCACTGGGCAAAAGCAAAAGGAAGATGTCATCAATCTTTATTCAAGAGTGAAGGAGCTACAGCCCAAGTGGGAGAAAGGATATTTTTTTATGGCCAGGTACTGTGATGAATTGCTTGAAGATGCCAGGAAACGCCAGGAAGATAGTTTCGAACAAGGTTCGAGAAAAGTCTCATCATCTTCTACTGCTATTGGCCCTCCAAATTTAAATAATGAGAAGCCCTGGTGGTCTTATGTGCCTGATGTACTCCTGTTCTATGCAAAAGGACTTCACAGGGGTCACAAGAATCTATTTCAAGCACTTCCAAGGTTGTTAACTCTGTGGTTTGACTTTGGAAGCATCTACCAAAGAGTTGGTTCACCATCCAACAAGGAGTTGAAAAGTGTTCATGGAAAGGTTCTGAGCATCATGCGGGGTTGTTTAAAGGATTTGCCAGCATATCAATGGTTGGCTGTACTGCCTCAGTTAGTTTCAAGGATTTGTCATCAGAATGAAGAAACTGTTCGATTGGTTAAATACATAATTGCTTCTGTTGTCCGACAGTATCCACAGCAAGCGCTTTGGATAATGGCTGCAGTTTCAAAATCCACTGTTCCTTCAAGACGAGAGGCAGCTATGGAGATAATCTATTCTGCAAAAAAAGATTTCAGTCAAGGAAAGGGTGGCAACAATTTATTTCTTCAGTTTGCCAGTCTAATTGATCATTTAATCAAGTTGTGCTTCCATCCAGGTCAACAAAGGGCGAAGAACATTAATATTTCTACGGAATTTAGCACATTGAAGAGAATGATGCCATTGGAGATTATTATGCCAATTCAACAATCTCTGGTTGTTAATCTGCCGACATATGATGTGAATCTCACTGATTCACCGAGTTCTGACATCTTTTCTGGCACAGAGCTTCCTACAATATCAGGAATAGCTGATGAGGCTGAGATTCTTTCATCACTTCAGCGGCCTAAGAAAATCATTCTATTGGGTAGTGATGGTATTGAGCGACCATTCCTCTGCAAACCCAAGGATGATCTCCGGAAAGATGCTCGCATGATGGAGTTCACAGCAATGATTAATCGTTTATTATCCAAATATCCAGAAAGCCGCCGGAGGAAGCTCTACATACGCACTTTTGCTGTGATACCTCTGACAGAGGATTGTGGTATGGTAGAATGGGTTCCCCATACTCGTGGTCTAAGACATATACTGCAAGACATATATATTACTTGCGGTAAGTTTGACAGGCAGAAGACAAATCCCCAAGTTAAGCGAATATATGATCAGTGCCAAGGTAAAATACCTGAAGGTGAGATGCTGAAGACAAAAATTCTCCCTCTGTTCCCTCCCGTTTTCCATAGATGGTTTTTAAATACCTTTTCAGAACCAGCTGCTTGGTTTAGAGCCCGGATAGCTTATGCACATACAACTGCAGTTTGGTCTATGGTTGGGCATATTGTGGGGTTAGGTGATAGACATGGTGAAAATATTCTTTTTGATTCTACTACGGGTGACTGCGTTCATGTCGATTTCAGTTGTTTATTTGACAAAGGTCTGCAGCTTGAAAAGCCTGAATTGGTGCCGTTTAGGCTAACCCAGAACATGATCGATGGATTAGGAATCACTGGTTATGAGGGCATTTTCTTGAGAGTTTGTGAAATTACTCTTTCTGTATTAAGATCTCATCGGGACACTTTGATGAGCATACTTGAAACTTTCATTCATGATCCACTTGTGGAGTGGACAAAATCTCACAAATCCAGTGGTGTTGAAGTTCAGAATCCACATGCTCAGTTAGCCATCAGTAACATTGAGGCTAGGTTACGAGGTGTAGTTGTTGGCGTTGGAGCTGCACCATCTTTGCCCCTGGCTGTTGAAGGTCAGGCTCGTCGATTAATTGCTGAAGCAGTTGCACACAAAAATCTTGGGAAGATGCTTTTCCAGCATTCTCTCCCAGTCGCCCTAGGCTCTTCTGCCAACTTGGCAAAGTTTCTTGGAGGACAGATTCTTGGCAAACTAAGGCCTTTTTTTAATGAATGTAAAGCAAGCGCAGTCCATGATCTCTCCAAGCAGGCACTGTTGTTATTACCTTCGAAACTCCAAGGTCCAATGCAACTTCTTTTATACGTTTTGGCTCATGTTGCTACCTACCTCACCACTAGCGTGGTTTTTGGTAGTATTGTCGATCATATCAGGGAAGAAGCCCTTAAGGGGTGGTTTTGTGCTAAATCTTTGAAATGTTTTGAGGGAAGTTCCTTGAAATAG 8469 40.83 MANLSALVHELRERIAASSSTPNRADDFGLEVRFRAFLPNLLHDHVVPSSSVNEREVVAVLKLISITARNFPGVFYHGKASAILPVIARILPFFAETTIQAQHGVIFETVGSLLSLLRTGARDAYRQFFLDAMSVVEDILYTASLGTDTSSFVESTSINLSCFCESLKGIFEDPDHLGDLPEVNRPTNGSGILINLTGKKRWRPFATWIIKLLGRCLAEGTVYVEGLISMSDVSAACSLLCYGDADLQMACFDFARIVGLVIDDIVPYQPLIQSISTILSEDKQGLPVFRNIPYDNSIGGCLNVLYSNCCDDVVKLTAADMVGIFSQSLWRTKSMELKVSLCNAYMRIAKICPPHIWRPEILVDMLSFPEPCFALIDCFKAVLSILGPDYVGGSLPGMGSSELSNKSTEISRIGEKRPFEELDIVKKKRPKMDGEIVSSEADIMVECKKPHIKICETEETYANNLHNLLVSFVGCLKASSFRADALRPEVSLTALSMLCIAFCRYPETRLSMVIFQEMVSWIPWIYEQAKKGSSISIDISIFLEGIHNILLLPNHISSCLFSLLSGSNGECAETMSVILKVPWTHSITSTESHKPWKTRCISVQVSSKITSITKDETDLEILDLSLVDENDEVRTEAAISIPVIALWTGFDRLTPLFRRLEILKEEMHEKVKKIIPVSLGFLSCLYGSCHSVSRCKLFLNTNSDRCCQTVNYVLQGFWCSKCDRTVLHDHKLYANIIEQSDFYPKMNLDSDFVHLVSMFFKLLFDESSEEVQLSCVGTLRRILVHGSRDVLHQTKTDWLKCVEFLLLNRKKSIREAFCLQISSFLEDHITSCFFSEEDISNKRKELMFLDFIKTAMVSTADPQILDTILESVAELMNAVDIHSDFFSLSLLLLVDHLDNPYIAVRLSASRAIHRACCFHFKGNFNMIFSKVIHLRNELFDHVSSRLVNHPKIVQEFAEAVLGVETEVFVKKMIPVVLPKLIVSHQNNDQAVESLYELAKCVDTDMVTLIVNWLPKVLAFVLYQANGKELCSALEFYHAQTGSTQEEIFAAALPALLDELVCFVDGGNSDEVSKRLARVPEMILQVARVLTGGDDLPGFLRNHFVGLLNSLDRKMLHAEDVCLQKQALQRIEMLIKLMGSHLSTYVPKLMVLLMHAIGKEELQSEGLIVLNSFIQQLAMVSPSSIKYVISQVFAALVPFLERDETSTHLDMVVKILEELVLKNKSILKVHIREFPPLPCISALTEVNRAINETRGSMTLKDQLRNVVDGLNHENLKVRYMVACELRKLLNMRSKEVTTLISAEADLDMDVLSLLISSLLRGCAEESRTAVGQRLKLICADCIGALGAVDPAKVKSFSCERFKIECSDDDLIFELIHKHLARAFGAAPDTIIQDSAALAIQELLKIAGCKASLDDNTAPSASPSLKDKETSKTVASDSSDDDHAMSIRGQRLWGRFSDYVKEIIAPCLTSRFQLPNVVDSAFASSIYRPGMSFRRWIYFWIRKLTAHATGSRAGIFHACRGIVRHDMQTAVYLLPYLVLSAVCHGTEEARHGITEEILSVLNAAAAENGVALIHGNTGGQSDVCIQAVFTLLDNLGQWVDDVERGLSLSQSGQSSSSKHLVAKSKESSSNVHVDQEQLLVQCRYVSQLLDAIPKTTLARASLSCQAYARSLMYFESYVRGKSGSFNPAAERSGIFEDEDISYLMEIYSFLDEPDGLSGLACLRKSLRLQDQLLINKKAGNWAEVLTFCEQALHMEPNSVQRHSDVLNCLLNMCHLQAMVTHVDGLITRIPQYKKTWCMQGVQAAWRLGRWDLMDEYLKGADEEGLLCSSSESNASFDMDVAKILQAMMKKNQFSVSEKIALSKQSLIAPLAAAGMDSYARAYPFVVKLHLLKELEDFHNLLFNDSFLEKSFHVDDQEFSEMIQNWENRLKFTQSSLWAREPLLSFRRLVFGASSLGAQVGNCWLQYAKLCRSAGHYETANRAILEAQASRAPNVHMEKAKLLWSTRRSDGAISELQQSLLNMPVEVIGSAAMSSITSLSLVPMNPAPLICDTQTLNENRDIAKTLLLYSRWIHCTGQKQKEDVINLYSRVKELQPKWEKGYFFMARYCDELLEDARKRQEDSFEQGSRKVSSSSTAIGPPNLNNEKPWWSYVPDVLLFYAKGLHRGHKNLFQALPRLLTLWFDFGSIYQRVGSPSNKELKSVHGKVLSIMRGCLKDLPAYQWLAVLPQLVSRICHQNEETVRLVKYIIASVVRQYPQQALWIMAAVSKSTVPSRREAAMEIIYSAKKDFSQGKGGNNLFLQFASLIDHLIKLCFHPGQQRAKNINISTEFSTLKRMMPLEIIMPIQQSLVVNLPTYDVNLTDSPSSDIFSGTELPTISGIADEAEILSSLQRPKKIILLGSDGIERPFLCKPKDDLRKDARMMEFTAMINRLLSKYPESRRRKLYIRTFAVIPLTEDCGMVEWVPHTRGLRHILQDIYITCGKFDRQKTNPQVKRIYDQCQGKIPEGEMLKTKILPLFPPVFHRWFLNTFSEPAAWFRARIAYAHTTAVWSMVGHIVGLGDRHGENILFDSTTGDCVHVDFSCLFDKGLQLEKPELVPFRLTQNMIDGLGITGYEGIFLRVCEITLSVLRSHRDTLMSILETFIHDPLVEWTKSHKSSGVEVQNPHAQLAISNIEARLRGVVVGVGAAPSLPLAVEGQARRLIAEAVAHKNLGKMLFQHSLPVALGSSANLAKFLGGQILGKLRPFFNECKASAVHDLSKQALLLLPSKLQGPMQLLLYVLAHVATYLTTSVVFGSIVDHIREEALKGWFCAKSLKCFEGSSLK* 2823
       

Gff information


Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
7 1127537 1141655 + CsaV3_7G001280.1 Csa07g00128 535691

Annotation


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa07g00128 2822 MobiDBLite consensus disorder prediction 1413 1440 - -
Csa07g00128 2822 Pfam Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase 2405 2650 IPR000403 -
Csa07g00128 2822 Gene3D Tetratricopeptide repeat domain 1735 2123 IPR011990 GO:0005515
Csa07g00128 2822 MobiDBLite consensus disorder prediction 1413 1427 - -
Csa07g00128 2822 PANTHER SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE ATR 57 2713 - -
Csa07g00128 2822 Gene3D - 2342 2462 - -
Csa07g00128 2822 Gene3D - 848 1271 IPR011989 -
Csa07g00128 2822 ProSiteProfiles FAT domain profile. 1654 2267 IPR014009 -
Csa07g00128 2822 SUPERFAMILY Protein kinase-like (PK-like) 2307 2653 IPR011009 -
Csa07g00128 2822 CDD PIKKc_ATR 2375 2651 - -
Csa07g00128 2822 Gene3D - 2518 2677 IPR036940 GO:0016301
Csa07g00128 2822 ProSiteProfiles Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases catalytic domain profile. 2378 2691 IPR000403 -
Csa07g00128 2822 PANTHER ATAXIA TELANGIECTASIA MUTATED ATM -RELATED 57 2713 - -
Csa07g00128 2822 Pfam UME (NUC010) domain 1098 1198 IPR012993 GO:0004674
Csa07g00128 2822 SMART UME_cls 1095 1201 IPR012993 GO:0004674
Csa07g00128 2822 SMART pi3k_hr1_6 2405 2710 IPR000403 -
Csa07g00128 2822 ProSitePatterns Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 2. 2544 2564 IPR018936 GO:0016301
Csa07g00128 2822 Pfam FAT domain 1799 2177 IPR003151 GO:0005515
Csa07g00128 2822 SUPERFAMILY ARM repeat 301 1355 IPR016024 -
       

Pathway


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa07g00128 K06640 ATR; serine/threonine-protein kinase ATR [EC:2.7.11.1] - csv:101212807 5354.26
       

Dupl-types


Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa01g00147 Csa-Chr1:890185 Csa07g00128 Csa-Chr7:1127537 2.07E-78 dispersed
Csa06g03323 Csa-Chr6:27781130 Csa07g00128 Csa-Chr7:1127537 1.90E-15 dispersed
Csa07g00128 Csa-Chr7:1127537 Csa07g00668 Csa-Chr7:4752118 1.26E-08 dispersed
       

Deco-Alignment


Select Vvi1 Blo1 Blo2 Bda1 Bda2 Bpe1 Bpe2 Bma1 Bma2 Cmo1 Cmo2 Cma1 Cma2 Car1 Car2 Sed1 Cpe1 Cpe2 Bhi1 Tan1 Cmetu1 Lac1 Hepe1 Mch1 Lcy1 Cla1 Cam1 Cec1 Cco1 Clacu1 Cmu1 Cre1 Cone1 Cone2 Cone3 Cone4 Lsi1 Csa1 Chy1 Cme1 Blo3 Blo4 Bda3 Bda4 Bpe3 Bpe4 Bma3 Bma4 Sed2 Cmo3 Cmo4 Cma3 Cma4 Car3 Car4 Cpe3 Cpe4 Bhi2 Tan2 Cmetu2 Lac2 Hepe2 Mch2 Lcy2 Cla2 Cam2 Cec2 Cco2 Clacu2 Cmu2 Cre2 Lsi2 Csa2 Chy2 Cme2
Vvi3g215 . . . . . Bpe12g00133 . . . . . . . . Sed04g3826 Cpe04g00609 . Bhi05g01671 Tan02g0643 Cmetu01g0717 . Hepe02g0401 . . Cla02g00402 Cam02g0407 Cec02g0407 Cco02g0423 Clacu02g0410 Cmu02g0406 Cre02g0741 . . . . . Csa07g00128 . Cme01g01220 . Blo13g00493 . . . . . Bma08g00743 . . . Cma11g01361 . Car11g01387 . . . . . . . . . . . . . . . . . Lsi11g01223 . Chy01g00655 .
       

Syn-Orthogroups


Select Orthogroup Bda Bhi Blo Bma Bpe Cam Car Cco Cec Chy Cla Clacu Cma Cme Cmetu Cmo Cmu Cone Cpe Cre Csa HCH Hepe Lac Lcy Lsi Mch Sed Tan Vvi Total
OG0012534 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29
       

Transcriptome


Select Gene Chr Type da1 da2 da3 da4 da5 da6 da7 da8 da9 da10
Csa07g00128 Csa_Chr07 FPKM 4.494361 5.169452 90.043716 88.776489 1581.805298 1734.635376 1407.923218 5.744144 3.2155 2.950668
Csa07g00128 Csa_Chr07 FPKM 3.733709 4.686183 83.800781 83.221329 1532.032104 1717.186035 1369.07019 6.292493 3.383924 3.304636