Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
HCH2g1374 ATGGCGTCTCTCGCGTTAACTTCCTCCTATCTTCCATCTCTCCGATCACGCCTTCCAAATCCCAATTCTAATCCCCAAATCCGATCAAATCTCTCCAAAACCGGATTAAGGATTAGCACCACCCGCATTCCTTATTCTACATCCAAACAAGTCGAATTCCCCAAGCAATCACAAAACTTGAAAACTTCTCGTAGAAATCTCAATGCTTTCACGATCCAAGCAGCTGCTTCTTCAGCTCCTTCAGCTCCTTTAGCTCCGGCTTCTCAGCCGTGGCAAGGCGCCGCAATCAAGCCGCTCGTAGCTTCCATTGCTACAGGTGTCATTCTCTGGTTCGTCCCCGTTCCTTCCGGTGTTTCTCAAAACGCGTGGCAATTACTTGCCATTTTCCTCGCTACTATTGTTGGAATTATCACTCAGCCTTTGCCTCTCGGCGCCGTTGCTTTACTTGGACTCGGCGCTTCCGTTTTAACTAAAACCCTAACTTTTTCCGCTGCTTTCTCCGCTTTTGGTGATCCTATTCCTTGGCTTATTGCTCTTGCTTTCTTTTTCGCGCGTGGTTTTATTAAAACTGGATTAGGTAATCGAATTGCTTATCAATTTGTTTCTTTATTCGGTAGCTCTTCGTTAGGGTTAGGGTATAGTTTAGTGTTTAGTGAGGCGTTGTTGGCGCCGGCAATTCCATCGGTTTCAGCTCGAGCGGGAGGGATATTCCTTCCGTTGGTGAAATCACTTTGTGTTGCTTGCGGTAGTAATGTCGGTGATGGGACGGAGAATCGGTTGGGGTCTTGGTTGATGCTTACTTGTTTTCAAACTTCGGTGATTTCGTCTTCTATGTTCTTGACGGCTATGGCTGCTAATCCTTTGAGTGCTACTCTGACTTATAATACGATTAAGCAGACGATTGGATGGACTGATTGGGCGAAAGCTGCAATTGTTCCCGGGTTGATATCGTTGATTGTGGTGCCGTTGCTTTTGTATGTGGTGTATCCACCCACGGTGAAGAGTAGTCCGGATGCACCGAAGCTTGCAAGGGAGAGGCTGGAAAAGATGGGACCGATGAGTAAGAATGAGATTATAATGGCTGGAACTCTGCTTCTCACGGTGGGTCTTTGGATTTTTGGAGGGGTACTTAATGTGGATGCTGTCACTGCCGCCATTTTGGGATTATCTGTCCTCCTTGTGACCGGGGTGGTGACATGGAAGGAGTGCTTGGCTGAAGCTGTTGCCTGGGACACCCTAACATGGTTTGCTGCACTCATTGCAATGGCAGGTTATCTCAACAAATATGGTCTTATCACCTGGTTCAGCCAAACTGTAGTAAAGTTTGTTGGTGGACTTGGTCTTTCATGGCAGCTGTCGTTCGGCATTTTAGTTCTTCTCTATTTCTACTCTCACTACTTCTTTGCAAGCGGAGCTGCTCATATCGGTGCCATGTTTACAGCCTTCTTATCTGTTGCCAGTGCTTTGGGGACTCCTCCCTATTTTGCAGCAATTGTACTTGCCTTCTTATCTAACTTGATGGGCGGCTTAACTCACTACGGCATTGGTTCTGCACCCGTCTTCTATGGTGCCAACTATGTCCCCCTAGCACAATGGTGGGGCTATGGCTTCCTCGTATCTATTGTCAATATCGTTATTTGGCTCGGCGCTGGAGGAATCTGGTGGAAAGCCATTGGTTTATGGTGA 1686 47.15 MASLALTSSYLPSLRSRLPNPNSNPQIRSNLSKTGLRISTTRIPYSTSKQVEFPKQSQNLKTSRRNLNAFTIQAAASSAPSAPLAPASQPWQGAAIKPLVASIATGVILWFVPVPSGVSQNAWQLLAIFLATIVGIITQPLPLGAVALLGLGASVLTKTLTFSAAFSAFGDPIPWLIALAFFFARGFIKTGLGNRIAYQFVSLFGSSSLGLGYSLVFSEALLAPAIPSVSARAGGIFLPLVKSLCVACGSNVGDGTENRLGSWLMLTCFQTSVISSSMFLTAMAANPLSATLTYNTIKQTIGWTDWAKAAIVPGLISLIVVPLLLYVVYPPTVKSSPDAPKLARERLEKMGPMSKNEIIMAGTLLLTVGLWIFGGVLNVDAVTAAILGLSVLLVTGVVTWKECLAEAVAWDTLTWFAALIAMAGYLNKYGLITWFSQTVVKFVGGLGLSWQLSFGILVLLYFYSHYFFASGAAHIGAMFTAFLSVASALGTPPYFAAIVLAFLSNLMGGLTHYGIGSAPVFYGANYVPLAQWWGYGFLVSIVNIVIWLGAGGIWWKAIGLW 561
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
2 55555405 55558463 - evm.model.ptg000010l.130 HCH2g1374 540599
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
HCH2g1374 561 NCBIfam DASS family sodium-coupled anion symporter 113 555 IPR001898 GO:0016020(InterPro)|GO:0022857(InterPro)|GO:0055085(InterPro)
HCH2g1374 561 CDD ArsB_NhaD_permease 133 555 - -
HCH2g1374 561 PANTHER DICARBOXYLATE TRANSPORTER 2.1, CHLOROPLASTIC 44 561 IPR030676 GO:0005215(PANTHER)
HCH2g1374 561 Pfam Sodium:sulfate symporter transmembrane region 97 561 IPR001898 GO:0016020(InterPro)|GO:0022857(InterPro)|GO:0055085(InterPro)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
HCH11g0980 HCH-Chr11:41330124 HCH2g1374 HCH-Chr2:55555405 5.40E-126 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
HCH2g1374 - - - 0.0