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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
HCH8g0492 ATGACACGAGTTGAGGAATTGTGGGAGCGCTTAGTTCGTGCTGCTTTAAGAAGGGATAGAATTGGCATTGATGCTTATGGACGCCCTGAAAGTGGCATAGCTGGAAACGTGCCCTCTTCACTTGCAAACAATAGGGATATCGATGAAATCTTAAGAGCTGCAGATGAAATTCAAGATGAAGATCCCAGTATCTCGAGAATATTATGTGAGCATGCATATTCGCTTGCTCAAAACCTGGATCCTAATAGTGAAGGAAGAGGTGTTTTGCAATTCAAAACTGGTTTGATGTCCGTCATTAAGCAAAAGCTAGCCAAGAGGGAGGGTGGAACCATAGATAGGAGCAAGGATATTGCTCAGTTACAAGAATTCTACAAAATATATCGGGAGAAAAATAATGTAGATAAACTGCGGGAAGATGAAATGAAATTGAGGGAGTCTGGTGCTTTCAGTGGCAACCTTGGGGAGTTGGAACGGACAACGTTGAAGCGTAAAAAAGTTTTTGCTACGCTGAAAGTATTAGCAATGGTTCTTGAGCAGCTCGGTGATGCAATTCCTGAAGAGATGAAAAGACTCATGGAATCAGATGCTGCAATGACTGAAGACTTAATTGCATATAACATTATCCCCTTAGATGCTTCTTCTACAACAAATGCTATTGGGTCCTTAACTGAGGTGCAAGCAGCAGTGTTGGCTTTAAAATATTTCAGTGGCCTGCCAAAATTGCCTGCAGAATTTTCTATTCCGGCCACTAGGAGTCCTGATATGCTTGATTTTCTGCACTTCGTTTTTGGATTTCAGAAAGACAATGTTTCCAACCAGCGTGAGCATGTAGTACACCTTCTTGCCAATGAGCAATCTCGTCTTCGTATTCCTGAAGAAACCGAACCAAAATTGGACGAGGCTGCTGTGGAGGCTGTTTTTAAGAAGTCTCTTGAAAACTACATTAAATGGTGTGAATATCTGTGCATTCAGCCTGTGTGGAGCAGTTTGGCTGCTGTTAGCAAGGAAAAGAAGCTATTATTTATTTCCTTGTATTTTCTAATATGGGGTGAAGCTTCCAACGTCAGATTTCTCCCAGAATGCTTGTGCTATATATTCCATCATATTGTTAGGGAAATGGATGAAATATTGAGGCAGCAGATTGCTCATCCAGCCAATAGTTGCAAGTCAAAAGATGGTGTTTGTTTCCTTGATCAAGTTATATCTCCTCTTTACGAGGTTATGGCTGCGGAAGCTGCAAACAATAAGAATGGGCAGGCACCGCATTCTGCTTGGAGAAACTATGATGATTTTAACGAATATTTCTGGTCGCTACGTTGCTTTGAGCTTAGTTGGCCATGGAATAAGAGCAAATCTTTTTTTCAAAAGCCATCACCAAAGTCAAAGAGTATGCTTGGTAGAAGTCATCATCAAGGGAAAACTTCATTTGTTGAGCATCGAACTTTTCTTCATCTTTATCACAGTTTCCATCGTTTATGGATATTTTTGGTTATGATGTTCCAGGGTCTTACTATAATTGCATTTAATAATGGGCGTTTTGATATGAAGACTGTGCTCGAAGTTCTGAGTCTTGGTCCAACATTTGTTTTAATGAAGTTTGTTGAGAGTGTTCTAGACATTGTAATGATGTATGGTGCATATTCTACTTCAAGACGTCTAGCTGTATGCCGGATTTTTCTGCGTTTCCTTTGGTTTAGTGTTGCTTCAGCTTCTATAACCTTCCTTTATGTGAAAGCTCTTCAGGAGGGGAGTAAACCAAATGCAGGCACAGTGATATTTAGACTCTATATAATAGTTGTAGGAATATATGCTGGTGTGCAGCTTTTCCTCAGTATCCTCATGCGTATACCTGCTTGCCATCTTTTGACCAATCAATGCGATCGGTGGCCTCTTATTCGCTTCATTAAATGGATGCGACAGGAACGATACTATGTTGGACGTGGGATGTATGAGAGGACAACTGATTTTATCAAGTATATGCTTCTGTGGCTTATCATTCTGGGTGCAAAGTTCGCATTTGCCTATTTTCTTCTGATCAAACCTCTTGTTGAACCAACGAAGCTTATTGTAAAAATTGATGATATAAGATATTCTTGGCATGATTTTGTTTCTAAAAATAATCATAATGCATTGACAATTCTTAGCTTATGGGCCCCGGTCTTTGCTATTTACATCTTGGACATCAATGTGTTCTATACTGTTATATCTGCTATTTGTAGTTTCTTGCTTGGGGCAAGAGATCGTCTTGGAGAGATTAGATCGTTGGAATCCCTTCATAAACTGTTTGAGCAGTTTCCTGGAGCTTTTATGGACAATCTTCATGTTCCTCTCCCAAACAGGACTTCAAACCGTTCGTCAAGTCAGGTTATTGACAGAGACAAAATTGACGCTGCTCGATTTTCTCCCTTTTGGAATGAAATTATAGCAAGTTTACGGGAAGAAGATTATATCACAAGCTTGGAAATGGAATTACTTCAAATGCCTAAAAATTTAGGGAATCTTCCCCTGGTTCAGTGGCCTCTTTTTCTTCTTGCAAGCAAGATATTTCTAGCTAAGGATATTGCTGTTGAAAAACGAGATTCACAAGATGAGTTGTGGGAGCGTATTTCAAGAGATGACTATATGAAATATGCAGTACAGGAATGCTACCATGCCATTAAGCTGATCTTAACAGAATTACTAGTTGGGGAAGGAAGGATGTGGGTTGAAAGAATATTTGAAGACATTCAATCAAGTTTAGCAAAGAAGACAATTCATGTTGACTTCGAGCTAAATAAGCTGCCACTTGTGATTACTAGAGTAACTGCCCTTATGGGTATTCTGAAAGAGCCTGAAACTTCGGAGCTGGAAAAAGGTGCTGTCAAGGCTGTTCAGGATTTGTATGATGTTGTGCGCTATGATGTTCTTCATATTGACATGAGGGGGCACTATGAAACATGGAACATATTGTCAAAAGCCAGAAATGAAGGTCGTCTGTTTACAAAGTTGAATTGGCCCAAAGAACCAGAACTGAAATCACAAGTCAAGAGATTGCATTCTCTATTAACTATTAAAGAATCAGCTTCAAATATTCCAACTAATCTTGAGGCCAGACGAAGACTGGAATTCTTCACGAATTCACTTTTCATGAGAATGCCTCCCACTAAACCTGTTCGTCAGATGCTTTCTTTCAGTGTATTTACTCCATATTATTCTGAGACGGTGCTTTATAGTATGGCAGAGCTCCTGAAGAAAAATGAGGATGGCATATCAACTTTGTTTTACTTGCAAAAAATTTATCCAGATGAGTGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGTCGAGATGAGAACGAAGTGGATCCAGAAGTGTTTGATAACCCTAATGACATCCTTGCACTGCGATTTTGGGCCTCTTATCGAGGACAAACATTAGCTCGAACTGTTCGTGGGATGATGTACTATAGGAAAGCTCTTATTCTGCAGACTTATTTAGAAAGAGGAACTTATGGAGACTTGGAAGCTGCCGTTCCTTATACTGATGCTATTGATACTCGGGGTTTTGAATTATCTCCTGAAGCACGCGCACAAGCAGATCTTAAATTTACATATGTAGTAACATGCCAAATATATGGAAAGCAAAGAGAACAACAAAAACCTGAGGCTTCTGATATTGCATTACTTATGCAAAGAAATGAAGCTCTTCGTGTTGCTTATATTGACGACATTGAGACCCTTAAGGATGGTAAGGTTCACAAAGAATTTTACTCAAAGCTTGTGAAGGCCGATATCAATGGAAAGGATAAGGAAATATATTCTATCAAATTGCCTGGAGATCCAAAGTTGGGTGAAGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTATTGTTTTTACACGTGGAAATGCAGTTCAGACAATTGATATGAATCAGGATAATTATTTTGAAGAAGCATTGAAGATGAGAAATCTACTTGAAGAATTCAGTTGTGATCATGGTATTCGTCCTGCTACCATACTGGGTGTCAGGGAACATGTATTTACTGGAAGTGTTTCTTCTCTTGCCTCGTTCATGTCAAATCAAGAAACTAGTTTTGTGACTCTTGGTCAGCGAGTTCTGGCAAAGCCCTTAAAAGTGCGTATGCATTATGGTCATCCAGATGTTTTTGATAGAGTTTTTCACATAACACGAGGTGGCGTCAGCAAAGCCTCCCGTGTTATCAACATTAGTGAAGACATCTTTGCAGGATTTAATACAACTTTACGGCAAGGGAATGTTACTCATCACGAGTATATTCAGGTTGGTAAAGGTCGAGACGTTGGGCTCAATCAGATCTCTCTTTTTGAAGGAAAGGTAGCTGGTGGTAATGGAGAACAAGTTCTTAGTCGTGATGTGTACAGGCTTGGCCAACTGTTTGATTTTTTCCGGATGTTGACATTCTATTTCACCACTGTTGGCTACTATTTCTGTACTATGTTAACTGTGCTGACTGTGTACATTTTTCTCTATGGAAAAGCATACTTGGCTCTGTCTGGTGTTGGTGCAGAAATTGAAGACAGAGCTCAAATTACAGATAACACTTCCTTGGCAGCTGCTCTAAATACACAGTTCCTAATCCAGATTGGGGTCTTCACTGCGGTGCCTATGATCTTGGGGTTCATATTGGAGCAAGGGTTCTTTAGGGCTATTGTCAGCTTTATAACCATGCAGCTTCAGCTTTGTTCTGTCTTCTTCACATTTTCTCTTGGCACAAAAACACACTATTTCGGCCGAACAATTCTTCATGGTGGTGCGAAGTATCATGCAACTGGAAGGGGATTCGTGGTTCGCCATATCAAATTCTCCGAAAATTATAGGCTCTACTCTCGCAGCCATTTTGTCAAAGGATTGGAAGTTGTGCTTCTGTTGATTGTGTACATGGCCTATGGTTATAGTTCCGGCAGTGCATTAGCATACATCCTTATCACTCTTAGCAGTTGGTTGATGGCATTATCTTGGCTTTTTGCTCCCTATTTGTTCAATCCATCTGGATTTGAGTGGCAAAAGACTGTGGAGGATTTCAAAGAATGGACCAATTGGCTTTTTTATCGAGGTGGAATTGGAGTCAAGGGTGAAGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGATTCAGAACTGGCACACATACGAACAATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACTCTTCTAAGTCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGCATTGTTTACAAGCTCAATGTGCAAGGATCAAATACATCATTGACGGTATACGGTTTCTCGTGGATTGTGTTAGCTGGGATCATAGTTCTCTTCAAGGTGTTTACATTTAGCCAGAAGATGACAGTTAATTTCCAGCTACTCCTAAGGTTCATTCAAGGTCTTTCATTCCTGATAGCGCTGGCTGGCTTAGCTGTTGCGGTTGCTATTACAGATTTATCAGTGCCTGATGTGTTTGCATCCGTCTTGGCATTTGTACCTACCGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTTTGATGAAGAAACTGGGGTTGTGGAAATCCATCCGCTCGATTGGTCTGCTGTACGATGCCGGAATGGGGATGCTCGTCTTTATCCCTATTGCATTACTCTCATGGTTTCCATTTGTGTCGACATTCCAAACTCGTCTCATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTGGAGATCTCCCTAATCCTTGCTGGAAACAACCCCAACACTGCCTTGTGA 5706 40.48 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1901
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
8 41370573 41456981 + evm.model.ptg000008l.1043 HCH8g0492 549590
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
HCH8g0492 1901 Gene3D - 33 190 IPR023175 -
HCH8g0492 1901 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
HCH8g0492 1901 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
HCH8g0492 1901 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1024 1711 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
HCH8g0492 1901 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 36 1895 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
HCH8g0492 HCH-Chr8:41370573 HCH8g1460 HCH-Chr8:49028492 0.00E+00 dispersed
HCH8g0491 HCH-Chr8:41235869 HCH8g0492 HCH-Chr8:41370573 0.00E+00 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
HCH8g0492 K11000 - csv:101216435 3461.39