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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
HCH8g0877 ATGGGCGTTGCTGCTATTCTCCCAGATCTCGGTACTCAGATTTTGATTCCGGTCTGTGCCGTTATCGGAATCGTGTTTTCGTTGTTACAGTGGTACTATGTTTCTTTAGTTAAACTCTCGCCTGGTCGGGATTCGGCTAATGTTAATAGTAACAGCGCCGCCGCCGGCGGCGCTGGTAAGAATGGGTATTCCGATTACCTTATTGAAGAGGAAGACGGTATTAATGACCATAACGTTGTCATTAAATGCGCCGAAATTCAAAACGCTATCTCTGAAGGAGCAACTTCCTTCCTTTTCACGGAGTACAAGTATGTTGGCGTCTTTATGGTGGCTTTTGCTGTCTTGATTTTCGTATTCCTTGGCTCTGTGGAGGGTTTTAGTACTAAGCCTCAGCAATGCTCATACGATAAAACTAAGACGTGTAAGCCAGCTTTGGCAACAGCTATCTTCAGCACTGTATCATTTTTACTTGGTGGTGTCACTTCTGTGGTTTCTGGTTTCCTTGGAATGAAGATTGCTACATATGCAAATGCCAGAACCACTTTGGAAGCAAGAAAAGGTGTTGGAAAGGCATTTATTATTGCTTTTAGGTCTGGTGCTGTCATGGGCTTCCTCCTTGCTGCTAACGGTCTCTTGGTTCTATTCATTGCCATCAACCTCTTTAAATTGTACTACGGTGAGGATTGGGGTGGCCTTTTTGAGTCTATTACTGGGTATGGTCTTGGTGGATCTTCCATGGCTCTCTTTGGCAGAGTTGGTGGAGGTATCTATACAAAAGCTGCTGATGTTGGTGCTGATCTTGTGGGCAAGGTGGAAAGGAACATTCCAGAGGATGATCCTAGAAACCCAGCTGTGATTGCTGATAATGTCGGTGACAATGTCGGGGATATAGCTGGTATGGGATCTGATCTTTTTGGCTCATATGCTGAATCATCCTGTGCTGCTCTTGTTGTTGCTTCTATATCTTCTTTTGGCAACAATCATGAGTTTACTCCAATGCTGTATCCTCTCATCGTCAGTTCTGTTGGGATCCTTGTTTGCCTGATCACCACCTTATTTGCAACTGATTTCTTTGAGATCAAGGCTGTTAAGGAAATTGAACCAGCATTGAAGAAGCAGCTCATCATTTCCACTGTTTTGATGACCTTTGGGATTGCTCTAGTTACTTGGATTTCTGTTCCATCCACATTTACTATTTTCAATTTTGGAACTCAGAAAGTCGTGCAGAACTGGAAACTGTTCTTATGTGTTGCCGTCGGTCTCTGGGCTGGGCTCATAATTGGATTTGTAACAGAGTACTATACAAGCAATGCATACAGCCCTGTGCAAGATGTTGCTGATTCTTGTCGAACTGGAGCTGCTACGAATGTCATTTTTGGGTTGGCATTAGGATACAAATCCGTCATTATTCCTATTTTTGCTATTGCAGTCAGTATTTTTGTGAGTTTTACCTTTGCTGCCATGTACGGTATTGCGGTAGCTGCCCTTGGAATGTTGAGTACAATAGCTACTGGTCTGGCCATTGATGCATATGGTCCTATTAGTGACAACGCAGGAGGTATTGCCGAGATGGCAGGCATGAGCCATAGAATTCGAGAGAGAACTGATGCCCTTGATGCTGCAGGAAATACCACTGCAGCTATTGGGAAGGGATTTGCAATTGGTTCAGCCGCTCTCGTGTCACTGGCTCTTTTTGGTGCTTTTGTGAGCCGTGCTGGAGTCACTACCGTTGATGTCTTGACTCCCAAAGTTTTTATTGGCTTGATTGTTGGTGCCATGCTGCCTTACTGGTTTTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTTGGGAGTGCAGCCCTAAAGATGGTTGAGGAGGTGCGCCGGCAATTCAATACCATCCCAGGTCTCATGGAGGGTACTGCTAAGCCTGACTATGCTACGTGTGTTAAGATCTCAACTGATGCTTCTATCAAAGAGATGATTCCACCAGGTGCCCTTGTCATGTTGACGCCTCTAATTGTCGGAATCTTATTTGGTGTGGAAACTCTTTCTGGCGTTCTTGCCGGATCCCTAGTCTCTGGTGTGCAGATTGCCATCTCTGCCTCCAACACAGGAGGTGCATGGGATAATGCTAAAAAGTACATTGAGGCTGGTGCCTCCGAGCATGCAAGAACACTGGGGCCTAAAGGATCAGATCCACACAAGGCTGCTGTTATCGGCGACACAATCGGGGACCCGCTCAAGGATACATCCGGACCTTCTCTAAACATTCTTATCAAGTTGATGGCTGTCGAGTCTCTTGTTTTTGCACCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGGATTCTTTTCAAGATCTAA 2325 45.33 MGVAAILPDLGTQILIPVCAVIGIVFSLLQWYYVSLVKLSPGRDSANVNSNSAAAGGAGKNGYSDYLIEEEDGINDHNVVIKCAEIQNAISEGATSFLFTEYKYVGVFMVAFAVLIFVFLGSVEGFSTKPQQCSYDKTKTCKPALATAIFSTVSFLLGGVTSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFIIAFRSGAVMGFLLAANGLLVLFIAINLFKLYYGEDWGGLFESITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGNNHEFTPMLYPLIVSSVGILVCLITTLFATDFFEIKAVKEIEPALKKQLIISTVLMTFGIALVTWISVPSTFTIFNFGTQKVVQNWKLFLCVAVGLWAGLIIGFVTEYYTSNAYSPVQDVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAVSIFVSFTFAAMYGIAVAALGMLSTIATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAALVSLALFGAFVSRAGVTTVDVLTPKVFIGLIVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEVRRQFNTIPGLMEGTAKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLTPLIVGILFGVETLSGVLAGSLVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSDPHKAAVIGDTIGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFATHGGILFKI 774
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
8 45227689 45231916 + evm.model.ptg000008l.658 HCH8g0877 549975
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
HCH8g0877 774 PANTHER K(+)-INSENSITIVE PYROPHOSPHATE-ENERGIZED PROTON PUMP 7 773 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
HCH8g0877 774 Hamap Putative K(+)-stimulated pyrophosphate-energized sodium pump [hppA]. 10 765 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
HCH8g0877 774 PIRSF H+-PPtase 12 773 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
HCH8g0877 774 NCBIfam V-type H(+)-translocating pyrophosphatase 12 770 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
HCH8g0877 774 Pfam Inorganic H+ pyrophosphatase 82 760 IPR004131 GO:0004427(InterPro)|GO:0009678(InterPro)|GO:0016020(InterPro)|GO:1902600(InterPro)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
HCH10g0915 HCH-Chr10:11827818 HCH8g0877 HCH-Chr8:45227689 0.00E+00 dispersed
HCH4g1591 HCH-Chr4:12605441 HCH8g0877 HCH-Chr8:45227689 3.10E-127 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
HCH8g0877 K23025 - csv:101222673 1406.35