Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Hepe05g0321 ATGGACAAAGCTTCAAAGCATCAGGTATCATTGAGGGGAGCGAGTGCAAAAGAAATTACGAGGGATGCTCTTGTTCAGAAGGTTATCCAGGAGAGAGAGCTACGCCAATATGCAAGAAAAGCCGCAGCTGCGGCTCTCTTTATTCAGAGAGTTTGGAGGCGCTACAGAGTGACTAAGATTGCTGCTTTGCAGCTTCAAGAAGGATGGGAAGAGTTGGTGAAGCGTCATTCTGGTGCACTGGCTGGCACATTCATTTCCTATAATATTTTGAGACCGTTCCTCTTCTTTATCTCGTCTTTTCTGAAACGACCTCAAAGTATCCAGACTAGAGATTTAGACTGTATGAAGAATTGCTTTAAAATCTTGTTTGAAAGCATCAATTCTACTGAATCAAAGAACAACTTTTGCTCCTTCGCCACTGGTACATCTGAAGAAAGAAGAATGTGGACTTACCAATCAAGGAAGCTTATTTCTGTATGCTTATTTATTCTTGTGCATTTTGACAAGTTGCAAGCGAAGGAGCAAGAAATTGTTGTTACGACCTCTTTAGCCATGCGCCTGATAGTCGTCTTAACTGATCATAATGGGTGGAAGAGTGTAAATGAGAATAGTCGTTTTGATGCTGATGCAGCATTGAAGGATTTAGTTCATTATTTGGGAACTTCTGAAAGCGGTCTTTACTTATCAGTCAGAAAATACATGTATAAATTGAGTGTTCTCCAGTCTTCACGGACCACCAGTTCTATCCAGACAAAGGATTTGTTAGTTATTACTGTGAGTGCAATAACTTTGGCTTTACGACCATTTTATTTAATAAATTTTGATGCAATTGGCACTACTTCGTGGGAAGGGCATTATGTCGCTGAACAGTTCTGCTTGCTTCTACTTACAATTCCTGGGCTTGTTCAAAATTTGCCACAAGTTCTCGTGCCAGCTGTAAAGCATCGATCTATCTTGCTACCATGCTTCTGGACTCTATTGACCAAGAAAGAGACAATTTTGTTGAGAATGTCGGGCCTGGACCAATTATCAGTTGATTGTGGCTCGAAGGTTTTTCCGGCAGTTGGGTGGGCTCTTGCAAACATTATATCTCTGGTAGCAGGGAGTGAAACTAAGGCAAGGGATTCTGGTTGGTTCAAGCAGAGTTTAGACTATGTGTTATATGCTCGTGTGGTTGTCACTTTGGCGGAAAGCTTTTTGGCTTTGATTGGGGATGTTGGATGTGGTAAAAAGGAGAATCAAGATATCCAAAGCAACGAAACTTCTTATGAATGCTCTGATGCAGGGGTTCACAAGAATGAAATGGCATCTATGTCTTTAAGCACATCATTCATAGATATGTTTAGGCCTATTTGTGAACAGAGGCATCTCACAGATCTTTTGACTATAGTAAATACAGATGTTTATTCTGAAAATAGAACTGCACAATCAAATAATATGGAAAGTATGAAAAGCTTGAAACTGCTTGATGTATCATACTTTTACATGTACATGCTCAAAATATTCTCACTATTGAATCCGTTGGTTGGATCCTTACCTGTTCTTAACATGTTATCTTTTACTCCTGGATTTCTTGTTGATCTGTGGGGAGTGTTAGAAAGTTCCCTTTTCCCCAGTGATGCCAATGGAGCTGAAGATCACTTTCCTGGCTCAAGTAAAGTATCAAGTAAAAATAAAGATGAAGTTTTTGGCAAAAAGCAAAAGCCAGTCAGTAAGGATGGAAGTAGTAAGTGGGTAACTGTCTTTAATAAGTTCACGAGCAAGTCACAGCCAGGTAGTGATCACGTGGACACAATTGAAGTTCAATCAAGACAGGGGAATGGCGACTTATGTGATTTATGGGACATAAAATCTTTGAGTTGTGGTCCACAAGGTATTTCAAAAGATTTGTCATGTCTGCTCTATCTTTTCAGTGCCACATATGCTCATCTGCTGTTAGTTCTAGATGACATTGAGTTCTATGAAAAACAGGTTCCATTCAGGCTGGAGCAGCAAAGAAAACTTGCATCAATGCTCAATACACTTGTGTATAATGGTTTGTCCTATGGTACTGGTCAGCAGAACACATCTCTTATGGAATCTGCAATCAGATGCTTGCTTCTGATCTATGAGAGGGATTGCAGACATCAATTTTGTCCTCCTACGCTATGGCTTTCACCTGCTAGAACAAGTAGACCACCTGTTGCAATTGCTGCAAGAACTCACGAAGCTTTATCAGCCAACTTACGGGCAGATGATACTTTAACAGTTCCAACTGTAGGATCAATTATAACTACCACTCCACATGTGTTCCCATTTGAGGAAAGAGTTGAGATGTTCAGAGAGTTTGTCAAGATGGACAAAGTCTCCCGAAAAATGGCAGGTGAAATTGGTGGACCTGGGTCACGATCATTTGAAATTGTAGTTCGTCGTAGCCATGTTGTTGAAGACGGATTCAGACAGTTAAATTCTCTTGGGTCAAGACTGAAATCAGCTATCCATGTTTCATTTGTTAGTGAATGTGGCCTTCCTGAGGCTGGCCAAGACTGTGGTGGATTATCCAAAGAGTTTTTAACTGATATAGCCAAAGCAGCATTTTCGCCGGAATATGGACTGTTCACTCAAACCTCTACTCCAGACAGGCTTCTTATCCCCAATTCATCTGCAAGATATCTCGACAATGGTATTCAGATGATCGAATTTCTTGGTAGAGTTGTTGGGAAGGCTCTCTACGAAGGAATTTTGCTTGATTACTCATTTTCACATGTTTTTGTCCACAAGCTCTTAGGCCGTTATAGCTTCCTTGATGAGCTGTCAACTCTTGATCCAGAGCTCTACCGGAATCTCATGTACGTCAAGTCTTATGAGGGTGATGTCAAAGAACTCTCGCTGGATTTCACTGTTACTGAAGAATCATTTGGCAAACGACATGTTATTGAGCTTAAACATGGTGGCAAGGATGTTTCTGTTACAAAGGAGAATAAGATGCAGTATGTTCATGCCATTGCTGATTATAAACTTAATCGACAGATACTGCCTTTTTCAAACGCATTCTACAGGGGTTTAACTGATCTAATATCACCGTCTTGGTTGAAGTTGTTTAATGCAAGTGAATTCAATCAGTTGCTTTCAGGTGGAAACCATGACATTGATGTAGATGATTTGAGGAATAATACACGTTATACAGGAGGTTACACAGAGGGCAGCCGAACAATTAGTATTTTCTGGGAGGTTGTTAAAGGACTTGAACCAAAAGATCGTTGTTTGCTTCTTAAATTTGTCACCAGTTGTTCTCGAGCTCCATTACTTGGATTCAAATATCTGCAACCAGCTTTTACCATTCATAAGGTTTCATGTGACGTACCTATATGGGCTTCAATAGGAGGACAGGATGTCGAGCGGCTTCCAACAGCTTCCACTTGCTATAATACTCTCAAGCTCCCTACATATAAACGTTCGAGTACTTTGAGATCAAAACTTGTCTATGCGATCAATTCCAACTCAGGATTCGAACTTTCTTAA 3501 40.39 MDKASKHQVSLRGASAKEITRDALVQKVIQERELRQYARKAAAAALFIQRVWRRYRVTKIAALQLQEGWEELVKRHSGALAGTFISYNILRPFLFFISSFLKRPQSIQTRDLDCMKNCFKILFESINSTESKNNFCSFATGTSEERRMWTYQSRKLISVCLFILVHFDKLQAKEQEIVVTTSLAMRLIVVLTDHNGWKSVNENSRFDADAALKDLVHYLGTSESGLYLSVRKYMYKLSVLQSSRTTSSIQTKDLLVITVSAITLALRPFYLINFDAIGTTSWEGHYVAEQFCLLLLTIPGLVQNLPQVLVPAVKHRSILLPCFWTLLTKKETILLRMSGLDQLSVDCGSKVFPAVGWALANIISLVAGSETKARDSGWFKQSLDYVLYARVVVTLAESFLALIGDVGCGKKENQDIQSNETSYECSDAGVHKNEMASMSLSTSFIDMFRPICEQRHLTDLLTIVNTDVYSENRTAQSNNMESMKSLKLLDVSYFYMYMLKIFSLLNPLVGSLPVLNMLSFTPGFLVDLWGVLESSLFPSDANGAEDHFPGSSKVSSKNKDEVFGKKQKPVSKDGSSKWVTVFNKFTSKSQPGSDHVDTIEVQSRQGNGDLCDLWDIKSLSCGPQGISKDLSCLLYLFSATYAHLLLVLDDIEFYEKQVPFRLEQQRKLASMLNTLVYNGLSYGTGQQNTSLMESAIRCLLLIYERDCRHQFCPPTLWLSPARTSRPPVAIAARTHEALSANLRADDTLTVPTVGSIITTTPHVFPFEERVEMFREFVKMDKVSRKMAGEIGGPGSRSFEIVVRRSHVVEDGFRQLNSLGSRLKSAIHVSFVSECGLPEAGQDCGGLSKEFLTDIAKAAFSPEYGLFTQTSTPDRLLIPNSSARYLDNGIQMIEFLGRVVGKALYEGILLDYSFSHVFVHKLLGRYSFLDELSTLDPELYRNLMYVKSYEGDVKELSLDFTVTEESFGKRHVIELKHGGKDVSVTKENKMQYVHAIADYKLNRQILPFSNAFYRGLTDLISPSWLKLFNASEFNQLLSGGNHDIDVDDLRNNTRYTGGYTEGSRTISIFWEVVKGLEPKDRCLLLKFVTSCSRAPLLGFKYLQPAFTIHKVSCDVPIWASIGGQDVERLPTASTCYNTLKLPTYKRSSTLRSKLVYAINSNSGFELS 1166
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 3956172 3968368 - Hsped.05g03210.1 Hepe05g0321 569586
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Hepe03g0028 Hepe-Chr3:309202 Hepe05g0321 Hepe-Chr5:3956172 1.45e-94 dispersed
Hepe05g0321 Hepe-Chr5:3956172 Hepe10g0443 Hepe-Chr10:5006622 8.86e-52 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Hepe05g0321 K10588 - csv:101205886 2037.31