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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Hepe09g1050 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GTTCAATCCATCTGGGTTTGAGTGGCAGAAGACTGTGGAGGATTTCAGAGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGTGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGACTCAGAACTGGCACATATAAAGACCTTTGAAGGCCGGATAGCAGAGACTATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGCATTGTTTACAAGCTCAATGTGCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGTTCTCCTGGATTGTGTTAGCTGGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTTAGCCAGAAGATGACTGTCAATTTCCAGCTTTTGTTGCGTTTTATCCAAGGTCTTTCGTTCCTTTTGACGTTGGCTGGCCTGGCAGTTGCGGTTGCTATTACAGACTTGTCACTGCCTGATGTATTTGCTTGCATCTTGGCATTTCTACCTACAGGATGGGGCATTCTTTGTATTGCAGCAGCTTGGAAACCTGTGATAAAGAAACTGGGACTCTGGAAATCCATCCGCTCAATCGCTCGGCTGTATGATGCCGGGATGGGGATGCTTGTCTTTATCCCCATTGCATTTCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCGACATTCCAAACTCGTCTCATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGAGGGCTCGAGATCTCGCTAATTCTTGCTGGAAACAATCCCAACACTGCCCTATGA 5724 41.26 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1907
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
9 11079037 11157762 - Hsped.09g10500.1 Hepe09g1050 579734
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Hepe09g1050 1907 SMART FKS1_dom1_2 336 454 IPR026899 -
Hepe09g1050 1907 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 36 1901 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Hepe09g1050 1907 Gene3D - 33 190 IPR023175 -
Hepe09g1050 1907 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1030 1720 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
Hepe09g1050 1907 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 451 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Hepe09g1050 Hepe-Chr9:11079037 Hepe09g1054 Hepe-Chr9:11197411 0.0 proximal
Hepe09g0068 Hepe-Chr9:578070 Hepe09g1050 Hepe-Chr9:11079037 0.0 transposed
Hepe03g1706 Hepe-Chr3:73939087 Hepe09g1050 Hepe-Chr9:11079037 0.0 wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Hepe09g1050 K11000 - csv:101216435 3603.91