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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lsi05g00232 ATGGCTTCCCTCACTATTGGGATTCATTTGCCCCCATCCCATCATTGGAAGAGATTTTCACTTCAATCCCAGTCTCCCATTTCACTCCCATTTCACACTAGCTATGGTTCTTCGTTGAGTAGTGTCAGAACTCCAAGGTTGCTTGGTAAGAATCTTCTTGTGCGGGCTGAAGACGAAGATAAAAGCTCTTCACCAGCAACCTCTTCTTCGTTTGAGCAACAGCAAGCTCCACCCAACTTCACTAAAAAACTGGAGGAACTGTCATCCAAGTCAGGAACATGTGATCCCCTTTGCTCAGTTGACGAAATAAGTTCACAGGAATTTGCAGATAGTTACCAGCCAAAGACTGATTTAGTAAAGGCTTTTGCAATATTTGCAGCTGCCCTTACTGGAACAGTGGCAATTAATCACTCCTGGGTTGCTGCTAATCAGGATCTTGCTATGGTGTTGTTATTTGGTATAGGATATGCTGGAATCATTTTTGAAGAATCTCTTGCCTTCAACAAGAGTGGAGTGGGATTATTGATGGCGGTTGGCTTATGGGTTGTTCGAAGTATTGGGGCTCCATCCACTGAAATTGCTGCTTCAGAGCTAACACATGCCACAGCAGAAGTCAGTGAAATTGTATTTTTCTTACTTGGAGCGATGACCATTGTGGAGATTATCGACGCCCATCAAGGATTTAAATTGGTTACAGACAGTATAACGACTCGAAAACCACGAACTCTCCTCTGGGTGATTGGGTTTGTAACCTTTTTTCTAAGTTCAATCCTCGACAACCTGACGACCACAATTATCATGGTTTCTCTATTGCGAAAACTAGTTCCTCCATCAGAGTATCGCAAGCTACTTGGAGCTGTAATCGTTATAGCAGCAAATGCGGGTGGTGCGTGGACACCTATTGGAGATGTAACCACCACCATGCTATGGATACATGGTCAGATATCAACATTGCCGACACTCAAAGGCTTGATTATACCTTCAGCCGTTTCGCTTGCAGTACCGCTGGCCCTGCTGTCCCTTACAAGGTATAGGTTTTCATGTTTTTCTCTTCTTGGATTCAGTGAAGTTAATGGAAAGGGACAGGATTTTTCGAATGTTATGGCGTCGGAGCAGATGGCTCCTCGAGGAAAGCTTGTCTTCTCTGTAGGTGTTGGAGCTTTAGTTTTTGTTCCAGCGTTCAAAGCCCTCACAGGTTTGCCCCCCTACATGGGTATGCTGCTTGGTCTTGGAATTCTGTGGATTCTGACTGATGCTATTCACTATGGTGAATCGGAAAGGCAAAAGTTGAAAGTTCCTCAGGCTTTATCTCGTATCGATACGCAGGGAGCGTTATTTTTCCTTGGTATCCTTTTGTCCGTCAGCAGCTTAGAGGCTGCAGGGGTGTTACGCGAGTTAGCAAACTACCTTGATGCTCATATTCCAAATGCCGAACTCATTGCGAGTGCAGTCGGTGTTATATCAGCAATTATAGACAATGTACCATTAGTTGCAGCAACAATGGGAATGTATGACCTCTCCTCTTTCGCTCAAGATTCCGAGTTCTGGCAGCTAATTGCATTTTGTGCTGGCACTGGTGGATCCATGCTTATAATTGGATCTGCAGCTGGAGTTGCATTCATGGGGATGGAGAAGGTGGACTTCTTTTGGTACTTAAGAAAGGTTAGCGGTTTCGCTTTTGCGGGATATGCTGCTGGAATTGCTGCCTATTTAGCTCTTCATAACCTCAACATATCGCTACCTACAACTATTGCTGATGTGCCTTCCATTTTGGGTTCATAA 1782 44.5 MASLTIGIHLPPSHHWKRFSLQSQSPISLPFHTSYGSSLSSVRTPRLLGKNLLVRAEDEDKSSSPATSSSFEQQQAPPNFTKKLEELSSKSGTCDPLCSVDEISSQEFADSYQPKTDLVKAFAIFAAALTGTVAINHSWVAANQDLAMVLLFGIGYAGIIFEESLAFNKSGVGLLMAVGLWVVRSIGAPSTEIAASELTHATAEVSEIVFFLLGAMTIVEIIDAHQGFKLVTDSITTRKPRTLLWVIGFVTFFLSSILDNLTTTIIMVSLLRKLVPPSEYRKLLGAVIVIAANAGGAWTPIGDVTTTMLWIHGQISTLPTLKGLIIPSAVSLAVPLALLSLTRYRFSCFSLLGFSEVNGKGQDFSNVMASEQMAPRGKLVFSVGVGALVFVPAFKALTGLPPYMGMLLGLGILWILTDAIHYGESERQKLKVPQALSRIDTQGALFFLGILLSVSSLEAAGVLRELANYLDAHIPNAELIASAVGVISAIIDNVPLVAATMGMYDLSSFAQDSEFWQLIAFCAGTGGSMLIIGSAAGVAFMGMEKVDFFWYLRKVSGFAFAGYAAGIAAYLALHNLNISLPTTIADVPSILGS 593
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 3089224 3096626 + Lsi05G002320.1 Lsi05g00232 662724
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lsi05g00232 593 Pfam Citrate transporter 157 524 IPR004680 GO:0016021|GO:0055085
Lsi05g00232 593 PANTHER BNAC03G40960D PROTEIN 1 593 - -
Lsi05g00232 593 PANTHER SODIUM/PROTON ANTIPORTER 1-RELATED 1 593 IPR045016 GO:0006814|GO:0015297
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lsi05g00232 - - bhj:120072213 1027.7