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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mch6g0082 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TTTTGCTCCTTATATCTTTAATCCATCTGGTTTTGAATGGCAAAAGACTGTGGAGGATTTTGACGATTGGACCAGCTGGCTATTCTACAAAGGGGGAGTTGGGGTGAAGGGAGAAAACAGCTGGGAGTCATGGTGGGATGAAGAACAGGCACATATTCAAACATTGCGAGGTCGGATATTGGAGACGATTTTGACTCTGAGGTTCTTTATATTTCAATATGGCGTTGTGTACAAACTCCATCTCACAGGAAATGATACATCACTTGCGTTATATGGTTTCTCGTGGGTGGTGCTCGTTGGGATTGTTTTGATATTTAAGATCTTCACCTTCAGTCCTAAAAAATCGACAAACTTCCAGCTATTTATGAGATTTATTCAGGGTGTCACAGCCATAGCTCTGGTTACAGCCCTTGGTCTAATTGTTGGCTTTACTCGCCTGTCAATAATTGACTTATTTGCAAGTGTTTTGGCGTTTATTCCTACTGGATGGGCCATATTAAGCTTTGCAGTTACTTGGAAGAAAATAGTTAGGAGTCTAGGCTTGTGGGATTCAGTTCGTGAATTTGCCAGGATGTATGATGCTGGGATGGGTTTAATTATATTCGTCCCGATTGCATTCTTATCCTGGTTCCCATTCATTTCCACGTTCCAATCTCGTCTGCTCTTCAACCAAGCTTTCAGCCGTGGGCTCGAGATCTCGCTCATCCTTGCAGGAAACAAAGCTAACGTCGAGACGTAG 5739 41.91 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1912
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 490200 532230 - MC06g0074 Mch6g0082 689529
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mch6g0082 1912 Gene3D - 36 159 IPR023175 -
Mch6g0082 1912 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 40 1907 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Mch6g0082 1912 SMART FKS1_dom1_2 348 461 IPR026899 -
Mch6g0082 1912 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1031 1729 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
Mch6g0082 1912 Coils Coil 156 186 - -
Mch6g0082 1912 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 350 458 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Mch6g0082 Mch-Chr6:490200 Mch6g1086 Mch-Chr6:7832838 0 dispersed
Mch6g0082 Mch-Chr6:490200 Mch6g1093 Mch-Chr6:7941845 0 transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mch6g0082 K11000 - csv:101217890 3564.62