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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mch6g1086 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GTGGCAAAAGACTGTAGAGGATTTTAAAGAATGGACCAATTGGCTTTTTTACCGAGGTGGAATTGGTGTTAAGGGTGAAGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGACTCGGAACTGGCACACATAAAAACAATTGAAGGGCGGATAGCAGAGACTATTTTAAATCTAAGATTTTTTATTTTTCAATATGGCATTGTTTACAAGCTCCATTTGCAAGGATCAAACACATCATTGTCGGTATATGGGCTCTCCTGGGCTGTGCTCGCTGGGCTTATAGTTCTTTTCAAGGTGTTTACCTTTAGCCAGAAGATGACGGTCAACTTCCAGCTTTTGTTGCGGTTCATCCAAGGTCTTTCTTTCCTATTGGCGTTGGCTGGCTTGGCAGTTGCGGTTGCTATTACAGACTTGTCACTGCCTGATGTATTTGCTTGTGTCTTGGCGTTTATACCTACAGGATGGGCCATTCTTTCTATTGCTGCAGCTTGGAAACCTTTGGTAAAGAAACTGGGACTGTGGAAATCCATCCGCTCTCTTGCTCGGCTGTATGATGCCGGGATGGGGATGCTTATCTTTGTCCCCATTGCATTGCTTTCATGGTTTCCATTTGTATCAACGTTCCAAACTCGTCTCATGTTCAACCAGGCTTTCAGTCGGGGGTTGGAGATCTCACTAATCCTTGCTGGAAACAACCCCAACACTGCCCTATGA 5703 40.96 MTRVEELWERLVRAALRRDRIGIDAYGRPESGIAGNVPSSLANNRDIDEILRAADEIQDEDPNVSRILCEHAYSLAQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREGGTIDRSQDTTRLQEFYKLYRERNNVDKLREDEMKLRESGAFSGNLGELERKTLRRKKVFATLKVLAMVLEQLGDAIPEEMKRLMESDAAMTEDLIAYNIIPLDSPSMTNAIGSLIEVKAAVSALKYFSGLSRLPAEFSVPETRSPDILDFLHFVFGFQKDNVSNQREHVVHLLANEQSRLRILEETEPKLDEAAVEGVFKKSLENYIKWCEYLCIQPVWSSLAAVSKEKKLLFISLYFLIWGEASNVRFLPECLCYIFHHMVREMDEILRQPIAQPANSCKSKDGVSFLDQVICPLYEVLAAEAANNNGGRAPHSAWRNYDDFNEYFWSLRCFDLSWPWNKGKSFFQKPAPKPKVVYFLKTSFVEHRTFLHLYHSFHRLWIFLVMMFQALTIIAFNNGTFNKKTLLEVLSLGPTFVVMKFIESVLDIIMMYGAYSTSRRLAVSRIFLRFIWFSIASASVTFLYVKALQEGSKPTPEKVMFRLYVIVIGIYGGVQLFLSILMRIPACHLLTNQCDRWPLVRFIKWMRQERYYVGRGMYERTTDFIKYMLLWLIILGAKFSFAYFLQIRPLVGPTKVIVKMRGITYSWHDFVSKNNHNALTILSLWAPVVAIYILDVHVFYTVISSIWSFLLGARDRLGEIRSLEALHKLFEQFPGAFMHTLHVPLTNRFGNSNHSPMQVIEKDKFDAARFSPFWNEIIARLRKEDYITNLEMELLQMPKNKGNLPLVQWPLFLLASKIFLAKDIAVERRDLQDELWERVSRDEYMKYAVQECYHAIKLILTELLVGEGRMWVERIFEDLQGSITKKSIIEDFQLNKLPLVITRITALMGILVRIVKTPELEKGAVKAVQDLYDVVHHDILFGDKRGHYETWNILIKARNEGRLFTKLNWPKDPELKSQVKRLHSLLTIKDSASNIPVNLEARRRLEFFTNSLFMAMPTPKPVRQMLSFSVFTPYYSETVLYSMGELLKKNEDGISTLFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENEVDPELFDNPNDILALRFWASYRGQTLARTVRGMMYYRKALMLQTYLERGTDGDLEAAIPCTENIDTQGFDLSPEARAQADLKFTYVVTCQIYGKQREQQKPEASDIALLMQRNEALRVAYIDDIETLKDGKVHKEFYSKLVKADINGKDKEIYSIKLPGDPKLGEGKPENQNHAIVFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFGSDHGIRSPTILGVREHVFTGSVSSLASFMSNQEASFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRIFHLTRGGISKASRVINISEDIFAGFNTTLRQGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVAGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYIFLYGKAYLALSGVGETIEDRAHITDNTALSAALNTQFLIQIGIFTAVPMILGFILEQGFFRAIVSFITMQLQLCSVFFTFSLGTKTHYFGRTILHGGAKYHATGRGFVVRHIKFSENYRLYSRSHFIKGLEVVLLLVVYMAYGYNSGGSLAYILVTLSSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKTVEDFKEWTNWLFYRGGIGVKGEESWEAWWDSELAHIKTIEGRIAETILNLRFFIFQYGIVYKLHLQGSNTSLSVYGLSWAVLAGLIVLFKVFTFSQKMTVNFQLLLRFIQGLSFLLALAGLAVAVAITDLSLPDVFACVLAFIPTGWAILSIAAAWKPLVKKLGLWKSIRSLARLYDAGMGMLIFVPIALLSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTAL 1899
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
6 7832838 7908558 - MC06g0928 Mch6g1086 690533
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mch6g1086 1899 Gene3D - 33 189 IPR023175 -
Mch6g1086 1899 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 36 1893 - GO:0005886(PANTHER)|GO:0046527(PANTHER)
Mch6g1086 1899 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
Mch6g1086 1899 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
Mch6g1086 1899 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1022 1712 IPR003440 GO:0000148(InterPro)|GO:0003843(InterPro)|GO:0006075(InterPro)|GO:0016020(InterPro)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Mch6g0082 Mch-Chr6:490200 Mch6g1086 Mch-Chr6:7832838 0 dispersed
Mch6g1086 Mch-Chr6:7832838 Mch9g0508 Mch-Chr9:3746914 0 dispersed
Mch6g1086 Mch-Chr6:7832838 Mch6g1093 Mch-Chr6:7941845 0 proximal
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mch6g1086 K11000 - csv:101216435 3522.25