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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sed01g2702 ATGGAATGGGCTCTATCGCTTCTATTAAACAATCCACAAACTTTAAAAAAAGCCCAACTCGAAATCGACGATCAAGTAGGCCACGACCGTCTGATTGACGAGTCCGACATGGCCCACCCTCCCTACCTACGTGGCATCATCAACGAGACTCTACGTATGTACCTCCCAGCCCCGTTGTTGGTCCCACATGAGTCATCTGAAGACTGCTTTGTTGGAGGCTACCGTGTTCCACGTGGCACTATGTTACACATCAATGACTGGGCAATTTGGGTTCATCCGAGAAGCTTTGACCCGGATAGGTTCGACCGGTTGGAAAGTGAAAATTACCGGTTCAGTTTGATGCCGTTTGGGCTTGGGAGGAGGGGCTGCCCAGGAGAAGGGCTGGGCCTGCGAATGGTTGGGCTTGTATTGGGCTCGTTGATTCAGTGCTTTGAATGGGAGCGTCCTACTCCGGAGTTGGTGGATATGACTGAAGGCCTTGCTGTTACTATGCCCAAAGCCCAAAACTTGCATGCTAAATGCAGGCCCAGGCCCATAATTGCCAAGCTTCTCTCACACATCTAA 564 50.89 MEWALSLLLNNPQTLKKAQLEIDDQVGHDRLIDESDMAHPPYLRGIINETLRMYLPAPLLVPHESSEDCFVGGYRVPRGTMLHINDWAIWVHPRSFDPDRFDRLESENYRFSLMPFGLGRRGCPGEGLGLRMVGLVLGSLIQCFEWERPTPELVDMTEGLAVTMPKAQNLHAKCRPRPIIAKLLSHI 187
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
1 21669264 21669827 + Sed0010136.1 Sed01g2702 702006
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sed01g2702 187 Gene3D Cytochrome P450 1 179 IPR036396 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PANTHER CYTOCHROME P450 82C3-RELATED 1 177 IPR050651 -
Sed01g2702 187 PRINTS E-class P450 group I signature 1 27 IPR002401 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS E-class P450 group I signature 44 62 IPR002401 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS E-class P450 group I signature 113 123 IPR002401 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS E-class P450 group I signature 79 103 IPR002401 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS E-class P450 group I signature 123 146 IPR002401 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS P450 superfamily signature 10 23 IPR001128 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS P450 superfamily signature 123 134 IPR001128 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS P450 superfamily signature 45 56 IPR001128 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 PRINTS P450 superfamily signature 114 123 IPR001128 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 SUPERFAMILY Cytochrome P450 1 177 IPR036396 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 Pfam Cytochrome P450 1 166 IPR001128 GO:0004497(InterPro)|GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)|GO:0020037(InterPro)
Sed01g2702 187 ProSitePatterns Cytochrome P450 cysteine heme-iron ligand signature. 116 125 IPR017972 GO:0005506(InterPro)|GO:0016705(InterPro)
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Sed01g2702 Sed-Chr1:21669264 Sed13g1793 Sed-Chr13:22975412 2.20E-77 dispersed
Sed01g2701 Sed-Chr1:21657670 Sed01g2702 Sed-Chr1:21669264 1.40E-76 tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sed01g2702 - - - 0.0