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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sed12g2041 ATGGCTTCCCTTCCTTCCCCTCCCACCATTAACACCCATCTCCACAAAACCCTCATTCCATCGAACCCTAAATCTCTCTTCGCCTCAACTCCTTCGAAGCCTCTCCGCTCCCATGGCGTTCGCTGTTCTGTTGCAATGGCGCCTTCTGCTTCGACCATGGCGTCCAGGGAATTCAAGTTGAAATCCCTCAAGGCCCGCCAGATCATCGACAGCAGAGGCAATCCCACGGTTGAGGTTGATTTGATCACCGATGATCTCTTCCGATCCGCTGTTCCCAGTGGGGCTTCCACTGGGATCTATGAGGCTTTGGAGCTTAGAGATGGGGATTTCAGCGTTTATGGAGGTAAAGGCGTGCTTACTGCTGTCAACAACATTAATGAAATCTTGGCTCCCAAGCTCGTCGGCGTCGATGTCAGAAATCAAAAGGATGTTGATGCAATTATGCTGGAAATTGATGGCACCACAAACAAGTCGAAACTTGGAGCAAATGCTATACTGGGAGTTTCTTTGAGCGTATGCAGAGCCGGCGCTGGCGCCAAGGGACTACCATTATACAGGCACATACAAGAATTATCAGACACAAAGGAACTTGTTATGCCAGTCCCTGCTTTTAATGTTATTAATGGTGGCAGCCATGCTGGAAATAATCTAGCCATGCAAGAATTTATGATCTTACCAGTAGGTGCTGCATCTTTTGCTGAGGCACTTCGCATGGGAAGTGAAGTTTATCACATACTGAAGGGAATTATTAAAGCAAAATATGGTCAAGATGCCTGCAATGTTGGAGATGAGGGTGGATTTGCTCCAAATGTTCAAGATAACAGAGAGGGGCTGGTGTTGCTTATTGATGCCATTGAAAAGGCTGGTTATACAGGAAAGATCAAAATAGGAATGGATGTAGCAGCTTCAGAGTTTTTCACCAAAGATGGAAAATATGATCTGAACTTCAAGAAACAGCCTAATGATGGAGCTCATGTTCACTCAGCTCATGGCCTCGGCGAACTCTATGAACAGTTTGTCAAAGATTTTCCGATTGTTTCCATCGAGGACCCCTTCGACCAAGATGATTGGAGCTCGTGGGCATCCCTACAATCTTCTGTTGATATTCAACTTGTGGGAGATGACTTGCTGGTAACAAATCCAAAGAGAATTGCTGAAGCCATCAAGAAGAAGGCTTGTAATGCTTTACTTCTGAAGGTTAACCAGATTGGATCAGTGACTGAATCAATCCAAGCTGCTCTTGATTCAAAGGCTGCTGGTTGGGGTGTGATGGTTAGCCACAGAAGTGGTGAAACTGAAGACAATTTTATTGCCGACCTTTCTGTTGGCTTAGCTAGTGGACAGATCAAAACTGGAGCTCCATGTCGCAGCGAACGGTTAGCCAAATATAATCAGCTTCTTCGTATTGAAGAAGAGCTCGGCAATGTTCGCTATGCCGGGGAGTCTTTCAGATCACCATAG 1461 45.93 MASLPSPPTINTHLHKTLIPSNPKSLFASTPSKPLRSHGVRCSVAMAPSASTMASREFKLKSLKARQIIDSRGNPTVEVDLITDDLFRSAVPSGASTGIYEALELRDGDFSVYGGKGVLTAVNNINEILAPKLVGVDVRNQKDVDAIMLEIDGTTNKSKLGANAILGVSLSVCRAGAGAKGLPLYRHIQELSDTKELVMPVPAFNVINGGSHAGNNLAMQEFMILPVGAASFAEALRMGSEVYHILKGIIKAKYGQDACNVGDEGGFAPNVQDNREGLVLLIDAIEKAGYTGKIKIGMDVAASEFFTKDGKYDLNFKKQPNDGAHVHSAHGLGELYEQFVKDFPIVSIEDPFDQDDWSSWASLQSSVDIQLVGDDLLVTNPKRIAEAIKKKACNALLLKVNQIGSVTESIQAALDSKAAGWGVMVSHRSGETEDNFIADLSVGLASGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGNVRYAGESFRSP 486
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
12 31258027 31262292 - Sed0009727.1 Sed12g2041 732997

Annotation

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sed12g2041 486 SMART Enolase_N_3 60 188 IPR020811 -
Sed12g2041 486 CDD enolase 62 472 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 NCBIfam phosphopyruvate hydratase 61 482 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 Hamap Enolase [eno]. 58 473 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 FunFam Enolase 58 181 - -
Sed12g2041 486 Pfam Enolase, C-terminal TIM barrel domain 197 484 IPR020810 -
Sed12g2041 486 PANTHER ENOLASE 59 484 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000015(PANTHER)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0004634(PANTHER)|GO:0006096(PANTHER)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 Gene3D - 54 181 IPR029017 -
Sed12g2041 486 SMART Enolase_C_3 196 486 IPR020810 -
Sed12g2041 486 SUPERFAMILY Enolase C-terminal domain-like 196 481 IPR036849 -
Sed12g2041 486 SUPERFAMILY Enolase N-terminal domain-like 60 191 IPR029017 -
Sed12g2041 486 ProSitePatterns Enolase signature. 396 409 IPR020809 -
Sed12g2041 486 SFLD enolase 61 473 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 Gene3D - 182 486 IPR036849 -
Sed12g2041 486 PRINTS Enolase signature 161 177 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 PRINTS Enolase signature 218 231 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 PRINTS Enolase signature 425 442 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 PRINTS Enolase signature 91 105 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 PRINTS Enolase signature 373 384 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 PRINTS Enolase signature 396 410 IPR000941 GO:0000015(InterPro)|GO:0000287(InterPro)|GO:0004634(InterPro)|GO:0006096(InterPro)
Sed12g2041 486 FunFam Enolase 1 182 486 - -
Sed12g2041 486 SFLD enolase 61 473 - -
Sed12g2041 486 Pfam Enolase, N-terminal domain 61 188 IPR020811 -
       

Pathway

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sed12g2041 K01689 - - csv:101209516 861.677
       

Dupl-types

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Sed12g2041 Sed-Chr12:31258027 Sed14g0335 Sed-Chr14:3415495 3.00E-163 dispersed
Sed12g2041 Sed-Chr12:31258027 Sed10g1107 Sed-Chr10:12170038 3.60E-164 transposed
       

Deco-Alignment

Select Vvi1 Blo1 Blo2 Bda1 Bda2 Bpe1 Bpe2 Bma1 Bma2 Cmo1 Cmo2 Cma1 Cma2 Car1 Car2 Sed1 Cpe1 Cpe2 Bhi1 Tan1 Cmetu1 Lac1 Hepe1 Mch1 Lcy1 Cla1 Cam1 Cec1 Cco1 Clacu1 Cmu1 Cre1 Cone1 Cone2 Cone3 Cone4 Lsi1 Csa1 Chy1 Cme1 Blo3 Blo4 Bda3 Bda4 Bpe3 Bpe4 Bma3 Bma4 Sed2 Cmo3 Cmo4 Cma3 Cma4 Car3 Car4 Cpe3 Cpe4 Bhi2 Tan2 Cmetu2 Lac2 Hepe2 Mch2 Lcy2 Cla2 Cam2 Cec2 Cco2 Clacu2 Cmu2 Cre2 Lsi2 Csa2 Chy2 Cme2
Vvi17g393 . . . . . . . . . . . . . Car11g00221 Sed12g2041 . Cpe04g01430 Bhi02g00032 Tan09g1975 Cmetu02g0279 . Hepe09g0308 . . Cla06g01505 Cam06g1660 Cec06g1722 Cco06g1717 Clacu06g1626 Cmu06g1575 Cre06g2385 . . Cone13ag0013 Cone19ag0011 . . . . . . . Bda14g00902 . Bpe15g00556 Bma03g00876 . . . Cmo11g00246 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lsi06g01369 Csa01g00309 Chy02g02429 Cme02g01786
       

Syn-Orthogroups

Select Orthogroup Bda Bhi Blo Bma Bpe Cam Car Cco Cec Chy Cla Clacu Cma Cme Cmetu Cmo Cmu Cone Cpe Cre Csa HCH Hepe Lac Lcy Lsi Mch Sed Tan Vvi Total
OG0011033 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30